
270K 甲基化芯片
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- 270K 甲基化芯片
- 2025年08月14日
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- 规格:
每例样本
InfiniumTM Methylation Screening Array-48 芯片,简称“270K甲基化芯片”。
用于群体表观基因组学研究的高通量甲基化分析
• 重点覆盖与常见人类特征、疾病表型、环境暴露、衰老等内容相关的 27 万个独特甲基化位点
• 一张芯片容纳 48 个样本的芯片,在 iScanTM 芯片扫描仪上进行扫描,每年可处理多达 60 万个样本
• 可靠的甲基化数据,样本间可重现性超过 98%
用于甲基化研究的高通量芯片
270K 甲基化芯片旨在采用专家精选内容对群体队列开展大规模表观遗传分析,涵盖已知和预测的表观遗传关联。该芯片基于 48 个样本的 EX Methylation 平台,旨在打造更具可扩展性且价格实惠的 Infinium 甲基化芯片,提供可靠、准确的甲基化数据及简化分析。
专家选择的群体健康 EWAS 的位点
270K 甲基化芯片具有 27 万个甲基化位点,专注于与一系列常见细胞和生物体特征相关的 CpG 区域,例如细胞特性、非恶性疾病表型和环境暴露。之所以选择 Beadchip 内容,是因为其结合了 Infinium 甲基化研究、功能基因组学测序研究和基因组学数据库,具有强大的已明确的性状关联。
表 1: 270K甲基化芯片规格
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Infinium Methylation Screening Array 用于群体健康研究的靶向甲基化筛查 |
| 推荐应用 |
• 常见疾病研究(非癌症) • 环境流行病学 • 群体基因组学 • 消费者基因组学 |
| 关注内容 |
• 已知的常见疾病特征关联 • 已知的环境暴露关联 • 细胞类型特异性甲基化 • 中间甲基化 • 检测高 MAF SNP 的多组学能力 |
| 独特甲基化位点总数 |
269,094 |
| 每个 BeadChip 芯片的样本数 |
48 |
| DNA 起始量要求 |
50 ng |
| 检测技术 |
Infinium EX Methylation |
| 测序仪兼容性 |
iScan芯片扫描仪 |
| iScan 系统最大样本通量 |
16,128 个样本 / 周 |
| 液体处理自动化 |
Infinium 自动移液系统,带 ILASS(必备) |
270K 甲基化芯片的专注设计和更高的样本通量让研究人员能够将 DNA 甲基化筛查应用于大型群体健康项目,发现有意义的疾病靶点。
270K 甲基化芯片的已知关联
270K 甲基化芯片上约 50% 的位点来自于对已发布数据、科学文献和 Infinium 甲基化芯片的分析,这些位点旨在发现 CpG 甲基化与不同性状或疾病的关联。根据样本数量、统计可靠性和科学影响,审核和筛选了 1000 多项 EWAS 研究。优先使用最具统计显著性和效应的探针并平衡选择,对各种性状和疾病做出最充分的描述。所选内容与多种生物类别相关,包括心血管、代谢、神经退行性 / 精神疾病、自身免疫、呼吸系统、生殖、肾脏、衰老、遗传、环境暴露以及感染相关特征和疾病。还包括先前和现有 Infinium BeadChip 平台的表观遗传时钟和细胞反卷积 panel,为 EWAS 研究中的细胞类型估计和表型预测的既定预测因子提供向下兼容。
表 2: 先前在 Infinium Methylation Screening Array 上已验证的性状相关内容
| 性状类别 |
靶向性状关联的探针数量 |
| 发育 / 衰老 |
102,533 |
| 环境暴露 |
44,043 |
| 炎症 / 自身免疫性疾病 |
41,894 |
| 祖源 |
31,843 |
| 性别 |
23,806 |
| 传染性疾病 |
14,844 |
| 代谢疾病 |
13,739 |
| 罕见遗传病 |
13,429 |
| 神经 / 神经发育疾病 |
8874 |
| 身体特征(身体形态) |
8109 |
| 精神障碍 |
7280 |
| 心血管疾病 |
7007 |
| 生殖生物学 / 健康 |
6999 |
| 神经退行性疾病 |
4733 |
| 肺 / 呼吸道疾病 |
1748 |
| 肾脏疾病 |
982 |
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, 2001, 47(7): 1183-9.[38]Eads C A, Danenberg K D, Kawakami K, et al. MethyLight: a highthroughput assay to measure DNA methylation [J]. Nucleic Acids Res, 2000, 28: E32.[39]范保星. DNA甲基化检测方法 [J]. 国外医学遗传学分册, 2002, 25(2): 99-101. [40]Yan P S, Chen C M, Shi H
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