患者PTC组织中衰老细胞的定位与鉴定
验证衰老肿瘤细胞是否存在于PTC侵袭前沿、淋巴管和淋巴结转移灶,并确认其为肿瘤上皮细胞。
对BRAFV600E表达PTC冷冻切片进行SA-β-Gal染色,连续切片进行p16INK4A和Ki67免疫组化;FFPE组织进行p16INK4A、BRAFV600E(VE1)和TTF-1免疫组化;real-time PCR检测p16INK4A mRNA。
Senescent tumor cells lead the collective invasion in thyroid cancer.
含患者PTC组织、体外原代细胞与细胞系、3D类器官、原位异种移植小鼠模型,并进行功能与机制验证
BRAFV600E表达的人PTC组织(70例) BRAFV600E诱导衰老的原代人甲状腺细胞 SNU790-CXCR4和HTH83甲状腺癌细胞系 HTH83与衰老/正常甲状腺细胞共移植的裸鼠原位模型
患者来源PTC组织:70例BRAFV600E表达PTC用于SA-β-Gal染色,13例用于real-time PCR,10例用于MMP免疫组化,13例用于CXCL12/CXCR4免疫组化 细胞模型:SNU790-CXCR4和HTH83细胞系;BRAFV600E或shCXCL12/shBRAF慢病毒感染原代甲状腺细胞 侵袭与迁移实验:Transwell(8-μm pore)和3D胶原I/Matrigel侵袭实验,共培养48 h,AMD3100处理浓度1 μM 动物实验:9周龄雌性BALB/c-nude小鼠,甲状腺原位注射9×10^5 HTH83细胞+1×10^5正常或衰老甲状腺细胞,3周后分析 SA-β-Gal染色:37°C孵育12 h;免疫组化H score评分(强度0-3,阳性百分比0-100%)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证衰老肿瘤细胞是否存在于PTC侵袭前沿、淋巴管和淋巴结转移灶,并确认其为肿瘤上皮细胞。
对BRAFV600E表达PTC冷冻切片进行SA-β-Gal染色,连续切片进行p16INK4A和Ki67免疫组化;FFPE组织进行p16INK4A、BRAFV600E(VE1)和TTF-1免疫组化;real-time PCR检测p16INK4A mRNA。
验证PTC侵袭区域是否呈现集体侵袭特征(E-cadherin保留、无EMT标志物上调)。
对PTC组织进行E-cadherin、D2-40、TTF-1、BRAFV600E免疫组化;对20例BRAFV600E表达PTC进行Twist1、Zeb1、E-cadherin、N-cadherin免疫组化。
验证衰老肿瘤细胞是否具有更高侵袭能力。
从BRAFV600E表达PTC分离原代肿瘤细胞,进行Transwell侵袭实验24 h,对膜上下区域细胞进行SA-β-Gal/eosin染色并计算衰老细胞比例。
验证衰老肿瘤细胞是否表达SASP(包括MMPs和趋化因子)。
对PTC组织和癌旁正常组织进行real-time PCR检测SASP基因;对癌中心与侵袭边缘显微切割组织进行RNA测序和real-time PCR;对PTC组织进行MMP1/3/9和p16INK4A免疫组化。
建立模拟PTC衰老表型的体外模型并验证其SASP表达和侵袭能力。
用BRAFV600E突变慢病毒感染原代正常人甲状腺细胞10天,SA-β-Gal染色和BRAF/p-Erk1/2 western blot验证衰老;用shBRAF慢病毒验证衰老表型减弱;RNA测序和real-time PCR/western blot检测SASP表达;Transwell侵袭实验检测侵袭能力。
验证CXCL12/CXCR4信号是否在PTC侵袭边缘上调并与衰老细胞共定位。
对13例BRAFV600E表达PTC进行real-time PCR检测CXCLs/CXCRs;对癌中心与侵袭边缘进行real-time PCR检测CXCL12/CXCR4;对13例PTC进行CXCL12、CXCR4和p16INK4A免疫组化;对BRAFV600E诱导衰老甲状腺细胞进行RNA测序和ELISA检测CXCL12分泌。
验证衰老细胞是否通过CXCL12/CXCR4信号吸引癌细胞并引领集体侵袭。
使用SNU790-CXCR4和HTH83细胞系与BRAFV600E诱导衰老甲状腺细胞共培养,进行迁移实验(Culture-Insert)、Transwell侵袭实验和3D胶原I/Matrigel侵袭实验;用shCXCL12或AMD3100抑制CXCL12/CXCR4信号;用mCherry/GFP标记细胞进行活细胞成像。
验证衰老细胞是否通过CXCL12/CXCR4信号增强甲状腺癌细胞的anoikis抵抗。
在HEMA包被的培养板中,将甲状腺癌细胞与正常、BRAFV600E衰老或shCXCL12/AMD3100处理的甲状腺细胞共培养12 h,用Calcein AM/EthD-1染色检测细胞死亡,检测caspase活性和凋亡相关蛋白表达。
