双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)
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双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)

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  • ¥1985 - 217082
  • 翌圣生物(Yeasen)已认证
  • 12308ES
  • 上海
  • 2025年10月16日
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    • 英文名

      Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit

    • 保质期

      一年

    • 供应商

      翌圣生物科技(上海)股份有限公司

    • 保存条件

      -20度

    • 规格

      8 T(12308ES08)/24 T(12308ES24)/96 T(12308ES96)/1000 T(12308ES98)

    规格:8 T(12308ES08)产品价格:¥1985.00
    规格:24 T(12308ES24)产品价格:¥5335.00
    规格:96 T(12308ES96)产品价格:¥19205.00
    规格:1000 T(12308ES98)产品价格:¥217082.00

     
    Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit是兼容Illumina和MGI双平台的total RNA测序文库构建试剂盒,包含RNA片段化试剂,反转录试剂,常规和链特异性ds-cDNA合成试剂,以及文库扩增试剂。可以衔接mRNA纯化试剂盒或rRNA去除试剂盒构建测序文库。二链合成模块配有两种Buffer,客户可根据需要进行常规建库或链特异性建库。其中链特异性二链合成Buffer中将dTTP替换为dUTP,使cDNA第二链中掺入dUTP,而本试剂盒使用的高保真DNA聚合酶无法扩增含尿嘧啶的DNA模板,实现链特异性。提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,保证了文库构建的稳定性和重复性。

    产品信息

     

    货号 12308ES08 / 12308ES24 12308ES96
    规格 8 T / 24 T / 96 T

    组分信息

    组分编号 组分名称 12308ES08 12308ES24 12308ES96
    12308-A 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI) 2× Frag/Prime Buffer 80 μL 250 μL 930 μL
    12308-B 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI) 1st Strand Enzyme Mix 16 μL 48 μL 192 μL
    12308-C 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI) Strand Specificity Reagent 50 μL 150 μL 580 μL
    12308-D 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI) 2nd Strand Buffer (dNTP) 240 μL 720 μL 2×1440 μL
    12308-E 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI) 2nd Strand Buffer (dUTP) 240 μL 720 μL 2×1440 μL
    12308-F 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI) 2nd Strand Enzyme Master Mix 40 μL 120 μL 480 μL
    12308-G 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI) Ligation Enhancer 240 μL 720 μL 2×1440 μL
    12308-H 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI) Novel T4 DNA Ligase 40 μL 120 μL 480 μL
    12308-I 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI) 2×Super Canace® II High-Fidelity Mix 200 μL 600 μL 2×1200 μL
    12308-K 双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI) Nuclease Free H2O 100 μL 300 μL 1000 μL
    12308-* * Primer mix NA NA NA
    *Primer mix为实验必须试剂,但是该成分不包含在本试剂盒,需要额外配置。本试剂盒组分兼容Illumina和MGI双平台,但需要额外配置专属于Illumina®或者MGI®的primer mix(Cat# 13335 Primer Mix for Illumina®以及Cat# 13334 Primer Mix for MGI®)。

    储存条件

    -25~-15℃保存,有效期1年。

    使用说明 
    实验前请仔细阅读:
    、关于接头连接 (Adapter Ligation)

    1. 本公司可提供Illumina®或者MGI®长接头(Barcoded Adapter)试剂盒和短接头试剂盒,客户可根据实验需求进行选择。
    2. 我们建议选用高质量的商业化接头。如客户使用自制接头,请委托具有NGS引物合成经验的公司,并备注需进行严格的防污染控制。此外,进行接头退火操作时,请在超净台完成。每次只操作一种接头,防止交叉污染。
    3. 使用接头时,请提前将接头取出放在4°C或冰盒上解冻;在室温操作时,实验室温度最好不要超过25°C,防止接头解链。
    4. 建库过程中,接头浓度过高或过低都会导致建库成功率变低。本试剂盒操作方案中,所加入的接头体积固定为5 μL,请根据初始的RNA投入量,参考表1对接头进行稀释。接头稀释液请选择0.1×TE buffer,稀释过的接头可在4°C保存48小时。
    1-1 Input Total RNA量与Illumina®接头使用浓度推荐表

    Input Total RNA Illumina® Adapter stock concentration
    10 ng 1 μM
    100 ng 1.5 μM
    500 ng 3 μM
    ≥1 μg 5 μM

    1-2  Input Total RNA量与MGI®接头使用浓度推荐表

    Input Total RNA MGI® Adapter stock concentration
    100–499 ng 2 μM
    500–4000 ng 5 μM

