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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
37
- 保质期:
24 个月
- 供应商:
上海西格
- 保存条件:
-20℃
- 规格:
100Tx25μl
描述:该制品为全体系冻干微球制品,包含了 HotStartBst4.2 DNA/RNA 聚合酶、Helicaser、dNTP、Mg2+、反应缓冲盐、红黄指示剂,单球扩增体系为 25ul。
Bst4.2 具有以下性能:
(1)Bst 4.2 全系包含热启动Aptamer,该配体确保酶在<30℃时,酶活封闭效率>95%,在>60℃时 1min 内完全释放酶活。该特性利于室温建立反应体系,并大幅降低了低温条件下的非特异扩增;
(2)反应温度提升到 70℃,大幅降低引物 Dimer 的形成,提高扩增特异性,并使得粗样品核酸释放更加充分;
(3)全系包含 Helicaser,因此,允许在不使用 F3/B3 引物的情况下进行 LAMP 扩增(easy LAMP),并允许 FIP/BIP 的引物用量降低一倍。这将进一步降低非特异扩增,并使得扩增均一性大幅提升。LAMP 在反应时,会大量的消耗 dNTP,其副产物会导致指示染料由红色变为黄色,通过肉眼即可判读结果。
储存:-20℃干燥密封保存 24 个月;室温(25℃)密封保存 12 个月。避免受潮。
特殊说明:
(1) Bst4.2 DNA/RNA Polymerase 在用于 LAMP 扩增时的推荐反应温度为 65-70℃,最佳反应温度为 70℃。因此其可完全替代 的Bst4.0 系列,用于标准 LAMP的扩增。
(2) 由于 Helicaser 的反应温度为 70℃,因此在进行eLAMP 扩增时,反应温度为 70℃。
(3)制品中包含高浓度的盐组分,使用时做好个人防护,防止制品与皮肤、眼、鼻、呼吸道等接触和吸入,一旦接触或吸入,请用大量的清水冲洗。
(4)防止气溶胶污染,尽可能进行分区操作。
1. 标准 LAMP 和 eLAMP 扩增的区别本试剂既可以用于标准 LAMP 扩增,也可以用于 eLAMP扩增。
1.1 10x 标准 LAMP Primer MixFIP/BIP=16 μM each; LF/LB=4 μM each; F3/B3=2 μM each
1.2 10xeLAMP Primer MixFIP/BIP=8uM each; LF/LB=4 uM each
注意:eLAMP(easy LAMP)为去除 F3/B3 引物的方法,为 Bst4.2 系列专用的使用策略,对于大多数引物组,在Helicaser 的加持下,扩增速度几乎不受影响。如引物扩效率低,可提高 FIP/BIP 浓度到 12~16 μM。
1.3 扩增温度不同标准 LAMP 扩增 eLAMP 扩增65-70°C 均可 70°C 反应
2. 配制 LAMP 反应体系HotStart Bst 4.2 Red Bead 1 个10x Primer Mix 2.5 μl
模板 DNA/RNA X μlddH2O 到总体积 25 μl反应体系配好后,置于 65-70°C 反应 20~30min,反应完毕后观察颜色,红色为阴性,黄色为阳性扩增。
| 货号 | 产品名称 | 规格 |
| XG-P2965 | HotStart Bst 4.2 Red Bead(红黄变色冻干球) | 100Tx25μl |
PCR反应条件优化:
1、变性温度和时间:
HotStart Bst 4.2 Red Bead(红黄变色冻干球)保证模板DNA解链完全是保证整个PCR扩增成功的关键。加热90~95°C, 30~60s,再复杂的DNA 分子也可变性为单链。温度过高或高温持续时间过长,可对Taq酶活性和dNTP分子造成损害。
2、复性温度和时间:
PCR扩增特异性取决于复性过程中引物与模板的结合。复性温度越高,产物特异性越高。复性温度越低,产物特异性越低。需根据引物的Tm值具体设定。
3、延伸温度和时间:
一般位于Taq酶最适作用温度70~75°C之间。引物小于16个核苷酸时,过高的延伸温度不利于引物与模板的结合,可以缓慢升温到70~75°C。延伸反应时间,可根据待扩增片段的长度而定,小于1kb, 1min足够;大于1kb需加长延伸时间。Taq酶可根据1kb/min增加时间。这里需要注意,延伸时间过长可能出现非特异扩增。因此需要设置恰到好处的延伸时间。
4、循环数:
其他参数选定后,PCR循环次数主要取决于模板DNA的浓度。理论上说20〜25次循环后,PCR产物的积累即可达到最大值,实际操作中由于每步反应的产率不可能达到100%,因此不管模板浓度是多少,20~30次是比较合理的循环次数。循环次数越多,非特异扩增增加。
PCR的特点:
特异性强:使用两对引物进行扩增提高了特异性,第一轮PCR中由外引物错配产生非特异性产物,同时在第二轮PCR中内引物与错误片段配对扩增的概率极低,降低了扩增多个靶位点的可能性。
灵敏度高:进行两轮PCR扩增,可以执行更多的循环,从低拷贝样本中扩增得到足量的产物,克服了单次扩增平台期限制,提高PCR的灵敏度。
降落PCR与温度梯度PCR的区别:
降落PCR与温度梯度PCR都是对反应体系中的退火温度进行优化,但两者在原理上有所不同。
温度梯度PCR是为了找到最适的退火温度,设置不同的退火温度进行多管PCR,将其分别放置在PCR仪中的不同温度模块进行反应,最终找到最适的退火温度,并进一步以此退火温度进行普通PCR扩增。
降落PCR是为了提高反应的特异性,通过设计一系列不断降低的退火温度,在同一PCR管内进行PCR扩增,最终获得大量的特异性扩增产物。
与温度梯度PCR相比,降落PCR更有优势。温度梯度PCR需要多次反应或多管反应找到最适的退火温度,之后还需以找到的最适退火温度再次进行PCR,才能得到较好的扩增效果,操作比较繁琐。降落PCR只需一次反应就可以获得很好的扩增效果,避免了对每对引物进行最适退火温度的优化和测定工作。
降落PCR适用于不确定引物的最适Tm值,或引物扩增效果不佳时,不了解目的模板同源性程度,使用降落PCR可以快速、特异的得到目的扩增片段。根据不同实验的需要,降落PCR还可与其它PCR方法同时使用,如实时定量降落PCR、竞争降落PCR等。
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文献和实验Assay (Invitrogen) as suggested by Illumina. Illumina Bead Array MicroRNA Detection Starting with 500 ng/sample of total RNA, mature microRNAs were amplified with the Illumina human v1 MicroRNA expression profiling kit containing primers for 743
红 黄 0.2-1.8 间苯甲酚紫(酸范围) m-Cresol purple (acid range) 水,含 2.72mL 0.1mol/LNaOH 红 黄
/ul) q.s. sterile ddH2O 12ul[alpha]-32-P-dATP (PB 10384) and [alpha]-35-S-dATP (SJ 1304) from Amersham.Dilute the Bst polymerase (BioRad 170-3406) in Bst dilution buffer.2. Incubate the reactions for 2 minutes at 67degC, and briefly centrifuge
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