构建小胶质细胞特异性Syk敲除的5×FAD小鼠
验证SYK在Aβ病理下小胶质细胞反应中的作用。
将Sykfl/fl与Cx3cr1CreERT2小鼠杂交,再与5×FAD杂交,通过TAM饮食诱导Syk缺失。
TREM2 drives microglia response to amyloid-β via SYK-dependent and -independent pathways.
包含体外原代小胶质细胞与BMDM模型、5×FAD及多种基因修饰小鼠模型、scRNA-seq、TEM、行为学等多种独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
5×FAD小鼠模型 原代小鼠小胶质细胞 原代小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM)
小胶质细胞特异性Syk敲除(SykiΔMG)及对照Sykfl/fl与5×FAD的杂交 TAM诱导删除的时间窗口(1月龄或4月龄开始,持续4周) Aβ吞噬检测:methoxy-X04体内注射(10 mg/kg,腹腔注射,3小时后取材) 抗CLEC7A抗体2A11的给药方案(8月龄TREM2R47H-5×FAD小鼠,10天内4次腹腔注射) scRNA-seq数据质控与聚类阈值(UMI 2000–20000,基因数>1000,线粒体<7.5%)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SYK在Aβ病理下小胶质细胞反应中的作用。
将Sykfl/fl与Cx3cr1CreERT2小鼠杂交,再与5×FAD杂交,通过TAM饮食诱导Syk缺失。
检测SYK缺失是否影响小胶质细胞围绕Aβ斑块及吞噬Aβ的能力。
免疫荧光染色、流式细胞术检测methoxy-X04+小胶质细胞、原代小胶质细胞吞噬pHrodo-Aβ1–42实验。
确定SYK缺失是否加重Aβ沉积、神经轴突损伤和认知行为缺陷。
Aβ1–42免疫荧光、LAMP1染色、Morris水迷宫和高架十字迷宫行为学测试。
探究SYK缺失导致小胶质细胞代谢缺陷的机制。
免疫印迹检测pAKT、pNDRG1、pGSK3β、pS6K、LC3II/LC3I,MitoTracker Green检测线粒体质量,TEM观察自噬体。
明确SYK缺失如何影响DAM及相关亚群的分化轨迹。
对6月龄小鼠皮层CD45+细胞进行10x Genomics scRNA-seq,聚类分析并与Trem2−/−数据比较。
检验TREM2是否通过DAP10介导SYK非依赖的小胶质细胞活化。
使用Dap10−/−小胶质细胞和BMDM,进行BrdU增殖、AKT/GSK3β免疫印迹、存活实验和Aβ吞噬实验。
评估通过CLEC7A激活SYK能否改善低功能TREM2变异小鼠的小胶质细胞反应。
腹腔注射抗CLEC7A抗体2A11或同型对照,流式检测Aβ吞噬,免疫荧光检测Iba1和CD11c,qRT-PCR检测Itgax。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 流式分析 | CD45-PE抗体 | BioLegend | 103106 |
| CD45-APCCy7抗体 | BioLegend | 103116 | |
| CD11b-APC抗体 | BioLegend | 101212 | |
| Ly6C-APCCy7抗体 | BioLegend | 128026 | |
| Ly6G-FITC抗体 | BioLegend | 127606 | |
| P2RY12-BV421抗体 | BioLegend | 392106 | |
| Syk-PE抗体 | BioLegend | 646004 | |
| BrdU-PE抗体 | BioLegend | 339812 | |
| 免疫印迹 | 抗磷酸化Syk抗体 | Cell Signaling Technology | 2717 |
| 抗Syk抗体 | Cell Signaling Technology | 13198 | |
| 抗磷酸化Akt 473抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 抗磷酸化NDRG1抗体 | Cell Signaling Technology | 3217 | |
| 抗NDRG1抗体 | Cell Signaling Technology | 5196 | |
| 抗磷酸化GSK3-β抗体 | Cell Signaling Technology | 9336 | |
| 抗GSK3-β抗体 | Cell Signaling Technology | 12456 | |
| 抗磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| 抗ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 抗磷酸化S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 9234 | |
| 抗S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 9202 | |
| 抗LC3抗体 | Cell Signaling Technology | 2775 | |
| 抗β-actin-HRP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 HRP | |
| 抗兔IgG HRP | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 免疫荧光 | 抗Iba1抗体 | Cell Signaling Technology | 17198 |
| 抗Iba1抗体 | Abcam | 5076 | |
| 抗CD68抗体 | BioLegend | 137002 | |
| 抗Pu.1抗体 | Cell Signaling Technology | 2258 | |
