受体表达分析
确定LTβR和HVEM在人及小鼠ASM上的表达水平及其与哮喘的相关性。
通过分析公开RNA-seq数据和流式细胞术,比较健康与哮喘ASM中LTβR、HVEM及其他细胞因子受体的表达。
Lymphotoxin beta receptor signaling directly controls airway smooth muscle deregulation and asthmatic lung dysfunction
包含条件性敲除小鼠体内实验、人ASM体外功能实验(收缩、增殖、迁移、信号通路)及转录组数据分析等多个独立证据层级,并明确功能与机制验证。
人原代气道平滑肌细胞(健康与哮喘供体) 平滑肌特异性LTβR条件性敲除小鼠(smMHCCreLTβRfl/fl) 平滑肌特异性HVEM条件性敲除小鼠(smMHCCreHVEMfl/fl) 屋尘螨诱导的哮喘小鼠模型
LTβR在ASM上的表达是否被有效敲除(流式细胞术验证) 过敏原(HDM)给药方案:200 μg第0天,100 μg第7、14天,之后50 μg每周两次,共6周 LIGHT给药方案:气管内注射10 μg重组LIGHT(第1、2天),第3天分析 AHR测量:不同浓度乙酰甲胆碱诱导的肺阻力,通过FlexiVent系统记录
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定LTβR和HVEM在人及小鼠ASM上的表达水平及其与哮喘的相关性。
通过分析公开RNA-seq数据和流式细胞术,比较健康与哮喘ASM中LTβR、HVEM及其他细胞因子受体的表达。
在体内评估ASM特异性LTβR或HVEM缺失对过敏原诱导的ASM重塑和AHR的影响。
使用smMHCCreLTβRfl/fl和smMHCCreHVEMfl/fl小鼠,经屋尘螨提取物慢性攻击6周,通过共聚焦显微镜、流式细胞术和FlexiVent系统评估ASM质量、数量和AHR。
确定LIGHT是否通过LTβR直接驱动ASM肥大和AHR。
向对照和条件性敲除小鼠气管内注射重组LIGHT,3天后分析ASM质量和AHR。
验证LIGHT-LTβR信号对人ASM收缩、增殖和肥大的直接作用。
培养人原代ASM,用LIGHT刺激,进行胶原凝胶收缩实验、BrdU增殖实验和细胞体积测量。
阐明LIGHT-LTβR诱导的非经典NF-κB信号在ASM功能障碍中的作用。
通过Western blot、免疫沉淀、共聚焦显微镜和凝胶收缩实验,检测非经典NF-κB(p100/p52)激活,以及下游Rac1/PAK1、MLC磷酸化和F-肌动蛋白聚合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | C57BL/6J小鼠 | Jackson Laboratory | -- |
| smMHC(Myh11)/Cre/eGFP转基因小鼠 | Jackson Laboratory | B6.Cg-Tg(Myh11-cre,-EGFP)2Mik/J | |
| 过敏原暴露 | 屋尘螨提取物 | Greer Laboratories | -- |
| 药物处理 | 重组LIGHT | R&D Systems | -- |
| 细胞培养 | 平滑肌细胞培养基 | ScienCell | -- |
| 人气道平滑肌细胞 | ScienCell | 3400 | |
| 人气道平滑肌细胞 | Lonza | 00194850 | |
| 信号通路抑制 | NIK抑制剂 | MedChemExpress | -- |
| BAY11-7082 | MedChemExpress | -- | |
| NSC 23766 | Tocris | -- | |
| siRNA转染 | ON-TARGETplus siRNA | Dharmacon | -- |
| siRNA寡核苷酸双链体 | Origene | -- | |
| HiPerFect转染试剂 | Qiagen | -- | |
| 胶原凝胶收缩实验 | 胶原收缩检测试剂盒 | Cell Biolabs | -- |
| 免疫荧光染色 | 鬼笔环肽-AlexaFluor 568 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Hoechst 33342 | BD Bioscience | -- | |
| 抗α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Abcam | -- | |
| Western blot | 抗p-NFκB p65一抗 | Cell Signaling Technology | 3033 |
| 抗NFκB p65一抗 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 抗NFκB p100/52一抗 | Cell Signaling Technology | 3017 | |
| 抗PAK1一抗 | Cell Signaling Technology | 2602 | |
| 抗p-MYPT(Thr696)一抗 | Cell Signaling Technology | 5163 | |
| 抗p-MLC2一抗 | Cell Signaling Technology | 3672 | |
| 抗MLC2一抗 | Cell Signaling Technology | 8505 | |
| 抗p-PAK1一抗 | Santa Cruz | 135755 | |
| 抗MYPT一抗 | Santa Cruz | 514261 | |
| HRP标记的抗小鼠IgG二抗 | Santa Cruz | 516102 | |
| HRP标记的抗兔IgG二抗 | Santa Cruz | 2357 | |
| ECL Prime Western印迹检测试剂 | GE Health Care | -- | |
| Restore Western印迹剥离缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| GAPDH抗体 | Santa Cruz | -- | |
| 免疫沉淀 | Active Rac1检测试剂盒 | Cell Signaling Technology | -- |
| RT-PCR | RNeasy试剂盒 | Qiagen | -- |
| SuperScript IV逆转录酶试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PowerUp SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| LightCycler | Roche | -- | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD45单克隆抗体 | BD Biosciences | clone:30-F11 |
| 抗小鼠CD11b单克隆抗体 | BD Biosciences | clone:M1/70 | |
| 抗小鼠CD11c单克隆抗体 | BD Biosciences | clone:HL3 | |
