比较免疫健全与免疫缺陷宿主的铜死亡疗效
探究TME和抗肿瘤免疫是否影响铜死亡诱导剂的抗肿瘤效果。
将多种小鼠癌细胞系皮下或原位植入免疫缺陷与同系免疫健全宿主,给予铜负载elesclomol或溶剂对照,检测肿瘤生长、体重及铜死亡标志(脂酰化蛋白、Cu+、DLAT焦点、SDHB)。
Cuproptosis-immunity crosstalk informs strategy to overcome immunotherapy resistance.
多细胞系与多类小鼠肿瘤模型,结合功能、遗传、代谢、分子机制及患者样本验证
MC38、393P、LKR13、4T1、EMT6、LLC、PAN02及344SQ_R小鼠同种移植瘤模型 OE33、Hs578T人癌细胞及OE33异种移植模型 MMTV-PyMT自发性乳腺癌模型 NSCLC患者肿瘤样本及公共免疫治疗队列数据
elesclomol-CuCl2体内给药:elesclomol 25 mg/kg、CuCl2 0.5 mg/kg,腹腔注射 CD8+ T细胞、IFN-γ、CD4+ T细胞、NK细胞或DC缺失/中和的分组对照 STAT1、IRF1、FDX1敲除或回补对铜死亡敏感性的影响 抗PD-L1 100 μg/只每3天,联合elesclomol+CuGlu2(12.5 mg/kg口服)观察协同 铜死亡标志检测:蛋白脂酰化、Cu+探针、DLAT焦点及SDHB丢失
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究TME和抗肿瘤免疫是否影响铜死亡诱导剂的抗肿瘤效果。
将多种小鼠癌细胞系皮下或原位植入免疫缺陷与同系免疫健全宿主,给予铜负载elesclomol或溶剂对照,检测肿瘤生长、体重及铜死亡标志(脂酰化蛋白、Cu+、DLAT焦点、SDHB)。
判断铜死亡是否具备ICD特征并能引发保护性抗肿瘤免疫。
检测铜死亡癌细胞DAMPs(胞外ATP、HMGB1释放、钙网蛋白暴露、IFN-β),并采用预防性疫苗接种模型比较铜死亡细胞与其他死亡方式细胞的免疫保护作用。
明确铜死亡是否通过DC成熟和交叉致敏增强抗原特异性CD8+ T细胞应答。
利用CyTOF、流式检测TME和引流淋巴结DC亚群、成熟标志、抗原交叉呈递及tetramer+ CD8+ T细胞,并用CD11c-DTR小鼠DC清除验证DC依赖性。
确定哪种免疫细胞和细胞因子增强肿瘤细胞对铜死亡的敏感性。
在荷瘤小鼠中清除CD8+ T、CD4+ T或NK细胞,或中和IFN-γ/TNFα;体外用活化CD8+ T细胞上清或IFN-γ处理癌细胞并结合铜死亡诱导剂,检测细胞死亡、Cu+和DLAT焦点;在OE33异种移植中联合IFN-γ与elesclomol-CuCl2。
阐明IFN-γ增敏铜死亡的分子通路及FDX1的转录调控。
在MC38同系肿瘤中敲除STAT1或IRF1,检测FDX1表达、脂酰化、Cu+和DLAT焦点;在人癌细胞中敲除JAK1、STAT1、IRF1或FDX1并进行回补;用ChIP-qPCR、荧光素酶报告基因及HAP1启动子缺失验证IRF1结合FDX1启动子。
检验增强抗肿瘤免疫能否进一步放大肿瘤铜死亡并克服免疫治疗耐药。
在MC38、EMT6、MMTV-PyMT、4T1、393P、LLC、PAN02及344SQ_R等模型中联合elesclomol+CuGlu2与抗PD-L1,检测肿瘤生长、转移、免疫细胞组成、PD-L1、IRF1、FDX1、脂酰化、Cu+和DLAT焦点,并用Bliss独立模型评估协同。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| Dulbecco改良Eagle培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Sigma | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| Waymouth培养基 | Gibco | -- | |
| 乳腺上皮细胞生长培养基BulletKit | Lonza | -- | |
| Iscove改良Dulbecco培养基 | Gibco | -- | |
| X-VIVO 15无血清造血细胞培养基 | Lonza | -- | |
| 人血清 | Sigma | H3667 | |
| Matrigel基底膜基质 | Corning | 354234 | |
| 药物处理 | 埃勒斯克洛莫 | Selleckchem | S1052 |
| 埃勒斯克洛莫 | MedChemExpress | HY-12040 | |
