B7-H3在TNBC中的表达和临床相关性分析
评估B7-H3在TNBC中的表达水平及其与预后的关系
利用TCGA和KM Plotter数据库分析B7-H3表达及生存关联;通过TMA免疫组化验证蛋白表达;Western blot检测细胞系中B7-H3表达。
Targeting B7-H3 inhibition-induced activation of fatty acid synthesis boosts anti-B7-H3 immunotherapy in triple-negative breast cancer
包含转录组学、代谢组学分析,体外细胞功能实验(增殖、迁移、凋亡),双荧光素酶报告基因实验,以及动物模型体内验证,涵盖功能验证和机制验证。
MDA-MB-231细胞系 BT549细胞系 4T1细胞系构建的BALB/c小鼠移植瘤模型 TNBC组织微阵列(TMA)
siRNA敲低效率:siRNA-B7-H3-1在MDA-MB-231和BT549细胞中的敲低效率需验证 B7-H3和FASN单敲及双敲后的细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡表型变化 B7-H3敲低后AKT通路和SREBP1/FASN表达水平的变化 体内实验中抗B7-H3抗体和FASN抑制剂的剂量与给药方案 联合治疗组中肿瘤体积、重量、凋亡和CD8+ T细胞浸润的评估
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估B7-H3在TNBC中的表达水平及其与预后的关系
利用TCGA和KM Plotter数据库分析B7-H3表达及生存关联;通过TMA免疫组化验证蛋白表达;Western blot检测细胞系中B7-H3表达。
验证B7-H3敲低是否抑制TNBC细胞增殖、迁移和侵袭并促进凋亡
使用siRNA敲低B7-H3,通过CCK-8、集落形成、Transwell和流式细胞术检测细胞功能变化。
探索B7-H3敲低后肿瘤细胞代谢通路的变化
进行RNA-seq和LC-MS/MS代谢组学分析,结合GO、GSEA和MSEA等生物信息学分析,发现脂肪酸代谢通路异常激活。
验证FASN作为关键酶在TNBC恶性进展中的作用
通过siRNA敲低FASN,检测细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡变化。
阐明B7-H3敲低如何上调FASN表达
结合转录组数据和JASPAR预测筛选候选转录因子,通过双荧光素酶实验验证SREBP1对FASN的转录激活;Western blot和免疫荧光验证SREBP1核转位和AKT通路激活;通过AKT抑制剂挽救实验验证信号通路。
验证联合敲低是否能增强抗肿瘤效果
在TNBC细胞中同时敲低B7-H3和FASN,检测增殖、迁移、侵袭和凋亡表型。
在动物模型中验证B7-H3和FASN联合抑制的抗肿瘤效果及与PD-L1抑制剂的协同作用
使用4T1细胞构建BALB/c小鼠皮下移植瘤模型,分组给予抗B7-H3抗体、FASN抑制剂、联合治疗或再联合抗PD-L1治疗,监测肿瘤生长,通过H&E、TUNEL和CD8免疫荧光评估治疗效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | FASN抗体 | CST | 3180 |
| B7-H3抗体 | CST | 14058 | |
| 细胞培养 | MCF-10A细胞系 | KeyGEN Biotech | KGG3103-1 |
| MDA-MB-231细胞系 | KeyGEN Biotech | KGG3220-1 | |
| BT549细胞系 | KeyGEN Biotech | KGG3221-1 | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | ThermoFisher | L3000015 | |
| 增殖实验 | 结晶紫 | Solarbio | G1061 |
| 迁移和侵袭实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC/7-AAD细胞凋亡检测试剂盒 | KeyGEN | KGA1106-50 |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Solarbio | T8200 |
| SREBP1抗体 | Proteintech | 66875-1-Ig | |
| DAPI染色液 | Beyotime | C1002 | |
| 共聚焦显微镜 | Nikon | -- | |
| RNA提取和RT-qPCR | RNA-easy提取试剂 | Vazyme | R701-01 |
| HiScript II Q RT SuperMix逆转录试剂 | Vazyme | R222-01 | |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q321-02 | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Solarbio | R0020 |
| 磷酸酶抑制剂 | Abcam | ab201113 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Vazyme | E112-01 | |
| SDS-PAGE凝胶 | Vazyme | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| NcmBlot封闭液 | NCM Biotech | P30500 | |
| FASN抗体 | Abcam | ab128856 | |
| SREBP1抗体 | Proteintech | 66875-1-Ig | |
| B7-H3抗体 | Abcam | ab134161 | |
| p-AKT抗体 | CST | 4060 | |
| AKT抗体 | CST | 4691 | |
| p-mTOR抗体 | CST | 5536 | |
| mTOR抗体 | CST | 2983 | |
| β-actin抗体 | Affinity Biosciences | AF7018 | |
| SuperPico ECL化学发光试剂盒 | Vazyme | E422-01 | |
| ChemiDoc XRS+成像系统 | Biorad | -- | |
| 双荧光素酶实验 | KeygenMAX 3000转染试剂 | Keygen | KGA9705-1.5 |
| 动物实验 | B7-H3单克隆抗体 | BioXCell | BE0124 |
| FASN抑制剂 | MCE | HY-120394 | |
| PD-L1单克隆抗体 | BioXCell | BE0101 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、FBS浓度、转染试剂浓度 阅读提示:Methods: Cell culture |
| B7-H3敲低 | siRNA序列、转染浓度、敲低效率验证 阅读提示:Results: B7-H3 knockdown suppressed the malignant phenotypes of TNBC cells; Methods: Cell culture |
| 增殖和集落形成 | 细胞接种密度、培养时间、染色方法 阅读提示:Methods: Proliferation assays |
| 迁移和侵袭 | Transwell小室基质胶用量、细胞数目、培养时间 阅读提示:Methods: Migration and invasion assay |
| 凋亡检测 | 凋亡检测试剂盒、上机仪器、数据分析方法 阅读提示:Methods: Flow cytometry |
| Western blot | 抗体货号、稀释比例、蛋白上样量、曝光条件 阅读提示:Methods: Western blot |
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、细胞接种数量、给药剂量和频率、治疗周期 阅读提示:Methods: Animal models; Figure 7 legend |