代谢组学筛查与临床样本分析
鉴定与癌症恶病质相关的循环代谢物变化,验证其在患者中的相关性。
对LLC荷瘤小鼠和肺癌腺癌患者的血清进行非靶向代谢组学分析,发现乳酸显著升高并与体重下降相关;分析患者手术前后乳酸水平。
Activation of GPR81 by lactate drives tumour-induced cachexia
多层级验证:患者样本、多种小鼠模型、细胞实验、基因敲除和药物抑制,机制和功能验证结合。
Lewis肺癌细胞(LLC)异种移植小鼠 KrasLSL-G12D/+;p53R172H/+自发肺癌小鼠 脂肪基质血管组分(SVF)来源的脂肪细胞 肺癌腺癌患者血清及脂肪组织样本
皮下注射1×10^6 LLC细胞建立异种移植模型 通过尾静脉注射1×10^6 LLC细胞建立原位肺癌模型 使用渗透压泵以1,600 mg/ml或800 mg/ml剂量输注乳酸7或14天 GPR81敲除小鼠或脂肪特异性GPR81敲除小鼠 Gβγ抑制剂gallein、ROCK1抑制剂Y-27632、p38抑制剂SB203580的脂肪垫注射
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定与癌症恶病质相关的循环代谢物变化,验证其在患者中的相关性。
对LLC荷瘤小鼠和肺癌腺癌患者的血清进行非靶向代谢组学分析,发现乳酸显著升高并与体重下降相关;分析患者手术前后乳酸水平。
验证乳酸单独是否足以诱导恶病质表型。
通过渗透压泵向无瘤小鼠输注L-乳酸(1.5或2 mmol/l)7或14天,监测体重、脂肪和肌肉质量变化。
确定GPR81是否介导乳酸和肿瘤诱导的恶病质。
使用GPR81敲除小鼠(全身或脂肪特异性)进行乳酸输注或肿瘤移植,评估体重、脂肪和肌肉质量、生存期、能量消耗等。
阐明乳酸/GPR81下游信号通路。
在SVF来源的脂肪细胞中,通过基因敲低或药物抑制剂(PTX, gallein, Y-27632, SB203580)处理,检测p38、ATF2、UCP1的磷酸化或表达;在小鼠中注射抑制剂评估体重的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 乳酸测量 | Biosen C-Line葡萄糖乳酸分析仪 | EKF Diagnostics | 5213-0051-6200 |
| 乳酸输注 | 渗透压泵 | Alzet | 2001 |
| 乳酸标准品 | L-乳酸钠 | Sigma-Aldrich | 71718 |
| D-乳酸钠 | Sigma-Aldrich | 71716 | |
| 乳酸检测 | Lactate Scout分析仪 | EKF Diagnostics | Lactate Scout 4 |
| 乳酸试纸 | Kirgen | XC-rssz72 | |
| 抑制剂处理 | H89 | MedChemExpress | HY-15979A |
| SB203580 | MedChemExpress | 152121-47-6 | |
| Y-27632 | Solarbio | IY0050 | |
| Gallein | MedChemExpress | HY-D0254 | |
| PTX | List Biological Laboratories | 180 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Solarbio | 11965 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141C | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15070063 | |
| 聚凝胺 | Solarbio | H8761 | |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | 13778030 |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Solarbio | P1261 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Scientific | 23227 |
| 免疫印迹 | PVDF膜 | Bio-Rad | 1620177 |
| 磷酸化p38 MAPK抗体 | Cell Signaling | 4511T | |
| p38 MAPK抗体 | Cell Signaling | 8690T | |
| ATF2抗体 | Cell Signaling | 35031 | |
| 磷酸化PKA底物抗体 | Cell Signaling | 9624S | |
| β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling | 2146S | |
| 磷酸化ATF2抗体 | Abcam | ab32019 | |
| UCP1抗体 | Abcam | ab209483 | |
| GPR81抗体 | Novus | NBP1-51956 | |
| 免疫荧光 | UCP1抗体 | Cell Signaling | 72298S |
| 磷酸化p38 MAPK抗体 | Cell Signaling | 4511T | |
| p38 MAPK抗体 | Affinity | BF8015 | |
| 羊抗兔Alexa Fluor 594 | Invitrogen | A-11012 | |
| 羊抗兔Alexa Fluor 568 | Invitrogen | A-11011 | |
| 羊抗鼠Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A-21235 | |
| 免疫组化 | UCP1抗体 | Sigma-Aldrich | U6382 |
| 辣根过氧化物酶标记羊抗兔IgG(H+L) | Invitrogen | 31460 | |
| 免疫荧光 | DAPI | Solarbio | S2110 |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜BX-53 | Olympus | -- |
| 共聚焦显微镜 | 共聚焦显微镜LSM880 | Zeiss | -- |
| RT-qPCR | TRIzol裂解液 | Invitrogen | 15596026 |
| cDNA合成试剂盒 | Transgen | AE311 | |
| LightCycler 96 | Roche | -- | |
| 代谢物提取 | 甲醇 | Merck | 1.06007.4008 |
| 代谢组学 | UPLC平台ACQUITY I-Class | Waters Corp | -- |
| Synapt G2-Si质谱仪 | Waters Corp | -- | |
| BEH Amide色谱柱 | Waters Corp | -- | |
| 磷酸化蛋白质组学 | Orbitrap Fusion Lumos LC-MS/MS系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 二氧化钛微珠 | GL Sciences | -- | |
| 代谢笼 | 代谢笼(CLAMS) | Columbus Instruments | -- |
| 体温测量 | 直肠温度探头BAT-12 | Physitemp | -- |
| 体成分分析 | 体成分分析仪500 | EchoMRI | -- |
| 握力测试 | 数字测力计DFX II | Chatillon | -- |
| 生化分析 | 自动生化分析仪cobas c311 | Roche | -- |
| 甘油测定 | 甘油检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | F005-1-1 |
| 细胞因子检测 | ProcartaPlex多细胞因子ELISA试剂盒 | eBioscience | PPX-06 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肿瘤模型建立 | 细胞系(如LLC, B16-F10等)及注射剂量、注射途径(皮下、尾静脉)、小鼠品系 阅读提示:Methods: Mice 部分 |
| 乳酸输注 | 渗透压泵植入时间、乳酸浓度、输注速率、持续时间 阅读提示:Methods: Delivery of lactate with osmotic minipumps |
| 基因敲除小鼠 | 敲除类型(全身或脂肪特异性)、小鼠品系背景、对照 阅读提示:Methods: Mice 部分 |
| 细胞实验 | SVF分离、分化条件、处理浓度(如20 mM乳酸)、预处理时间 阅读提示:Methods: Isolation of primary preadipocytes, Differentiation of SVF, 免疫印迹 |
| 抑制剂处理 | 抑制剂名称、剂量、给药途径、给药时间 阅读提示:Methods: Treatment with inhibitors |