验证衰老细胞是否在体内促进甲状腺癌的淋巴管侵犯和转移。
将HTH83细胞(9×10^5)与正常或BRAFV600E诱导衰老甲状腺细胞(1×10^5)共注射到9周龄雌性BALB/c-nude小鼠甲状腺叶,3周后分析肿瘤发生、大小、淋巴结转移和淋巴管侵犯。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织消化/细胞分离 | I型胶原酶 | Worthington Biochemical | -- |
| 细胞培养 | F12K培养基 | Gibco BRL | -- |
| RPMI培养基 | Gibco BRL | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco BRL | -- | |
| 支原体检测 | 支原体PCR检测试剂盒 | iNtRON Biotechnology Inc. | 25235 |
| 免疫组化 | 抗BRAFV600E(VE1)预稀释抗体 | Ventana Medical Systems Inc. | 790-4855 |
| p16INK4A预稀释抗体 | Ventana Medical Systems Inc. | 705-4713 | |
| 抗人Ki67抗原,克隆MIB-1 | Dako Denmark A/S | M7240 | |
| TTF-1,克隆8G7G3/1 | Cell Marque | 343M-95 | |
| D2-40(平足蛋白) | Cell Marque | 322M-15 | |
| MMP1抗体 | GeneTex | GTX100534 | |
| MMP3抗体 | GeneTex | GTX100723 | |
| MMP9抗体 | GeneTex | GTX100458 | |
| CXCR4抗体 | R&D System | MAB172 | |
| CXCL12抗体 | R&D System | MAB350 | |
| E-cadherin抗体 | Abcam | ab15148 | |
| Twist1抗体 | Abcam | ab50887 | |
| Zeb1抗体 | Novus Biologicals | NBP1-05987 | |
| 免疫组化检测 | Ventana Optiview DAB检测试剂盒 | Ventana Medical Systems | -- |
| 双重免疫组化 | UltraView通用DAB检测试剂盒 | Ventana Medical Systems Inc. | 760-500 |
| UltraView通用碱性磷酸酶红色检测试剂盒 | Ventana Medical Systems Inc. | 760-501 | |
| 免疫细胞化学 | N-cadherin抗体 | Abcam | ab18203 |
| Alexa Fluor 488二抗 | Thermo Fisher Scientific | A-21206 | |
| Alexa Fluor 555二抗 | Thermo Fisher Scientific | A-31572 | |
| F-actin染色 | 罗丹明鬼笔环肽 | Thermo Fisher Scientific | R415 |
| 3D凝胶侵袭实验 | I型胶原蛋白 | BD Biosciences | 354249 |
| 基质胶 | BD Biosciences | 354234 | |
| Transwell小室(0.4 μm孔径) | Corning | -- | |
| 类器官培养 | I型胶原蛋白 | BD Biosciences | 354236 |
| Lab-Tek培养板 | Nunc | 154917 | |
| RNA提取 | Macherey-Nagel RNA提取试剂盒 | Macherey-Nagel GmbH & Co. KG | -- |
| RNA质控 | Bioanalyzer RNA芯片 | Agilent Technologies | -- |
| RNA测序 | Nextseq 500测序仪 | Illumina | -- |
| 细胞侵袭实验 | 生长因子减少型基质胶 | BD Biosciences | 356230 |
| 细胞迁移实验 | 2孔培养插入物 | ibidi GmbH | -- |
| 细胞侵袭实验 | Transwell小室(8 μm孔径) | Corning | -- |
| 失巢凋亡实验 | 聚2-羟乙基甲基丙烯酸酯 | Sigma | P3932 |
| Calcein AM/EthD-1染色 | Sigma | -- | |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | Biovision | K272 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Biovision | K282 | |
