验证氨基酸或血清单独去除对TSC2定位的影响
确定氨基酸饥饿或生长因子去除是否单独足以诱导TSC2溶酶体定位。
在MEFs中,进行氨基酸饥饿(1小时)及再添加(30分钟),或血清饥饿(16小时)及胰岛素刺激(1 μM,15分钟),通过免疫荧光检测TSC2与LAMP2共定位。
Lysosomal recruitment of TSC2 is a universal response to cellular stress.
使用多种细胞系、免疫荧光、免疫印迹、免疫共沉淀和免疫电镜,验证了TSC2在多种应激下的溶酶体定位及与Rag GTPase结合。
小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs) 人乳腺癌MCF-7细胞 人宫颈癌HeLa细胞 人胚胎肾HEK293FT细胞
氨基酸饥饿1小时(存在透析FBS)诱导TSC2溶酶体定位,再添加氨基酸30分钟可逆转 血清饥饿16小时(存在氨基酸)诱导TSC2溶酶体定位,1 μM胰岛素处理15分钟可逆转 高渗应激(NaCl增加33-200 mM,15分钟)、能量应激(2-DG,30分钟)、pH应激(30分钟)、缺氧(1% O2)或CoCl2(24小时)均诱导TSC2溶酶体定位 TSC2与LAMP2共定位使用Manders共定位系数(自动Costes阈值)量化,每组20-40个细胞 TSC2与Rag GTPase结合增加通过共免疫沉淀验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定氨基酸饥饿或生长因子去除是否单独足以诱导TSC2溶酶体定位。
在MEFs中,进行氨基酸饥饿(1小时)及再添加(30分钟),或血清饥饿(16小时)及胰岛素刺激(1 μM,15分钟),通过免疫荧光检测TSC2与LAMP2共定位。
探究氨基酸和生长因子信号整合调控TSC2定位的逻辑。
MEFs同时进行血清饥饿(16小时)和氨基酸饥饿(1小时),然后单独或同时再添加氨基酸和胰岛素,检测TSC2定位。
检验氨基酸或血清饥饿诱导TSC2溶酶体定位是否细胞类型特异。
在MCF-7、NIH3T3、HEK293FT和Hepa1-6细胞中重复氨基酸饥饿和血清饥饿实验,检测TSC2定位。
确定其他抑制mTORC1的应激是否也诱导TSC2溶酶体定位。
在MEFs和MCF-7细胞中,施加高渗应激(NaCl)、能量应激(2-DG)、pH应激、缺氧(1% O2)或CoCl2处理,检测mTORC1活性和TSC2定位。
通过生化方法确认TSC复合物在应激下招募到溶酶体。
在应激条件下,通过共免疫沉淀检测TSC2、TSC1和TBC1D7与Rag GTPase的结合。
探究HeLa细胞中TSC2定位的异常及其对刺激的响应。
在HeLa细胞中,检测基础条件、氨基酸饥饿、血清饥饿、胰岛素刺激等条件下TSC2定位,并与其它细胞系比较。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM | Gibco | 11965-092 |
| 非必需氨基酸 | Gibco | 11140-050 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 药物处理 | 胰岛素 | Sigma | I9278 |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | Sigma | D8375 | |
| Akt抑制剂VIII | Calbiochem | 124018 | |
| 免疫印迹和免疫荧光 | 抗磷酸化S6K(T389)抗体 | Cell Signaling Technology | 9205 |
| 抗S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 9202 | |
| 抗磷酸化4E-BP1(T37/46)抗体 | Cell Signaling Technology | 9459 | |
| 抗4E-BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 9452 | |
| 抗磷酸化Akt(T308)抗体 | Cell Signaling Technology | 9275 | |
| 抗磷酸化Akt(S473)抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗磷酸化AMPKα(T172)抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 | |
| 抗AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 2532 | |
| 抗磷酸化p38(T180/Y182)抗体 | Cell Signaling Technology | 9216 | |
| 抗p38抗体 | Cell Signaling Technology | 9212 | |
| 抗磷酸化TSC2(T1462)抗体 | Cell Signaling Technology | 3611 | |
| 抗磷酸化TSC2(S939)抗体 | Cell Signaling Technology | 3615 | |
| 抗TSC2抗体 | Cell Signaling Technology | 4308 | |
| 抗TSC1抗体 | Cell Signaling Technology | 4906 | |
| 抗TBC1D7抗体 | Cell Signaling Technology | 14949 | |
| 抗HIF-1α抗体 | GeneTex | GTX127309 | |
| 免疫荧光 | 抗小鼠LAMP2抗体 | Developmental Studies Hybridoma Bank | ABL-93 |
| 抗人LAMP2抗体 | Developmental Studies Hybridoma Bank | A4B4 | |
| 免疫印迹 | 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma | T9026 |
| 抗FLAG抗体 | Sigma | F1804 | |
| 免疫荧光 | 抗PMP70抗体 | Sigma | SAB4200181 |
| 免疫共沉淀 | 抗FLAG M2亲和凝胶 | Sigma | -- |
| 质粒转染 | Effectene转染试剂 | QIAGEN | -- |
| 缺氧处理 | 缺氧细胞培养箱 | Thermo Scientific | Heracell 150i |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 氨基酸饥饿与再添加实验 | 饥饿时间1小时,再添加时间30分钟,培养基含10%透析FBS,MEFs细胞 阅读提示:Methods 'Cell treatments and media composition'及Figure 1a,b图注 |
| 血清饥饿与胰岛素刺激实验 | 血清饥饿16小时,胰岛素浓度1 μM,处理15分钟,存在氨基酸 阅读提示:Methods 'Cell treatments and media composition'及Figure 1c,d图注 |
| 多种应激处理 | 高渗NaCl增加33-200 mM 15分钟;2-DG 30分钟;pH 7.4-9.4 30分钟;缺氧1% O2;CoCl2 24小时 阅读提示:Methods 'Cell treatments and media composition'及Figure 3、4、5图注 |
| 免疫荧光共定位量化 | 每个条件3-5张共聚焦图像,20-40个细胞,Manders系数自动Costes阈值 阅读提示:Methods 'Quantification of co-localization' |
| TSC2与Rag GTPase共免疫沉淀 | 转染FLAG-RagA或FLAG-RagC,24-48小时后裂解,抗FLAG免疫沉淀 阅读提示:Methods 'Co-immunoprecipitation'及Supplementary Fig. 9 |