微生物多样性扩增子测序

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用

作用机理的理解，继人类基因组计划之后，科学家们又启动了人类元基因组计划，这使肠道菌群的研究迎来了一个新的浪潮。 在以往的肠道微生物群落多样性研究中，人们主要采用DGGE等分子生物学方法及生物芯片对肠道菌群进行研究，但是这些方法都存在一定的缺陷。如DGGE只能检测到环境样品中十几种优势菌，但是对痕量微生物却束手无策；电泳条带中包含不只一种16S rDNA序列，要获悉具体的菌种信息，还需进行克隆、测序，实验操作繁琐；此外，采用这种方法不能反映微生物的丰度情况。而生物芯片通过固定在芯片上的探针来获得微生物多样性

454高通量测序-研究土壤微生物的新手段

了土壤的质量。土壤微生物多样性一般包括微生物分类群的多样性、遗传(基因) 多样性、生态特征多样性和功能多样性[3 ]。由于土壤微生物的复杂性、土壤本身的多变性和研究方法不完善等原因的限制, 以往人们对土壤微生物多样性的研究与动、植物相比远远落后。随着多聚酶链反应(PCR)、核酸测序等现代生物学分子生物学技术的迅速发展, 人们对土壤微生物多样性有了更多的了解；高通量测序技术的发展则为研究土壤宏基因组提供了大量数据，为直接探究土壤中的微生物群落结构提供了客观而全面的信息。 一、对土壤微生物进行

高纤维植物饮食 vs. 发酵食物饮食，哪种饮食方式更健康？Cell 最新研究告诉你答案

措施，饮食引起的微生物群变化可能比其对免疫系统反应的影响更加稳定且一致。由于预测模型揭示了参与者的多方面饮食特异性反应，作者希望更加深入地研究每种饮食具体如何影响宿主微生物群。对此，作者评估了高纤维饮食组的微生物群组成、多样性、功能和微生物发酵产物的变化。基于对小鼠和人类的干预研究以及高纤维饮食与微生物群多样性增加之间的长期关联研究，作者假设增加膳食纤维摄入会导致微生物群多样性增加。然而，扩增子序列变异（ASV）、Shannon 多样性或系统发育多样性的 alpha 多样性在干预过程中并未发生明显