检测PTPN14在新生内膜增生中的表达
验证PTPN14在VSMC表型调节和新生内膜增生中是否被诱导表达。
在ApoE−/−小鼠颈动脉部分结扎模型、C57BL/6小鼠导丝损伤模型和颈动脉结扎模型中,用免疫荧光和Western blot检测PTPN14表达;在PDGF-BB刺激的HA-VSMCs中检测PTPN14表达;在人冠状动脉样本中检测PTPN14表达并与狭窄程度相关分析。
PTPN14 aggravates neointimal hyperplasia via boosting PDGFRβ signaling in smooth muscle cells.
包含体外细胞实验、多种小鼠模型、人类样本及组学分析,并有功能与机制验证
人主动脉平滑肌细胞HA-VSMCs 小鼠颈动脉导丝损伤模型 小鼠颈动脉结扎模型 人冠状动脉样本
PTPN14SMC−/−与PTPN14flox小鼠在导丝损伤后21天内膜/管腔比及PCNA阳性细胞数比较 HA-VSMCs中PDGF-BB处理浓度(10或20 ng/mL)和时间(10、30 min或24 h) 腺病毒MOI 10感染48小时过表达PTPN14或其突变体 PDGFRβY692F/Y692D突变体对PDGF-BB诱导的AKT和ERK1/2磷酸化的影响 人冠状动脉样本按狭窄程度分组及PTPN14/磷酸化PDGFRβY692与内膜/中膜比的相关性分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PTPN14在VSMC表型调节和新生内膜增生中是否被诱导表达。
在ApoE−/−小鼠颈动脉部分结扎模型、C57BL/6小鼠导丝损伤模型和颈动脉结扎模型中,用免疫荧光和Western blot检测PTPN14表达;在PDGF-BB刺激的HA-VSMCs中检测PTPN14表达;在人冠状动脉样本中检测PTPN14表达并与狭窄程度相关分析。
确定PTPN14过表达或敲除对新生内膜形成的作用及磷酸酶活性的依赖性。
通过腺病毒在导丝损伤的LCA中过表达PTPN14、PTPN14C1121S或对照,检测内膜/管腔比、PCNA阳性细胞和VSMC标志物;利用SMC特异性PTPN14敲除小鼠进行导丝损伤,检测新生内膜形成。
明确PTPN14在PDGF-BB诱导的VSMC迁移、增殖和去分化中的作用。
在HA-VSMCs中过表达PTPN14或PTPN14C1121S,或用siRNA敲低PTPN14,然后用PDGF-BB刺激,通过划痕实验、Transwell实验、Ki67染色和Western blot检测迁移、增殖及标志物表达。
探究PTPN14是否调控PDGF-BB诱导的下游信号激活。
用RNA-seq分析PTPN14敲低后基因表达变化;用Western blot检测PDGF-BB刺激后PLCγ、AKT和ERK1/2磷酸化水平。
确定PTPN14是否直接结合PDGFRβ并介导特定酪氨酸位点去磷酸化。
免疫共沉淀检测PTPN14与PDGFRβ结合及结构域定位;质谱分析鉴定PDGFRβ磷酸化位点;Western blot验证PTPN14敲低对PDGFRβ Y692磷酸化的影响。
明确Y692磷酸化对PDGFRβ信号激活和配体结合的调控作用。
构建PDGFRβY692F和Y692D突变体,在HA-VSMCs中检测对AKT/ERK磷酸化、PDGF-BB结合亲和力(SPR)和受体二聚化的影响;在体内过表达突变体检测对新生内膜形成的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | Pluronic® F-127 | Sigma-Aldrich | -- |
| 免疫荧光 | α-SMA抗体 | Cell Signaling Technology | 19245 |
| α-SMA抗体 | Sigma | A2547 | |
| PCNA抗体 | Proteintech | 10205-2-AP | |
| PTPN14抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-373766 | |
| 磷酸化PDGFRβY692抗体 | GeneScript | SC2039-PF | |
| DAPI | ZSGB-BIO | ZLI-9557 | |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 腺病毒感染 | AdPTPN14 | GeneChem | -- |
| AdPTPN14C1121S | GeneChem | -- | |
| AdPDGFRβ | GeneChem | -- | |
| AdPDGFRβY692F | GeneChem | -- | |
| AdPDGFRβY692D | GeneChem | -- | |
| siRNA转染 | 靶向PTPN14的siRNA | Santa Cruz Biotechnology | sc-62777 |
| 对照siRNA | Santa Cruz Biotechnology | sc-37007 | |
| Lipofectamine™ RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | 13778150 | |
| 质粒转染 | Lipofectamine3000 | Thermo Fisher Scientific | L3000-015 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | P0013B |