| p16INK4A抗体 | Abcam | ab54210 | |
| p-Erk1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9106 | |
| Erk1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9107 | |
| Bcl-2抗体 | Cell Signaling Technology | 4223 | |
| Bcl-xL抗体 | Cell Signaling Technology | 2764 | |
| Bax抗体 | Cell Signaling Technology | 2774 | |
| CXCR4抗体 | Abcam | ab124824 | |
| BRAF抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9002 | |
| p-AktSer473抗体 | Cell Signaling Technology | 3787 | |
| Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| Tubulin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32293 | |
| BRAFV600E突变分析 | QIAamp DNA FFPE组织试剂盒 | Qiagen | -- |
| Applied Biosystems 3500XL基因分析仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 慢病毒制备 | pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro慢病毒载体 | System Biosciences | -- |
| pLKO慢病毒载体 | Sigma | -- | |
| Real-time PCR | Power SYBR Green PCR预混液 | Bio-Rad | -- |
| ELISA | 人CXCL12 ELISA试剂盒 | R&D System | -- |
| Caspase 3活性检测 | Caspase 3活性检测试剂盒 | Promega | -- |
| 图像采集 | ScanScope CS系统 | Aperio Technologies, Inc. | -- |
| Olympus DP70数码相机 | Olympus Microscope Corp. | -- | |
| Zeiss LSM 510显微镜 | Carl Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者PTC组织衰老细胞鉴定 | PTC样本例数(70例SA-β-Gal,20例EMT标志物,13例CXCL12/CXCR4),BRAFV600E表达状态,SA-β-Gal染色分级标准 阅读提示:Methods 'PTC samples from patients'及Figure 1、2、5图注 |
| BRAFV600E诱导衰老体外模型 | 原代甲状腺细胞来源与鉴定,慢病毒感染复数(MOI)文中未明确说明,puromycin筛选浓度3.5 μM,诱导时间10天,shRNA序列 阅读提示:Methods 'Isolation and culture of normal thyrocytes'和'Preparation of BRAFV600E and CXCR4 lentivirus' |
| 细胞迁移与侵袭实验 | 细胞接种数量(迁移1×10^4,Transwell侵袭5×10^4,3D侵袭8×10^4癌细胞+1×10^5甲状腺细胞),共培养时间(24 h或48 h),AMD3100浓度1 μM,shCXCL12序列 阅读提示:Methods 'Migration and invasion assay'和'3D gel invasion assay'及Figure 6图注 |
| anoikis抵抗实验 | HEMA包被浓度文中未明确说明,共培养细胞比例(甲状腺细胞6×10^4:癌细胞1.2×10^5),培养时间12 h,检测方法(Calcein AM/EthD-1) 阅读提示:Methods 'Anoikis assay'及Figure 7图注 |
| 原位异种移植模型 | 小鼠品系(雌性BALB/c-nude,9周龄),细胞接种数量(9×10^5 HTH83+1×10^5甲状腺细胞),注射部位(甲状腺叶),观察时间3周,统计方法(Mann–Whitney U-test) 阅读提示:Methods 'Orthotopic xenograft of cancer cells to nude mice'及Figure 8图注 |