验证EGFR在TKI耐药细胞中的TKI不敏感存活作用
探究EGFR敲低与激酶抑制对TKI耐药细胞存活的不同影响
在H1650、H1975、H820及15个HCC827 GR克隆中比较EGFR shRNA敲低与吉非替尼/厄洛替尼处理对细胞生长及下游Akt、Erk、RelA磷酸化的影响;回补EGFR-del19或kinase-dead突变体。
Targeting PKCδ as a Therapeutic Strategy against Heterogeneous Mechanisms of EGFR Inhibitor Resistance in EGFR-Mutant Lung Cancer.
包含体外细胞系、15个耐药克隆、异种移植瘤、PDX模型及41例患者样本IHC,并有基因敲低/回补和机制验证
H1650、HCC827、H1975、H820及H3255人NSCLC细胞系 HCC827来源的吉非替尼耐药克隆(GR细胞) H1650原位异种移植瘤及GR6原位异种移植瘤模型 TC386和TM0204患者来源异种移植(PDX)模型
H1650细胞中EGFR shRNA敲低与1 μM吉非替尼或0.1 μM厄洛替尼处理对比 15个HCC827 GR克隆在1 μM吉非替尼下连续培养>2个月后单细胞克隆化 H1650原位瘤小鼠每日5 mg/kg吉非替尼、30 mg/kg sotrastaurin或联合治疗(n=9) TC386 PDX小鼠每日5 mg/kg吉非替尼、30 mg/kg sotrastaurin或联合治疗(n=4-5) 41例配对治疗前与耐药后EGFR突变NSCLC样本的nPKCδ IHC评分
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究EGFR敲低与激酶抑制对TKI耐药细胞存活的不同影响
在H1650、H1975、H820及15个HCC827 GR克隆中比较EGFR shRNA敲低与吉非替尼/厄洛替尼处理对细胞生长及下游Akt、Erk、RelA磷酸化的影响;回补EGFR-del19或kinase-dead突变体。
鉴定连接多种TKI耐药机制的共同可靶向介导者
建立EGFR敲低耐药(EDR)H1650细胞,使用Phospho-Explorer抗体芯片比较对照、TKI处理、EGFR敲低和EDR四组磷酸化谱,筛选27个候选介导者;用IPA分析通路;通过合成致死筛选(吉非替尼联合靶向候选介导者的抑制剂)计算联合指数。
确定PKCδ是否介导TKI耐药
用shRNA敲低PKCδ并回补shRNA抗性PKCδ,检测H1650细胞对吉非替尼的敏感性;在H3255和HCC827中过表达PKCδ,检测体外和体内吉非替尼耐药;检测cPARP凋亡标志。
确定PKCδ核定位是否为TKI耐药所必需
比较GR细胞与亲本HCC827细胞中PKCδ的亚细胞分布;构建NLS突变体(NLSm1、NLSm3)并检测其对吉非替尼敏感性和下游信号的影响;检测T505磷酸化突变体定位。
阐明TKI失活EGFR如何促进PKCδ核转位
在GR4(Axl过表达)和GR10(Her-2过表达)细胞中,用免疫共沉淀检测吉非替尼诱导的EGFR与Axl/Her-2相互作用;用R428、lapatinib、U73122处理检测nPKCδ和PLCγ2磷酸化;用EGFR磷酸化抗体芯片检测EGFR酪氨酸磷酸化位点。
验证联合抑制PKCδ和EGFR对TKI耐药肿瘤的治疗效果
在H1650原位异种移植瘤、GR6原位异种移植瘤、TC386 PDX和TM0204 PDX模型中,比较吉非替尼或AZD9291单药与联合sotrastaurin的肿瘤生长和小鼠生存;检测肿瘤组织pAkt、pRelA、pErk、Ki67和nPKCδ。
验证nPKCδ在患者TKI耐药中的临床相关性
对41例配对治疗前和耐药后EGFR突变NSCLC样本进行nPKCδ IHC评分;对166例一线TKI治疗的EGFR突变NSCLC患者肿瘤样本进行nPKCδ IHC,分析其与无进展生存期的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| DMEM/F12培养基 | -- | -- | |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 吉非替尼 | LC Lab | G-4408 |
| 厄洛替尼 | LC Lab | E-4007 | |
| AZD9291 | Selleckchem | S72975 | |
| Sotrastaurin | Chemscene | SC-0090 | |
| Go6983 | R & D Systems | 2285 | |
| Enzastaurin | Selleckchem | S1055 | |
| U-73122 | Cayman Chemical | 70740 | |
| 拉帕替尼 | LC Lab | L-4804 | |
| R428 | Medchem Express | HY-15150 | |
| 细胞活力检测 | Cell Counting Kit-8试剂盒 | Donjindo | -- |
| 抗体芯片分析 | Phospho Explorer抗体芯片 | Full Moon Biosystems | PEX100 |
| 人EGFR磷酸化抗体芯片 | Abcam | AB134005 | |
| Western blot | EGFR抗体 | Thermo Fisher Scientific | MS-400 |
| EGFR磷酸化Y1068抗体 | Abcam | ab5644 | |
| EGFR磷酸化Y1086抗体 | Abcam | Ab5650 | |
| EGFR磷酸化Y1173抗体 | Cell Signaling Technology | 4407 | |
| EGFR磷酸化Y845抗体 | Cell Signaling Technology | 6963 | |
| Her2抗体 | Cell Signaling Technology | 2165 | |
| Axl抗体 | Genetex | GTX108560 | |
