筛选脱髓鞘反应基因并鉴定Serpina3n在少突胶质细胞中的选择性诱导
寻找对炎症性脱髓鞘作出反应的基因并确定其细胞来源。
对MOG/EAE小鼠脊髓进行RNA-seq,并对MACS分选的少突胶质细胞、星形胶质细胞和小胶质细胞进行胶质类型特异性RNA-seq和RT-qPCR验证Serpina3n表达。
Injury-transduced oligodendrocytes modulate neuroinflammation and glial activation in diseased and non-diseased central nervous system.
涵盖MOG/EAE、CPZ、卒中、LPS、5xFAD、SCI、衰老及DTA遗传模型,结合scRNA-seq、RiboTag、cKO、ChIP-qPCR与体外功能验证
MOG/EAE小鼠模型 CPZ脱髓鞘小鼠模型 DTA诱导的少突胶质细胞损伤小鼠模型 20月龄衰老小鼠
少突胶质细胞特异性Serpina3n条件敲除(Olig2-Cre:Serpina3nfl/fl)在MOG/EAE、CPZ及衰老模型中的验证 Serpina3n-tdTom报告小鼠验证SERPINA3N的细胞来源 少突胶质细胞特异性Stat3条件敲除及ChIP-qPCR验证STAT3结合Serpina3n启动子Site 1 原代小胶质细胞中重组SERPINA3N(50 ng/mL)与LPS(10 ng/mL)共处理及TAK-242(0.2 μM)抑制验证 RiboTag技术比较OLs与星形胶质细胞中核糖体结合的Serpina3n mRNA翻译
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
寻找对炎症性脱髓鞘作出反应的基因并确定其细胞来源。
对MOG/EAE小鼠脊髓进行RNA-seq,并对MACS分选的少突胶质细胞、星形胶质细胞和小胶质细胞进行胶质类型特异性RNA-seq和RT-qPCR验证Serpina3n表达。
确定Serpina3n mRNA诱导是否导致蛋白上调以及SERPINA3N的细胞来源。
Western blot检测脊髓SERPINA3N蛋白,荧光免疫组化检测SERPINA3N与SOX10、GFAP、CD68、NG2、CC1、TCF7l2的共定位。
排除SERPINA3N由其他细胞产生并沉积于少突胶质细胞的可能性。
构建Serpina3n-tdTom报告小鼠和少突胶质细胞特异性Serpina3n条件敲除小鼠(Olig2-Cre:Serpina3nfl/fl),在MOG/EAE和CPZ模型中检测tdTom及SERPINA3N免疫反应性。
评估SerpinOL转变是否在不同病因的CNS损伤和衰老中保守存在。
在光血栓性卒中、LPS内毒素、5xFAD阿尔茨海默病、脊髓损伤及20月龄衰老小鼠中检测SERPINA3N与SOX10等标记的共定位。
区分神经炎症与少突胶质细胞损伤在状态转变中的作用。
使用CFA免疫和少突胶质细胞特异性NFkB持续激活(NFkB CA)小鼠诱导CNS炎症,检测Serpina3n诱导及少突胶质细胞损伤。
确定少突胶质细胞内在损伤是否为状态转变的充分条件。
利用2天CPZ早期模型和Plp-CreERT2:Rosa26-eGFP-DTA(Plp-DTA)及Aldh1l1-CreERT2:Rosa26-eGFP-DTA(Aldh1l1-DTA)遗传模型诱导细胞自主性损伤,检测SERPINA3N表达与胶质活化标志。
明确SerpinOLs的转录组特征及SERPINA3N诱导的上游机制。
对MOG/EAE脊髓进行scRNA-seq和伪批量差异分析,免疫组化检测STAT3/p-STAT3共表达,构建少突胶质细胞特异性Stat3条件敲除小鼠并用ChIP-qPCR检测STAT3与Serpina3n启动子结合。
确定少突胶质细胞来源SERPINA3N在脱髓鞘和衰老中的功能后果。
在少突胶质细胞特异性Serpina3n cKO小鼠中进行MOG/EAE和CPZ实验,结合scRNA-seq、微胶质RNA-seq、免疫组化和临床评分评估炎症、髓鞘损伤和再髓鞘化;在衰老cKO小鼠中评估胶质活化标志。
检验SERPINA3N是否直接促进小胶质细胞促炎活化及其受体机制。
在原代小胶质细胞中用LPS、重组小鼠SERPINA3N和/或TAK-242处理,RT-qPCR检测炎症标志,PLA和共免疫沉淀检测SERPINA3N与TLR4相互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| MOG/EAE模型诱导 | MOG肽(35–55) | -- | -- |
| 完全弗氏佐剂 | -- | -- | |
| 不完全弗氏佐剂 | Thermo Fisher | -- | |
| LPS内毒素模型 | 脂多糖(大肠杆菌O55:B5) | Sigma-Aldrich | L2880 |
