SarA与gp130序列同源及功能互换验证
验证SarA的GBS序列与gp130胞内域同源且功能可互换。
通过序列比对识别SarA的39氨基酸GBS序列(aa140-178),构建SarA-gp130嵌合体,在HeLa细胞中转染并检测STAT3磷酸化;用嵌合体互补ΔsarA沙门菌,检测STAT3磷酸化、IL-10诱导及小鼠竞争感染中的毒力。
The Salmonella Secreted Effector SarA/SteE Mimics Cytokine Receptor Signaling to Activate STAT3.
体外人细胞系、细菌感染模型、小鼠体内竞争感染及多种生化验证,包含功能与机制验证
HeLa细胞 LCL GM19154 C57BL/6J小鼠腹腔感染模型 鼠伤寒沙门菌14028s
SarA Y167磷酸化位点及YxxQ基序完整性 SarA与STAT3结合亲和力:pSarA肽Kd约142.7 nM,pgp130肽Kd约2289 nM SarA激活STAT3依赖GSK-3活性而不依赖JAK活性 SarA Y167F突变体在感染中降低STAT3磷酸化和IL-10诱导 小鼠腹腔感染竞争指数:WT与ΔsarA或突变株1:1混合,感染后4天检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SarA的GBS序列与gp130胞内域同源且功能可互换。
通过序列比对识别SarA的39氨基酸GBS序列(aa140-178),构建SarA-gp130嵌合体,在HeLa细胞中转染并检测STAT3磷酸化;用嵌合体互补ΔsarA沙门菌,检测STAT3磷酸化、IL-10诱导及小鼠竞争感染中的毒力。
确定SarA在YxxQ基序的宿主磷酸化及其对STAT3结合和活性的必要性。
通过IP-MS和靶向PRM-MS检测SarA磷酸化,构建Y167F突变体,在HeLa细胞中检测STAT3结合和磷酸化,在感染模型中检测IL-10诱导和小鼠毒力互补。
量化SarA和gp130的YxxQ磷酸肽与STAT3的结合亲和力差异。
纯化6xHis-STAT3136-705,用ITC测量其与SarA、pSarA、gp130和pgp130肽的结合。
确定SarA激活STAT3是否需要JAK或GSK-3。
使用JAK抑制剂(Midostaurin、JAK Inhibitor I、Ruxolitinib)和GSK-3抑制剂(GSK-3 Inhibitor XIII、CHIR-98014)处理细胞,结合RNAi敲低JAK1/2或GSK3A/B,检测STAT3磷酸化和IL-10;通过coIP验证SarA与GSK-3的相互作用。
初步探究GSK-3是否也调节gp130介导的STAT3激活。
在LCL GM19154中用IL-6刺激,比较JAK抑制剂和GSK-3抑制剂对STAT3磷酸化的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Invitrogen | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 质粒转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | ThermoFisher | L3000008 |
| 定点突变 | Quikchange Lightning定点突变试剂盒 | Agilent | 210518 |
| 免疫印迹 | 抗FLAG M2抗体 | Sigma | F3165 |
| 抗磷酸化STAT3 Y705克隆D3A7抗体 | CST | 9145 | |
| 抗STAT3克隆124H6抗体 | CST | 9139 | |
| 抗GFP克隆D5.1抗体 | CST | 2956 | |
| 抗GSK-3α克隆D80E6抗体 | CST | 4337 | |
| 抗GSK-3β克隆D5C5Z抗体 | CST | 12456 | |
| 抗磷酸酪氨酸-1000单克隆抗体混合物 | CST | 8954 | |
| 免疫沉淀 | 抗FLAG M2磁珠 | Millipore Sigma | M8823 |
| 细胞处理 | JAK1抑制剂I | SCBT | sc-204021 |
| 鲁索替尼 | APExBIO | A3012 | |
| CHIR-98014 | Selleckchem | S2745 | |
| GSK-3抑制剂XIII | SCBT | sc-203987 | |
| 制瘤素M | PeproTech | 300-10 | |
| 白细胞介素-6 | PeproTech | 200-06 | |
| 白细胞介素-21 | PeproTech | 200-21 | |
| ELISA | 人IL-10酶联免疫吸附测定试剂盒 | R&D systems | DY217B |
| 蛋白质纯化 | 镍-次氮基三乙酸树脂 | Qiagen | -- |
| Superdex S200凝胶过滤柱 | GE Healthcare | -- | |
| 等温滴定量热法 | VP-ITC等温滴定量热仪 | Malvern Panalyticals | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与感染 | HeLa细胞和LCL GM19154的来源、培养基、传代条件;感染MOI(HeLa MOI 5,LCL MOI 30);庆大霉素处理浓度和时间(1 hpi 50 μg/mL,2 hpi稀释至15 μg/mL) 阅读提示:STAR Methods中Human Cells和Infection assays小节 |
| 质粒转染 | HeLa细胞接种密度(1.75×10^5/孔)、转染试剂Lipofectamine 3000、质粒用量(5 μg)、转染后24小时收样 阅读提示:STAR Methods中Transfections小节 |
| 抑制剂处理 | JAK抑制剂和GSK-3抑制剂的种类、浓度、预处理时间;细胞类型和刺激条件 阅读提示:STAR Methods中Cellular treatments小节及图4图注 |
| 小鼠竞争感染 | 小鼠品系(C57BL/6J)、周龄(10-18周)、注射剂量(1,000 CFUs)、菌株混合比例(1:1)、感染后天数(4天)、组织处理 阅读提示:STAR Methods中Mouse Infections小节和图1G、2I、2J图注 |
| 等温滴定量热法 | STAT3浓度(60 μM单体)、肽浓度(600 μM)、注射体积(8 μL)、温度(25°C)、重复次数(3-5次) 阅读提示:STAR Methods中Isothermal Titration Calorimetry小节和图3图注 |