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上海中科新生命生物科技有限公司
· 产品定义
气相或液相色谱联用质谱(GC-MS或LC-MS)和核磁共振(NMR)光谱是科学研究中最常用的代谢分析平台,但是使用的单一分析平台还不能够完全检测整个代谢组,这主要是由于这些代谢物的理化性质多样性,如亲水性碳水化合物、挥发性醇和酮、氨基和非氨基有机酸以及疏水性脂类等。GC-MS适合分子量比较小(<700D)、易挥发、热稳定的非极性物质检出,LC-MS适用范围更广,适合如分子量大、热不稳定、极性大等物质检出。对同一份样本分别进行GC-MS和LC-MS检测, 从而可以更全面研究各类型小分子代谢物在样本中的变化情况和内在关系。
· 技术路线
· 技术优势
1. 深度数据库:3万+本地小分子数据库(LC-MS)和1000+本地数据库及公共数据库(GC-MS);
2. 鉴定数目领先:平均项目鉴定代谢物数量2000+;
3. 高质数据:严格的实验质控与高标准的谱图匹配标准及卡值条件;
4. 高品质售后服务:专业项目管理与生信团队保证您在售中与售后的体验。
· 数据分析
| 服务标准 | 分析类型 | 分析内容 | 拟解决问题 |
| 标准数据分析 | 质控 | TIC等多项QC分析 | 获得高质量数据 |
| 轮廓分析 | Superclass分类 | 获得代谢物的分类信息 | |
| 差异分析 | 单变量统计分析(火山图等) | 反映每个变量的组间差异 | |
| 多维统计分析(PCA、PLS-DA、OPLS-DA等) | 评估组间差异,找到导致组间差异的影响变量 | ||
| 功能分析 | 层次聚类分析 | 获得代谢物的表达模式信息 | |
| 相关性分析 | 衡量两个变量的相关程度 | ||
| KEGG分析 | 进一步了解相关代谢通路和生物学功能 | ||
| 高级数据分析 | 生信分析 | WGCNA | 获得与表型强关联的核心代谢物 |
| 回归分析 | 建立重要代谢物和其他指标的关联 | ||
| 趋势聚类分析 | 探讨代谢物的含量趋势模式 | ||
| 机器学习 | 筛选诊断性能良好的生物标志物 |
部分数据分析结果展示
· 推荐组合产品
小分子全面代谢组学(GC+LC)+蛋白/转录组:上游(蛋白/转录)+下游(代谢)表明因果
· 推荐应用领域
1. 临床疾病研究
2. 营养功能研究
3. 表型与生理功能研究
4. 植物生理与抗逆研究
5. 药物治疗评价与机制研究
· 送样建议(特殊样本请咨询)
| 样本类型 | 常规送样量 | 最少送样量 | 建议生物学重复 | |
| 细胞类 | 细胞 | ≥2*10∧7/sample | ≥2*10∧7/sample | 临床样本:每组≥ 30 例 动物来源:每组≥ 10 例 细胞样本:每组≥ 6 例 |
| 粪便 | 粪便、肠道内容物 | ≥300mg/sample | ≥150mg/sample | |
| 体液类 | 血浆/血清、尿液 | ≥400μl/sample | ≥200μl/sample | |
| 组织类 | 肝脏、肾脏、癌/癌旁组织等 | ≥300mg/sample | ≥150mg/sample | |
| 菌体 | 细菌沉淀、真菌沉淀 | ≥400mg/sample | ≥200mg/sample | |
| 特殊样本 | 精子、分泌物、环境样本等 | 另旬 | ||
· 参考文献
The gut metabolite indole-3 propionate promotes nerve regeneration and repair. Nature. 2022
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文献和实验,经过不断的研发和升级,也推出了数据库的全面升级,数据库的升级将大大提升精准分析的准确度,也为助力 GC-MS/LC-MS 双平台代谢组学研究。 代谢组看点双平台代谢组学: (LC-MS 和 GC-MS)双平台代谢组学,通过优化前处理方法并结合 GC-MS 平台和 LC-MS 平台各自优势,同时配套多年积累的拥有自主产权的自建数据库,实现一份样本双平台检测,双数据库定性极大地提高代谢物鉴定的数量和准确性。
GC-MS 代谢组全套技术流程、应用瓶颈、定量方式及数据库应用
GC-MS 非靶向代谢组学检测通过气质联用(GC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有显著变化的代谢物,进而研究这些小分子代谢物变化,实现对生命科学中更多问题的探索。 1.GC-MS(气质联用)相关介绍 GC-MS 分离检测的原理:利用待分离的各种物质在两相中的分配系数、吸附能力等理化性质的不同来进行分离,然后进入质谱检测器进行检测的过程。 GC-MS 仪器分为三个系统:进样系统、分离系统、检测系统。 GC-MS 的适用范围:主要
) 拟靶向代谢组学的核心是通过非靶向方法的“拟”靶向化来实现的,包括三个步骤:1)基于四极杆飞行时间质谱的非靶向分析;2)母离子/产物离子对的选择;3)使用三重四极杆或 QTRAP 质谱系统采用 MRM 方式基于上述离子对样品进行分析。该技术由于结合了非靶向和靶向分析技术的双重优势,在代谢物分析的覆盖度上与非靶向方法接近,在灵敏度上与靶向分析一样,应用日益广泛。 在仪器平台的选择上,由于 GC-MS 和 LC-MS 在分离对象上的差别,使得其在代谢物的分离分析上具有各自的独特优势。两类仪器的联合
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