| LPS内毒素模型对照 | 磷酸盐缓冲液 | Gibco | 10010023 |
| 光血栓性卒中模型 | 孟加拉玫瑰红 | -- | -- |
| DTA模型诱导 | 他莫昔芬 | -- | -- |
| 免疫组化 | 山羊多克隆抗Serpina3n抗体 | R&D System | AF4709 |
| 兔多克隆抗IBA1抗体 | WAKO | 019-19741 | |
| 兔多克隆抗SOX10抗体 | Abcam | ab27655 | |
| 小鼠单克隆抗GFAP抗体 | Agilent | Z0334 | |
| 大鼠单克隆抗CD68抗体 | Bio-Rad | MCA1957 | |
| 小鼠单克隆抗APC(CC1)抗体 | Millipore | OP80 | |
| 兔单克隆抗TCF4/TCF7L2(C48H11)抗体 | Cell Signaling Technology | 2569S | |
| 兔重组单克隆抗Stat3抗体 | Cell Signaling | 4904 | |
| 兔重组单克隆抗p-STAT3(Tyr705)抗体 | Cell Signaling | 9145 | |
| 兔多克隆抗RFP抗体 | Rockland | 600-401-379 | |
| 小鼠单克隆抗Aβ1-16(克隆6E10)抗体 | BioLegend | 803001 | |
| 大鼠单克隆抗I-A/I-E抗体 | BD Pharmingen | 556999 | |
| 小鼠单克隆抗NeuN抗体 | Millipore | MAB377 | |
| 兔重组单克隆抗磷酸化p65(Ser536)抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 小鼠单克隆抗CD45抗体 | Thermo Fisher Scientific | 14-0451-82 | |
| 兔多克隆抗CD74抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-22113 | |
| 鸡多克隆抗GFP抗体 | Abcam | ab13970 | |
| 小鼠单克隆抗PLP1抗体 | Thermo Fisher | MA1-80034 | |
| 大鼠单克隆抗MBP抗体 | Novus | NB600-717 | |
| 小鼠抗GST-π抗体 | BD Bioscience | 610718 | |
| 小鼠单克隆抗SMI32抗体 | Covance | SMI-32R-100 | |
| 小鼠单克隆抗4-羟基壬烯醛抗体 | Abcam | ab46545 | |
| 髓鞘染色 | Black-Gold II髓鞘染料 | Biosensis | TR-100-B |
| RNA提取 | RNeasy脂质组织迷你试剂盒 | QIAGEN | -- |
| 无RNase DNase试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| cDNA合成 | Omniscript逆转录试剂盒 | QIAGEN | -- |
| RT-qPCR | QuantiTect SYBR Green PCR试剂盒 | QIAGEN | -- |
| Agilent MP3005P热循环仪 | Agilent | -- | |
| Western blot | N-PER神经元蛋白提取试剂 | Thermo Fisher | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| AnykD Mini-PROTEAN TGX预制胶 | Bio-Rad | -- | |
| Trans-Blot Turbo转膜系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western Lightning Plus ECL化学发光底物 | PerkinElmer | -- | |
| RiboTag免疫沉淀 | 抗HA.11表位标签抗体 | Covance | -- |
| 蛋白A/G磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 88803 | |
| RNeasy Plus微量试剂盒 | Qiagen | 74034 | |
| MACS分选 | 成年脑解离试剂盒(小鼠和大鼠) | Miltenyi Biotec | 130-107-677 |
| gentleMACS组织解离仪 | Miltenyi Biotec | 130-093-235 | |
| gentleMACS C管 | Miltenyi Biotec | 130-093-237 | |
| 抗CD11b磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-093-634 | |
