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宏基因组+代谢组联合分析
企业认证
上海中科新生命生物科技有限公司
· 产品定义
基于宏基因组+代谢组(非靶向/靶向代谢组)的组学数据,先从宏基因组、代谢层面分别筛选组间差异的菌株、基因和代谢物,然后基于三者间的相关性进行联合分析,多角度揭示特定菌群、基因功能与特定代谢物(群)之间的关联性,筛选引起菌群代谢状态或功能性代谢小分子变化的关键功能菌株和代谢物。
· 技术优势
1. 研究路线完整、创新:打通菌群结构与功能机制研究
2. 微生物基因功能和代谢物映射,发掘潜在的驱动环境表型变化的关键功能菌群
· 数据分析
· 部分数据分析结果展示
· 推荐应用领域
生物领域各个研究方面,如:
1. 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;
2. 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;
3. 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;
4. 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;
5. 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;
6. 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;
7. 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;
8. 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。
· 项目案例
文献名称:Metagenomic and metabolomic profiling reveals the correlation between the microbiota and flavor compounds and nutrients in fermented sausages
发表期刊:《Food Chemistry》(IF=7.514)
合作单位:渤海大学食品科学与技术学院
文章摘要:了解传统发酵香肠(FSs)和接种发酵香肠(IFS)中不同数量的微生物和代谢物之间的相互关系,有助于我们识别商业发酵剂培养物中缺失的关键物种,以重现传统发酵香肠的风味化合物和营养素。接种了戊糖链球菌、乳酸链球菌、木糖链球菌、肉质链球菌或戊糖链球菌和木糖链球菌的IFS,由于缺乏不同的葡萄球菌(肉质链球菌、木糖链球菌、马蹄疫链球菌和腐生链球菌),无法重现传统发酵香肠的挥发性代谢谱(尤其是酯类、甲基醛)。此外,小球菌属和葡萄球菌属的组合与氨基酸、脂肪酸、l-鹅氨酸和l-肌肽水平呈正相关。添加乳酸双歧杆菌和肉质链球菌后,IFS中的吡哆醛和吲哚乙酸水平显著升高,这与维生素B6和色氨酸代谢途径呈正相关。
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