| 抗小鼠SiglecF单克隆抗体 | BD Biosciences | clone: | |
| 抗小鼠EpCAM单克隆抗体 | BioLegend | clone:G8.8 | |
| 抗小鼠CD31单克隆抗体 | BioLegend | clone:390 | |
| 抗小鼠PDGFRα单克隆抗体 | BioLegend | clone:1A4/asm-1 | |
| 抗小鼠Mcam单克隆抗体 | BioLegend | clone:ME-9F1 | |
| 抗小鼠波形蛋白单克隆抗体 | R&D | clone:280618 | |
| 抗小鼠αSMA单克隆抗体 | Novus | clone:1A4/asm-1 | |
| Fixable Aqua死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher | -- | |
| Foxp3转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | -- | |
| Fortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| FlowJo软件 | FlowJo, LLC | version | |
| 流式分析(人ASM) | 抗人LTβR单克隆抗体 | BioLegend | clone:31G4D8 |
| 抗人HVEM单克隆抗体 | BioLegend | clone:122 | |
| BAL细胞因子检测 | 小鼠IL-4 ELISA试剂盒 | R&D | -- |
| 小鼠IL-5 ELISA试剂盒 | R&D | -- | |
| 小鼠IL-13 ELISA试剂盒 | R&D | -- | |
| 肺组织解离 | gentleMACS解离器 | Miltenyi Biotec | -- |
| 肺解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 免疫荧光染色 | OCT包埋剂 | -- | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| 细胞培养 | I型胶原溶液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 抑制剂处理 | NIK抑制剂 | MedChemExpress | -- |
| BAY11-7082 | MedChemExpress | -- | |
| NSC 23766 | Tocris | -- | |
| 蛋白质分析 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | -- | |
| WedgeWell 8-16% Tris-甘氨酸梯度凝胶 | Novex | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 脱脂奶粉 | R&D | -- | |
| 凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞增殖检测 | FITC BrdU流式试剂盒 | BD Bioscience | -- |
| 共聚焦显微镜 | 蔡司780激光扫描共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 蔡司880 Airyscan激光扫描共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 图像分析 | imaris软件 | Bitplane | -- |
| ImageLab | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| ImageJ软件 | -- | -- | |
| Zen软件 | -- | -- | |
| Image Pro Premier 10 | Media Cybernetics | -- | |
| 动物实验 | FlexiVent系统 | SCIREQ Inc | -- |
| flexiWare软件V8 | Scireq | -- | |
| RT-PCR引物 | GAPDH引物 | -- | -- |
| HVEM引物 | -- | -- | |
| LTβR引物 | -- | -- | |
| RT-PCR | 人MAP3K14设计引物 | Bio-Rad | -- |
| 统计 | Prism 8软件 | GraphPad Prism | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、性别:C57BL/6J背景,6-8周龄雌性;smMHCCreLTβRfl/fl和smMHCCreHVEMfl/fl小鼠的构建与基因型确认 阅读提示:Methods - Mice |
| 过敏原诱导哮喘模型 | HDM给药方案:200 μg第0天,100 μg第7、14天,之后50 μg每周两次,共4周(总6周);给药途径:鼻内 阅读提示:Methods - Mouse models of airway remodeling and acute airway inflammation |
| LIGHT处理 | 重组LIGHT剂量:10 μg/只,气管内注射第1、2天,第3天分析;对照:PBS 阅读提示:Methods - Mouse models of airway remodeling and acute airway inflammation |
| AHR测量 | 乙酰甲胆碱剂量梯度;FlexiVent系统测量肺阻力;峰值气道阻力分析 阅读提示:Methods - Airway hyperresponsiveness |
| ASM形态定量 | 共聚焦显微镜参数:Zeiss 780/880,40x(1.4na)物镜,0.421 μm步长,2048×2048帧;分析15-20 μm厚肺组织,平均35层;每只小鼠10-15个三级支气管 阅读提示:Methods - Confocal microscopy of lung tissue |
| 人ASM体外实验 | ASM来源:ScienCell(cat:3400)、Lonza(cat: 00194850)或尸体肺组织;培养条件:平滑肌细胞培养基,2-4代;刺激浓度:100 ng/ml LIGHT;血清饥饿16小时或7天 阅读提示:Methods - ASM culture and analysis |
| 胶原凝胶收缩实验 | 细胞密度:0.5-1×10^6细胞/孔;胶原凝胶制备;LIGHT刺激浓度:100 ng/ml;观察时间点:24、48、72小时 阅读提示:Methods - ASM gel contraction assay |
| 信号通路研究 | 抑制剂浓度:NIK-SMI(25 nM)、BAY11-7082(1 nM)、Rac1抑制剂(10 nM);siRNA敲低LTβR、HVEM、NIK(50 nM);Western blot检测p100/p52、p-MLC等 阅读提示:Methods - ASM intracellular protein analysis, Western Blotting, RT-PCR |