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Hieff NGS®MaxUp核糖体RNA去除试剂盒(植物)

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  • ¥4840
  • 翌圣生物(Yeasen)已认证
  • 12254ES24
  • 上海
  • 2025年11月17日
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    • 英文名

      Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant)

    • 保质期

      效期一年

    • 供应商

      翌圣生物科技(上海)股份有限公司

    • 保存条件

      -20 °C存放

    • 规格

      24T

    产品信息

     

    产品名称

    产品编号

    规格

    价格/元

    Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant)

    MaxUp rRNA去除试剂盒(植物)

    12254ES24

    24 T

    18363.00

    12254ES96

    96 T

    53645.00

     

    产品描述

     

    Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant)利用RNase H消化法去除植物来源总RNA中的核糖体RNA(包括细胞质18S、25S rRNA,线粒体18S、26S rRNA,叶绿体16S、23S rRNA)以保留信使RNA (mRNA)和其它非编码RNA。该试剂盒对于完整和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成或其它下游应用。

     

    适用范围

     

    适用于多种植物来源的100 ng~1 μg 总RNA样品;适用于完整或部分降解RNA样品。

     

    产品组分

     

     

    图片.png

     


    运输与保存方法

     

    干冰运输,-20 °C存放。效期一年。

     

    注意事项

     

    1. 请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM 高效核酸去除喷雾去除RNA酶污染。

    2. RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNase I消化并纯化后再用于本试剂盒。

    3. RNA样品最大投入体积为10 μL,若样品体积较大,可先进行浓缩。

    4. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

    5. 本产品仅作科研用途!

     

    自备材料

     

    1. RNA纯化磁珠:Hieff NGS® Cleaner (Cat#12602)或其他等效产品。

    2. qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (No Rox) (Cat#11201)或其他等效产品。

    3. 其他材料: 无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。

     

    操作步骤

     

    1. 探针杂交

    1.1 将探针和杂交Buffer从-20 °C 取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。

    1.2 准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用Nuclease free H2O稀释至11 μL。

    1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反应体系。

    表1 探针杂交反应体系

    名称

    体积 (μL)

    Hybridization Buffer

    3

    Probe Mix (Plant)

    3

    Total RNA

    9(100 ng~1 μg)

    Total

    15

    1.4 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

    1.5 将上述 PCR 管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。

    表2 探针杂交反应程序

    温度

    时间

    热盖105°C

    On

    95 °C

    2 min

    95 °C-22 °C

    0.1 °C/s

    22 °C

    5 min

    4 °C

    Hold

    2. RNase H消化

    2.1将RNase H消化试剂从-20 °C取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。按照表3所示,配制RNase H消化反应体系。

    表3 RNase H消化反应体系

    名称

    体积 (μL)

    RNase H Buffer

    3

    RNase H

    2

    上步产物

    15

    Total

    20

    2.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

    2.3 将上述 PCR 管置于PCR仪中,设置反应程序:热盖50 °C,37 °C,30 min; 4 °C,hold,进行RNase H消化反应。

    3. DNase I 消化

    3.1将DNase I消化试剂从-20 °C 取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。按照表4所示,配制DNase I消化反应体系。

    表4 DNase I消化反应体系

    名称

    体积 (μL)

    DNase I Buffer

    27.5

    DNase I

    2.5

    上一步产物

    20

    Total

    50

     

    3.2 使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。

    3.3 将上述 PCR 管置于PCR仪中,设置反应程序:热盖50 °C,37 °C,30 min; 4 °C,hold,进行DNase I消化反应。

    4. RNA纯化

    4.1 准备工作:将 Hieff NGS® RNA Cleaner (Cat#12602)磁珠由冰箱中取出,室温平衡至少 30 min。用Nuclease free H2O配制80%乙醇。

    4.2 涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。

    4.3 吸取 110 μL Hieff NGS® RNA Cleaner (2.2×,Beads:DNA=2.2:1)至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育 5 min。

    4.4 将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3 min),小心移除上清。

    4.5 保持PCR管始终置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育 30 sec 后,小心移除上清。

    4.6 重复步骤 4.5,总计漂洗两次。用 10 μL移液器吸干净残留液体。

    4.7 保持 PCR 管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠 (5~10 min)。

    4.8 RNA洗脱:将PCR 管从磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用适合下游实验的相应体积Nuclease free H2O或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置 5 min。

    4.9将 PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3 min),小心移取 10 μL 上清(可根据步骤4.7选择的实际洗脱体积进行相应调整)至新的Nuclease free PCR 管中。

    【注】:洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80 °C存放。

     

    案例展示

     

    1)15种不同的植物样本,投入1μg进行RNA建库测试,rRNA的残留率如图1所示,rRNA残留率都在2%以内。

     

    图1 不同类型植物样本,rRNA的残留率检测。.jpg

     

    图1 不同类型植物样本,rRNA的残留率检测。

    2)不同客户返样的植物样本,投入1μg进行RNA建库测试,rRNA的残留率如图2所示,rRNA残留率都在2%以内。

    图2 不同客户返样植物样本,rRNA的残留率检测。 .jpg

    图2 不同客户返样植物样本,rRNA的残留率检测。



    HB211122

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