| 抗O4磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-094-543 | |
| 抗ACSA-2磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-097-678 | |
| LS分选柱 | Miltenyi Biotec | -- | |
| MACS分选器 | Miltenyi Biotec | 130-090-976 | |
| ChIP-qPCR | SimpleChIP酶法染色质IP试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9003 |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9139 | |
| 原代小胶质细胞处理 | 重组小鼠SERPINA3N | R&D System | 4709-PI |
| TAK-242(TLR4抑制剂) | Sigma-Aldrich | 614316 | |
| 脂多糖(大肠杆菌O55:B5) | Sigma-Aldrich | L2880 | |
| 原代培养 | 木瓜蛋白酶解离试剂盒 | Worthington | LK003176 |
| PLA | Duolink原位红色起始试剂盒(小鼠/山羊) | Sigma-Aldrich | DUO92103 |
| 抗TLR4抗体 | NOVUS | NB100 | |
| 抗SERPINA3N抗体 | R&D System | AF4709 | |
| 共免疫沉淀 | DTSSP交联剂 | Thermo Fisher Scientific | 21578 |
| Pierce交联磁珠免疫沉淀/共免疫沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88805 | |
| 正常小鼠IgG | Cell Signaling Technology | 68860 | |
| 正常山羊IgG | R&D Systems | AB-108-C | |
| 原代小胶质细胞培养 | 小胶质细胞补充剂 | ScienCell | 1952 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MOG/EAE模型 | MOG肽(35–55)总剂量300 µg、CFA中热灭活结核分枝杆菌5 mg/ml、百日咳毒素200 ng于第0和2天腹腔注射、12–15周龄小鼠 阅读提示:Methods“MOG/EAE model”小节 |
| CPZ模型 | 0.3%(w/w)CPZ饮食持续2天至4周、对照为普通粉末饲料、每周更换两次饲料 阅读提示:Methods“Cuprizone (CPZ) model”小节 |
| LPS内毒素模型 | 6–8周龄小鼠腹腔注射3 mg/kg LPS(E. coli O55:B5)或PBS 阅读提示:Methods“LPS endotoxicity”小节 |
| DTA诱导的细胞自主性损伤模型 | 8–10周龄成年小鼠单次腹腔注射他莫昔芬100 mg/kg、24小时后取材 阅读提示:Methods“DTA mouse model for cell-type-specific injury”小节及Fig. 6图注 |
| 少突胶质细胞特异性Serpina3n和Stat3条件敲除 | Olig2-Cre与Serpina3nfl/fl或Stat3fl/fl杂交、MOG/EAE D30及CPZ 4周检测时间点 阅读提示:Methods“Transgenic mice”及Fig. 2、Fig. 7、Fig. 8图注 |
| 原代小胶质细胞SERPINA3N处理 | LPS 10 ng/mL、重组小鼠SERPINA3N 50 ng/mL、TAK-242 0.2 μM、处理24小时、DIV14小胶质细胞 阅读提示:Methods“Primary microglia culture and SERPINA3N/TAK-422 treatment”小节及Fig. 10图注 |
| ChIP-qPCR检测STAT3结合 | H2O2 100 μM处理24小时的原代少突胶质细胞、Site 1(−144至−135 bp)和Site 2(−1890至−1882 bp)引物、n=3独立原代OL培养 阅读提示:Methods“Chromatin immunoprecipitation (ChIP) assay”小节及Fig. 7o图注 |
| 正常衰老模型 | 2月龄年轻对照、20月龄老年野生型、20月龄Olig2-Cre:Serpina3nfl/fl老年cKO小鼠 阅读提示:Methods“Normal aging”小节及Fig. 3、Fig. 9图注 |