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- 10x空间转录组测序
- 上海市闵行区
- 2026年04月26日
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上海旭燃生物科技有限公司
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10x空间转录组测序及数据分析
空间转录组测序技术作为一种新兴的检测手段，能够帮助我们了解疾病的不同亚型，探究疾病的细胞组成、分化状态以及相关的细胞功能，了解免疫微环境的分子特征，以及筛选新的疾病标志物等。
2、操作流程简单，从组织切片到文库的流程简单；
3、空间分辨率较高，检测面积大，检测效率（灵敏度）高；
4、易于与组织学分析的实验室方法和工具集成；
| 样本类型 | 建议送样量 | 存储介质 | 保存、运输条件 |
| FFPE | 捕获区域：6.5mm*6.5mm 或 11mm*11mm | 福尔马林固定石蜡包埋组织样本；可寄送样本形式：石蜡包埋块、未处理的白片、做过 HE 染色的贴片 | -80℃保存，干冰运输 |
| FF | 捕获区域：6.5mm*6.5mm 或 11mm*11mm | 新鲜冷冻组织样本；可寄送样本形式：新鲜冷冻组织包埋块、未处理的白片 | -80℃保存，干冰运输 |
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文献和实验Nat Methods 2020 年度技术方法：空间转录组到底是什么，怎么做，怎么用
方法。一种是可以用显微镜通过原位测序或多重荧光原位杂交技术测得；另一种方法是在测序的时候，以一种保留空间信息的方式捕获 mRNA。目前，两种方法在目标覆盖范围、空间分辨率和通量方面往往是互补的。选择哪种方法，必须依据相应的生物学问题。 在 Nature Methods 的报道中，作者汇总了目前已有的和未来会推广应用的多种空间转录组技术方法。其中，大篇幅介绍了 10x Genomics 空间转录组技术的前世今生以及未来的发展方向。早在 2018 年，10x Genomics 公司就收购了位于瑞典斯德哥尔摩
10x Visium空间转录组测序针对FFPE样本的实验已经开展有一段时间了，今天小编就来总结一下整个实验的详细流程。 首先来一张实验流程导图： 10xVisium FFPE的实验流程 FFPE样本Visium空间转录组技术流程（图片引自10x官方） 一、取材 FFPE样本取材要求组织不要大于6.5mm*6.5mm，因为10x visum的每张切片的捕获区域只能容纳6.5*6.5的组织大小，≤6.5 x 6.5 mm的组织块可与Visium
2020年夏天，空间转录组技术（Visium）横空出世，空间转录组技术将组织学影像与RNA测序的高通量和发现能力相结合，对样本进行全转录组（WTA）分析，获得基因在空间位置上的表达信息，但初代Visium技术实验只能用冰冻组织样本，时隔一年该技术已经适用于石蜡包埋组织样本，今天咱就来唠唠，看着风很大的Visium FFPE 空间转录组到底是什么，和之前的Visium冰冻组织样本(以下称visium）区别在哪？ 什么是FFPE FFPE（石蜡包埋）样本是目前绝大多数科研人员和临床医生首选
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