人类及小鼠纤维化肾脏中PTGIS表达分析
验证PTGIS在肾纤维化中的表达变化及其与肾功能的关系
通过Nephroseq数据库分析多种肾病中PTGIS mRNA水平,以及单细胞RNA测序数据分析PTGIS在肾脏细胞中的表达分布,并在UUO小鼠模型中验证PTGIS蛋白水平变化。
Prostacyclin Mitigates Renal Fibrosis by Activating Fibroblast Prostaglandin I 2 Receptor
研究包含基因敲除小鼠模型、细胞实验、单细胞RNA测序分析等至少两个独立证据层级,并进行了功能验证;还使用了药物干预实验和临床样本分析,机制研究涉及信号通路验证。
Ptgis+/−小鼠 Ptgisfl/flTekCre+小鼠 Ptgirfl/flClo1a2CreER+小鼠 原代人肾成纤维细胞 NRK-49F细胞
小鼠模型:Ptgis+/−、Ptgisfl/flTekCre+、Ptgirfl/flClo1a2CreER+等, 年龄8-10周,雄性,C57BL/6背景 UUO模型:术后10天取材 I/R+单侧肾切除模型:左肾缺血35或30分钟,4周后右肾切除,8-30周取材 药物处理:BPS 300μg/kg/d,分两次灌胃,selexipag 3mg/kg/d,分两次灌胃,从术后32天至55天 细胞实验:TGF-β1 5ng/ml诱导,selexipag 5μM处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PTGIS在肾纤维化中的表达变化及其与肾功能的关系
通过Nephroseq数据库分析多种肾病中PTGIS mRNA水平,以及单细胞RNA测序数据分析PTGIS在肾脏细胞中的表达分布,并在UUO小鼠模型中验证PTGIS蛋白水平变化。
确定PTGIS缺失对肾纤维化和肾功能的影响
利用全身杂合子Ptgis+/−小鼠和内皮细胞特异性Ptgis缺失小鼠,在UUO和I/R+单侧肾切除模型中分析纤维化指标和肾功能。
评估PGI2类似物和PTGIR激动剂在肾纤维化模型中的治疗潜力
在I/R+单侧肾切除模型小鼠中,于术后第32天至55天给予BPS或selexipag,评估纤维化程度和肾功能。
验证PTGIR在胶原产生细胞(成纤维细胞)中的必要性
通过Col1a2CreER+小鼠与Ptgirfl/fl小鼠杂交,在胶原产生细胞中特异性敲除Ptgir,在UUO模型中观察纤维化变化,并在I/R模型中评估selexipag的保护作用是否依赖这些细胞上的PTGIR。
探究PTGIR激活对TGF-β1诱导的成纤维细胞活化的影响及其分子机制
在原代人肾成纤维细胞和NRK-49F细胞中,用TGF-β1诱导活化,并加入selexipag或BPS处理,检测纤维化标志物表达及PKA/CREB/CBP/SMAD2信号通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 他莫昔芬 | 文中未明确说明 | -- |
| 玉米油 | 文中未明确说明 | -- | |
| 药物处理 | 贝前列素钠 | Toray Industries | -- |
| 赛乐西帕 | Selleck | -- | |
| PKI 14-22 | Selleck | -- | |
| 检测分析 | 6-酮-前列腺素F1α ELISA试剂盒 | Cayman Chemical Company | 515211 |
| 细胞培养 | 成纤维细胞培养基 | Procell | CM-H072 |
| DMEM培养基 | Gibco | 11995-065 | |
| 胎牛血清 | 文中未明确说明 | -- | |
| 青霉素-链霉素 | 文中未明确说明 | -- | |
| 转化生长因子-β1 | R&D Systems | 240-B-010/CF | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Ambion | 15596018 |
| 逆转录 | 含gDNA去除剂的逆转录试剂盒 | Takara Bio | RR047 |
| PCR | Taq预混液 | Novoprotein | E005 |
| qRT-PCR | TB Green预混试剂盒 | Takara Bio | RR420 |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | 04906837001 | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 04693159001 | |
| 免疫沉淀 | NP-40裂解液 | Beyotime | P0013F |
| CBP抗体 | Abcam | ab253202 | |
| IgG对照抗体 | CST | 3900 | |
| Dynabeads蛋白G磁珠 | Invitrogen | 10003D | |
| Western blot | α-SMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP |
| PTGIS抗体 | Abcam | ab23668 | |
| 免疫荧光 | α-SMA抗体 | Proteintech | 67735-1-Ig |
| 细胞核染色 | DAPI | Abcam | ab104139 |
| Western blot | 构象特异性二抗 | CST | 5127 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠基因型与诱导 | 基因敲除小鼠的构建方法、Cre品系、他莫昔芬给药方案(剂量、频次、途径) 阅读提示:Methods - Mice |
| UUO模型建立 | 手术操作步骤、小鼠周龄性别、术后取材时间点 阅读提示:Methods - Experimental Models and Intervention |
| I/R+单侧肾切除模型 | 缺血时间、夹闭后恢复、单侧肾切除时间点、观察时间点 阅读提示:Methods - Experimental Models and Intervention |
| 药物处理方案 | BPS剂量(300μg/kg/d)、selexipag剂量(3mg/kg/d)、给药途径(灌胃)、给药频次(每日两次)、开始和结束时间 阅读提示:Methods - Experimental Models and Intervention |
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源、培养基成分、血清饥饿时间、TGF-β1浓度、PTGIR激动剂浓度、PKA抑制剂浓度、处理时间 阅读提示:Methods - Cell Culture |
| 蛋白分析 | 蛋白提取缓冲液成分、SDS-PAGE浓度、一抗稀释比例、内参蛋白(GAPDH, vinculin) 阅读提示:Methods - Western Blotting |
| 组织学染色 | 固定液、切片厚度、染色方法(Masson三色)、成像和分析方法(ImageJ) 阅读提示:Methods - Kidney Histology and Immunofluorescence |
| ELISA检测 | 组织样品制备方法、ELISA试剂盒货号、检测步骤 阅读提示:Methods - Prostaglandin Production Assessment |
| 单细胞RNA测序分析 | 数据来源、处理软件(Seurat版本)、数据归一化方法、聚类参数 阅读提示:Methods - Analysis of Single-Cell RNA-Seq |