| D-葡萄糖酸铜(II) | Sigma | 344419 | |
| 浴铜灵二磺酸二钠盐 | Sigma | B1125 | |
| 盐酸多柔比星 | Selleckchem | S1208 | |
| 米托蒽醌 | Selleckchem | S2485 | |
| Ferrostatin-1 | Sigma | SML0583 | |
| Necrostatin 2外消旋体 | Selleckchem | S8641 | |
| Z-VAD-fmk | Selleckchem | S7023 | |
| PX-478 | MedChemExpress | HY-10231 | |
| 鱼藤酮 | MedChemExpress | HY-B1756 | |
| 白喉毒素 | Sigma | D0564 | |
| 重组人IFN-γ | R&D Systems | 285-IF-100 | |
| 重组小鼠IFN-γ | R&D Systems | 485-MI-100 | |
| 重组人IL-2 | ThermoFisher | 200-02-10UG | |
| 细胞培养 | 小鼠M-CSF重组蛋白 | ThermoFisher | 315-02-50UG |
| 小鼠GM-CSF重组蛋白 | ThermoFisher | 315-03-20UG | |
| Cu+检测 | 铜离子探针CopperSensor-1 | TRC | TRC-B874740 |
| 细胞死亡检测 | 碘化丙啶 | ThermoFisher | P3566 |
| 氧消耗检测 | 细胞外氧消耗检测试剂盒 | Cayman | 502880 |
| DAMPs检测 | RealTime-Glo细胞外ATP检测 | Promega | GA5010 |
| 小鼠HMGB-1 ELISA试剂盒 | Invitrogen | EEL102 | |
| 小鼠IFN-β高灵敏ELISA试剂盒 | PBLAssaySCI | 42410 | |
| 吞噬实验 | Vybrant吞噬实验试剂盒 | ThermoFisher | V6694 |
| 流式分析 | Zombie Violet可固定活力检测试剂盒 | BioLegend | 423114 |
| BD Cytofix/Cytoperm固定/透化试剂盒 | BD Biosciences | 554714 | |
| Cell-ID顺铂活性染料 | Fluidigm | 201195 | |
| 大鼠抗小鼠CD16/CD32 Fc封闭抗体 | BD Biosciences | 553142 | |
| 抗小鼠PD-L1体内抗体 | BioXcell | BE0101 | |
| 抗小鼠IFN-γ体内抗体 | BioXcell | BE0055 | |
| 抗小鼠CD8α体内抗体 | BioXcell | BE0061 | |
| 抗小鼠CD4体内抗体 | BioXcell | BE0003-1 | |
| 抗小鼠NK1.1体内抗体 | BioXcell | BE0036 | |
| 抗小鼠CSF1R体内抗体 | BioXcell | BP0213 | |
| 抗小鼠TNFα体内抗体 | BioXcell | BE0058 | |
| Western blot | 抗硫辛酸兔多克隆抗体 | Millipore | 437695 |
| DLAT小鼠单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 12362 | |
| FDX1抗体 | Abcam | ab108257 | |
| LIAS抗体 | Proteintech | 11577-1-AP | |
| MTF1抗体 | Proteintech | 25383-1-AP | |
| IRF-1兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 8478 | |
| STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 14994 | |
| JAK1兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3344 | |
| 小鼠抗Vinculin单克隆抗体 | Sigma | V4505 | |
| β-肌动蛋白小鼠单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| 免疫组化 | SDHB抗体 | Proteintech | 10620-1-AP |