| 抗Aβ1–42抗体 | Thermo Fisher Scientific | 700254 | |
| 抗Aβ1–16抗体(6E10) | BioLegend | 803013 | |
| 抗Lamp1抗体 | BioLegend | 121602 | |
| 抗APP抗体 | Millipore | MAB348 | |
| 抗LC3-Alexa Fluor® 488抗体 | Cell Signaling Technology | 13082 | |
| 抗CD11c抗体 | Cell Signaling Technology | 97585 | |
| 抗CD74-Alexa Fluor® 647抗体 | BioLegend | 151004 | |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | 15580 | |
| 抗ApoE抗体(生物素化HJ6.3) | Holtzman Lab | -- | |
| 抗Trem2抗体 | R&D Systems | AF1729 | |
| 抗Tmem119抗体 | Cell Signaling Technology | 90840 | |
| 抗Clec7a抗体 | InvivoGene | mabg-mmcl | |
| 抗山羊IgG Alexa-Fluor®488抗体 | Abcam | 150129 | |
| 抗兔IgG Alexa Fluor® 555抗体 | Abcam | 150074 | |
| 抗山羊IgG Alexa Fluor® 647抗体 | Abcam | 150131 | |
| 抗兔IgG Alexa Fluor® 647抗体 | Invitrogen | A-21244 | |
| 抗大鼠IgG Alexa Fluor®647抗体 | Invitrogen | A-21472 | |
| 抗绵羊IgG Alexa Fluor® 555抗体 | Abcam | 150178 | |
| 链霉亲和素-Alexa Fluor® 647 | BioLegend | 405237 | |
| 抗CLEC7A刺激 | 山羊F(ab’)2抗小鼠IgG(H+L)抗体 | SouthernBiotech | 1032–01 |
| 细胞培养与检测 | MitoTracker Green | Invitrogen | M7514 |
| 流式分析 | Aqua荧光反应染料 | Life technologies | L34966 |
| Aβ吞噬检测 | Methoxy-X04 | Tocris Biosciences | 4920 |
| 细胞存活实验 | 碘化丙啶 | Invitrogen | P1304MP |
| 细胞增殖实验 | BrdU | Invitrogen | B23151 |
| Aβ吞噬检测 | β-淀粉样蛋白(1–42)肽 | Anaspec | AS-20276 |
| 免疫印迹 | SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | 34579 |
| 免疫荧光 | TO-PRO-3碘化物 | Life Technologies | T3605 |
| 细胞存活实验 | BAY61–3606 | Selleckchem | S7006 |
| SB216763 | Tocris Biosciences | 1616 | |
| 流式分析 | Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | Invitrogen | 00-5523-00 |
| 细胞增殖实验 | BD Pharmingen BrdU流式试剂盒 | BD Biosciences | 557892 |
| Aβ吞噬检测 | pHRodo iFL标记试剂盒 | Invitrogen | P36014 |
| RNA提取 | miRNeasy Mini试剂盒 | QIAGEN | 217084 |
| qRT-PCR | High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 |
| SYBR Green实时PCR预混液 | Thermo Fisher Scientific | 4309155 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小胶质细胞特异性Syk敲除 | TAM饮食诱导时间(1月龄或4月龄开始,持续4周)及取材月龄(6或9月龄) 阅读提示:Methods:Mice小节;Figure 1B和S4A实验设计示意图 |
| Aβ吞噬检测 | methoxy-X04剂量(10 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、取材时间(3小时后) 阅读提示:Methods:Mice小节;Figure 1G-H图注 |
| 原代小胶质细胞培养 | P4小鼠脑组织、胰酶浓度(1.67 mg/mL)、DNase浓度(0.33 mg/mL)、LCCM浓度(10%) 阅读提示:Methods:Primary cells小节 |
| 抗CLEC7A抗体2A11治疗 | 给药剂量(文中未明确说明)、给药频率(10天内4次或单次)、小鼠月龄(8月龄)及对照抗体(抗人ILT1) 阅读提示:Methods:Mice小节;Figure 7C-D和7E图注 |
| scRNA-seq数据分析 | 质控阈值(UMI 2000–20000,基因数>1000,线粒体<7.5%)、聚类分辨率(0.6或0.4)、每个基因型小鼠数(n=2–4) 阅读提示:Methods:Single-cell RNAseq analysis小节;Figure 4A、5A、6A图注 |
| 行为学测试 | 各基因型样本量、测试顺序、MWM训练方案(5天,每天两组两次试验) 阅读提示:Methods:General design of behavioral tests及Morris water maze小节;Figure 2E-J图注 |