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上海旭燃生物科技有限公司
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全基因组重测序及数据分析
2、全基因组分析,揭示个体的全部基因组序列,包括基因和非编码区域
3、低成本,高准确性,高通量
4、实验及分析周期短,快速地确定生物体的完整基因组序列
| 样本类型 | 建议送样量 | 保存、运输介质 |
| 组织 | >50mg | -80℃保存,干冰运输 |
| 细胞 | >2 x 10^6 | -80℃保存,干冰运输 |
| 血液 | >1ml | -80℃保存,干冰/4度(新鲜)运输 |
| FFPE | A.切片组织面积大于1cm2,切片表面无划痕,无干裂,均匀贴片的石蜡切片; B.切片组织细胞>30000个;有核细胞比例>80%;肿瘤细胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,组织面积偏小或细胞核占比未达80%以上,需提供5-12片; C.石蜡块:厚度4mm以上,组织约绿豆大小以上; D.蜡卷:厚度25um左右,2-5卷 |
4℃或常温保存和运输 |
| 唾液 | >1ml,尽量收集较多的细胞 | 常温或4℃运输 |
| 口腔拭子 | 1.5ml管 2管,或5ml管1管 | 常温或4℃运输 |
| gDNA | >1ug | -80℃保存,干冰运输 |
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文献和实验molrep 有哪位战友知道怎么做全基因组的基因knock-down,我听说有全基因组的shRNA文库,怎么用这个东西呢,谢谢 bigbang_0_0 做转染,然后看你们所期待的表型有什么变化即可 freecell 何不参考一下这篇文献? http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B8G3Y-4TT80P4
海边海鸥 偶的题目大致是研究某一细菌产生ESBLs,其基因组中含有耐药基因,但是表型(药敏试验仍对该类抗生素敏感)阴性。可能存在某些机制使该耐药基因未表达。打算进行该两株的全基因组测序,想请教一下主要从哪几方面考虑未表达的可能性。谢谢大家:) 海边海鸥 怎么没有建议呢? zhujoker 我来胡说2句吧,不知道细菌基因组有没有甲基化修饰,自己不做细菌,所以不能确定(但是偶刚才查一下的确好像
相关专题 DNA甲基化是基因组DNA的一种主要表观遗传 修饰形式。近年来,大量研究表明DNA甲基化修饰对于维持正常细胞功能、传递基因组遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生,起着至关重要的作用。甲基化研究成为表观遗传学的热点,相应的技术也是层出不穷,根据实验目的的不同,这些技术大体能够分成两类:全基因组(高通量)甲基化研究技术以及特异性甲基化位点(低通量)研究技术。下面将介绍几种当前最常用的一些技术全基因组或者说中高通量甲基化研究手段
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