| PD-L1抗体 | Cell Signaling Technology | 13684T | |
| HIF-1α抗体 | Cell Signaling Technology | 48085 | |
| 免疫荧光 | HMGB1抗体 | Abcam | ab18256 |
| 钙网蛋白PE抗体 | Novus | FAB38981P | |
| Alexa Fluor 488山羊抗小鼠IgG二抗 | ThermoFisher | A-11029 | |
| Alexa Fluor 594山羊抗兔IgG二抗 | ThermoFisher | A-11037 | |
| 流式分析 | 小鼠H-2Db Adpgk新表位四聚体-PE | MBL Life Science | TC-5113-1 |
| OVA257-264肽结合H-2Kb单克隆抗体-APC | ThermoFisher | 17-5743-80 | |
| qPCR | iScript逆转录预混液 | Bio-Rad | 1708841 |
| SYBR GreenER通用qPCR预混液 | Invitrogen | 11762-100 | |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9003 |
| ChIP级Protein G磁珠 | Cell Signaling Technology | 9006 | |
| 荧光素酶报告基因 | Dual-Glo荧光素酶检测系统 | Promega | E2920 |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | ThermoFisher | 11668030 | |
| 突变构建 | Q5定点突变试剂盒 | NEB | E0554S |
| RNAscope | RNAscope 2.5 HD棕色检测试剂盒 | Advanced Cell Diagnostics (ACD) | 322300 |
| RNAscope mFDX1探针 | Advanced Cell Diagnostics (ACD) | 1835431-C1 | |
| 蛋白质定量 | Pierce BCA蛋白检测试剂盒 | ThermoFisher | 23227 |
| 单细胞捕获 | PIPseq T100 3′单细胞捕获裂解试剂盒 | Fluent BioSciences | FB0004734 |
| 单细胞测序 | PIPseq T100 3′单细胞测序试剂盒 | Fluent BioSciences | FB0004621 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 免疫健全与免疫缺陷宿主铜死亡疗效比较 | 肿瘤细胞接种数量(如393P 5×10^6、MC38 1×10^6、4T1 4×10^5)、宿主品系、elesclomol–CuCl2剂量25 mg/kg与0.5 mg/kg腹腔注射、每组肿瘤数n=6 阅读提示:Methods“Animal studies”及Figure 1图注 |
| 铜死亡作为ICD的预防性疫苗接种 | 疫苗细胞处理方式与剂量(2 h pulse 200 nM elesclomol–2 μM CuCl2;米托蒽醌1 μM;丝裂霉素C 30 μM;冻融3次)、接种1×10^6细胞、挑战2×10^5活MC38细胞、间隔1周 阅读提示:Methods“Prophylactic vaccination assay”及Figure 2H–2J图注 |
| DC依赖性验证 | CD11c-DTR小鼠白喉毒素5 ng/g每3天、DC清除持续时间及对照设置 阅读提示:Methods“Animal studies”DC清除部分及Figure 2P–2Q图注 |
| CD8+ T细胞、IFN-γ及FDX1机制验证 | 各中和/清除抗体剂量与给药频次、STAT1/IRF1/FDX1 sgRNA敲除与回补、IFN-γ处理浓度与时间 阅读提示:Methods“Animal studies”“Constructs and CRISPR-Cas9”及Figure 4–5图注 |
| 铜死亡诱导剂联合抗PD-L1的耐药模型验证 | elesclomol 25 mg/kg腹腔注射与CuGlu2 12.5 mg/kg口服每3天、抗PD-L1 100 μg/只每3天、IgG1同型对照、Bliss独立模型协同评分时间点 阅读提示:Methods“Animal studies”及Figure 6–7、Figure S7B图注 |