| 磷酸化p44/42 MAPK(Erk1/2)(Thr202/Tyr204)抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| ERK 1/2抗体 | Santa Cruz | SC-514302 | |
| 磷酸化Akt(Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 3787 | |
| Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 磷酸化NF-κB p65(Ser536)抗体 | Cell Signaling Technology | 3036 | |
| IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 9242 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A2228 | |
| α-微管蛋白抗体 | Genetex | GTX27291 | |
| Western blot、免疫荧光、免疫组化 | PKCδ抗体 | Abcam | AB182126 |
| 免疫荧光 | PKCδ抗体 | Novopro Bioscience | LS-C199448 |
| 免疫共沉淀 | PKCδ抗体 | Santa Cruz | SC-937 |
| Western blot | PKCδ磷酸化T505抗体 | Abcam | ab60992 |
| 免疫组化 | Ki67抗体 | Abcam | ab15580 |
| Western blot | 切割型PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 5625 |
| 组蛋白H3抗体 | Genetex | GTX122148 | |
| 磷酸化PLCγ1(pTyr 783)抗体 | Sigma | SAB4503827 | |
| 磷酸化PLCγ2(pTyr 759)抗体 | Cell Signaling Technology | 3874 | |
| PLCγ2抗体 | Cell Signaling Technology | 3872 | |
| 磷酸化组蛋白H2A.X(Ser139)抗体 | Cell Signaling Technology | 9718 | |
| PKC激酶活性检测 | PKC激酶活性试剂盒 | Enzo Life Sciences | ADI-EKS-420A |
| 基因敲低 | pLKO-shPRKCD #1 | Sigma-Aldrich | TRCN0000379731 |
| pLKO-shPRKCD #2 | Sigma-Aldrich | TRCN0000272637 | |
| 质粒构建 | QuikChange定点突变试剂盒 | Agilent Technologies | -- |
| 细胞系鉴定 | AmpFLSTR Identifiler PCR扩增试剂盒 | Life Technologies | -- |
| DNA提取 | QuickExtract FFPE DNA提取试剂盒 | Epicentre | -- |
| 免疫组化 | Leica Bond-MAX | Leica Microsystems GmbH | -- |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss LSM710激光显微镜 | Zeiss | -- |
| Sanger测序 | ABI 3730 XL测序仪 | Applied Biosystems | -- |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | Invitrogen | -- |
| 化学发光系统 | Pierce | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EGFR敲低与TKI处理对比实验 | EGFR shRNA序列(E1/E2)、吉非替尼1 μM、厄洛替尼0.1 μM、处理时间点、细胞计数重复数n=3 阅读提示:Figure 1 legend及STAR Methods中Constructs and shRNAs和Cell Counting and Cell Viability Assays小节 |
| HCC827 GR耐药克隆建立 | 吉非替尼浓度1 μM、连续培养时间>2个月、单细胞克隆化、亲本IC50约0.006 μM与GR克隆IC50>1 μM 阅读提示:Figure S1D legend及STAR Methods中CELL CULTURE AND GENERATION OF GR AND EDR CLONES小节 |
| 体内联合治疗实验 | 吉非替尼5 mg/kg、sotrastaurin 30 mg/kg、AZD9291 1 mg/kg、口服每周5次、每组n数(H1650 n=9;TC386 n=4-5;H1975 n=6-8;TM0204 n=5)、给药开始时肿瘤体积(TC386为150-200 mm3) 阅读提示:Figure 2F、2H、6D、6E legend及STAR Methods中TUMORIGENESIS ASSAYS AND IMMUNOHISTOCHEMICAL STAINING小节 |
| nPKCδ临床样本IHC评分 | 41例配对样本和166例队列来源、PKCδ抗体ab182126稀释1:2000、评分标准(0:0%;1:<50%;2:51-75%;3:>75%)、双病理医师独立评分 阅读提示:STAR Methods中Immunohistochemical Staining of Human NSCLC Clinical Specimens小节及Figure 6 legend |
| PKCδ NLS突变体功能验证 | NLSm1和NLSm3突变位点、转导细胞系H3255和HCC827、吉非替尼0.1 μM处理24小时、免疫荧光确认定位、激酶活性对照 阅读提示:Figure 4E、4F legend及STAR Methods中Constructs and shRNAs和Protein Kinase Cδ (PKCδ) Kinase Activity Assay小节 |