    *可根据不同类型total RNA样本及投入量,按需求适当调整Adapter使用量
    、关于文库扩增 (Library Amplification)
    1. 本试剂盒中的文库扩增组分由本公司第二代高保真DNA聚合酶所组成,在第一代的基础上,大大增强了扩增的均一性,即使是低拷贝的基因,也能进行无偏好性地扩增。
    2. 文库扩增步骤需要严格控制扩增循环数。循环数不足,将导致文库产量低;循环数过多,又将导致文库偏好性增加、重复度增加、嵌合产物增加、扩增突变积累等多种不良后果。表2列举了使用本试剂盒进行文库扩增,Input Total RNA 量与相应扩增循环数的推荐。
    3. 表2中推荐的循环数可满足绝大多数建库需求,若您的样本质量较差(如降解严重的FFPE样本),可根据实际情况适当增加循环数。mRNA建库时请特别注意,由于不同物种和组织所提取的 Total RNA中,mRNA的含量差异较大,实验中需根据建库起始量、物种类型及样本处理情况适当调整扩增循环数。
     2 Input Total RNA 量与扩增循环数推荐表*

    Input Total RNA Number of cycles
    Non-stranded Stranded
    10 ng 15 15
    100 ng 14 14
    500 ng 12 13
    1 μg 11 12

    【注】:*由于文库产量不仅与投入量和扩增循环数相关,样本质量、片段化条件、分选条件等都会影响产量。建库过程中请根据实际情况综合考虑,选择最合适的建库条件。
    DNA磁珠纯化与分选 (Bead-based Clean Up and Size Selection)
    1. 建库过程中有多个步骤需要使用DNA纯化磁珠,我们推荐使用Hieff NGS® DNA Selection Beads (Yeasen Cat#12601)或AMPure® XP磁珠(Beckman Cat#A63880)进行DNA纯化和分选。
    2. 磁珠使用前应先平衡至室温,否则会导致得率下降、分选效果不佳。
    3. 磁珠每次使用前都应充分振荡混匀或使用移液器上下吹打充分混匀。
    4. 转移上清时,请勿吸取磁珠,即使微量残留都将影响后续文库质量。
    5. 磁珠洗涤使用的80%乙醇应现用现配,否则将影响回收效率。
    6. 产物洗脱前应将磁珠置于室温干燥。干燥不充分容易造成无水乙醇残留影响后续反应;过分干燥又会导致磁珠开裂进而降低纯化得率。通常情况下,室温干燥3-5 min足以让磁珠充分干燥。
    7. DNA纯化或长度分选产物如需保存,可使用0.1×TE Buffer洗脱,产物于4°C可保存2天,-20°C可保存1个月。
    、关于文库质检 (Library Quality Analysis)
    1. 通常情况下,构建好的文库可通过长度分布检测和浓度检测来进行质量评价。
    2. 文库浓度检测可使用:基于双链DNA荧光染料的方法,如Qubit®、PicoGreen®等;基于qPCR绝对定量的方法。
    3. 推荐使用qPCR方法进行文库浓度检测:Qubit®等基于双链DNA荧光染料的浓度测定方法时,无法有效区分单端连接Adapter的产物、两端均未连接Adapter的产物及其他不完整双链结构产物;qPCR绝对定量基于PCR扩增原理,仅定量样品中两端Adapter完整的文库(即可测序的文库),可排除单端或双端都不连接Adapter的不可测序文库的干扰。
    4. 文库浓度检测不可使用:基于光谱检测的方法,如NanoDrop®等。
    5. 文库长度分布检测,可通过Agilent Bioanalyzer 2100等基于毛细管电泳或微控流原理的设备进行检测。
    、自备材料 (Other Material)
    1. mRNA富集试剂盒:Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit V2 (Yeasen Cat#12629)。
    2. rRNA去除试剂盒:Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS) (Yeasen Cat#12257)或其他rRNA去除试剂盒。
    3. RNA纯化磁珠: Hieff NGS® RNA Cleaner (Yeasen Cat#12602)或其他等效产品。
    4. DNA纯化磁珠:Hieff NGS® DNA Selection Beads (Yeasen Cat#12601)或AMPure® XP Beads (A63880)或其他等效产品。
    5. RNA质控:Agilent 2100 Bioanalyzer RNA 6000 Nano/Pico Chip或其他等效产品。
    6.  Adapters:Complete Adapter for Illumina®使用(Cat#13519-13520或其他等效产品)或Complete Adapter for MGI®使用(Cat#13360-13362或其他等效产品)。
    7. 文库质检:Agilent 2100 Bioanalyzer DNA 1000 Chip/ High Sensitivity Chip或其他等效产品;文库定量试剂。
    8. 其他材料:无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。
    六、建库流程图
    双模式RNA建库试剂盒(兼容Illumina和MGI)
     1 RNA建库原图流程
     

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    [1]Liu Y, Han R, Zhou L, et al. Comparative performance of the GenoLab M and NovaSeq 6000 sequencing platforms for transcriptome and LncRNA analysis [published correction appears in BMC Genomics. 2022 Jan 26;23(1):81]. BMC Genomics. 2021;22(1):829. Published 2021 Nov 17. doi:10.1186/s12864-021-08150-8(IF:4.547)

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