| PMSF | Solarbio Life Sciences | P0100 | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 04693132001 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche | 04906845001 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23227 | |
| PDGFRβ抗体 | Cell Signaling Technology | 3169 | |
| SM22抗体 | Cell Signaling Technology | 40471 | |
| Flag抗体 | Cell Signaling Technology | 14793 | |
| Myc抗体 | Cell Signaling Technology | 2276 | |
| HA抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| PDGFRα抗体 | Cell Signaling Technology | 3174 | |
| actin抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| α-Tubulin抗体 | Cell Signaling Technology | 3873 | |
| ERK1/2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-135900 | |
| 磷酸化ERK1/2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-7383 | |
| CNN1抗体 | Proteintech | 24855-1-AP | |
| OPN抗体 | Proteintech | 22952-1-AP | |
| VIM抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G PLUS-Agarose珠 | Thermo Fisher Scientific | 20423 |
| 抗Flag亲和珠 | Bimake | B26101 | |
| 抗Myc亲和珠 | Bimake | B26301 | |
| 磷酸酶活性检测 | RediPlate 96 EnzChek酪氨酸磷酸酶检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | R22067 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| qRT-PCR | SuperScript III | Thermo Fisher Scientific | 12574035 |
| SYBR Green PCR预混液 | TransGen Biotech | AQ131-01 | |
| 邻位连接实验 | SM22抗体 | Abcam | ab150129 |
| PDGFRβ抗体 | Bioworld | MB64422 | |
| PDGF-B抗体 | Affinity | AF0240 | |
| Duolink原位PLA试剂盒 | Sigma-Aldrich | DUO92101 | |
| 增殖实验 | Ki67抗体 | Cell Signaling Technology | 11882 |
| DyLight™ 594鬼笔环肽 | Cell Signaling Technology | 12877 | |
| Transwell实验 | Transwell小室 | BD Falcon | 353097 |
| 表面等离子共振 | BIAcore T200 | GE Healthcare | -- |
| 交联实验 | 二琥珀酰亚胺辛二酸酯 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠导丝损伤模型 | 小鼠品系(C57BL/6或PTPN14flox/PTPN14SMC−/−)、性别(雄性为主,部分雌性验证)、年龄(8-12周)、导丝型号(0.38 mm)、来回移动次数(5次)、取材时间(14或21天) 阅读提示:Methods 'Mouse carotid artery wire injury' |
| 腺病毒过表达 | 腺病毒剂量(5×10^9 pfu)、给予方式(30% pluronic gel局部给予)、感染时间(48小时)、MOI(10) 阅读提示:Methods 'Mouse carotid artery wire injury' 和 'Recombinant adenovirus construction and transfection' |
| 细胞培养与刺激 | HA-VSMCs来源(ATCC CRL-1999)、代次(4-7)、血清饥饿时间(48小时)、PDGF-BB浓度(10或20 ng/mL)及刺激时间 阅读提示:Methods 'Cell culture' 及图注 |
| SMC特异性PTPN14敲除小鼠构建 | PTPN14flox小鼠品系(T020775)、Tagln-Cre小鼠品系(017491)、敲除效率验证方法 阅读提示:Methods 'Animals' 和 Fig. 4A-B |
| 人冠状动脉样本分析 | 样本分组依据(狭窄程度)、样本量(n=15,11,19等)、伦理批准及知情同意 阅读提示:Methods 'Human samples' 和 Fig. 1F-H、Fig. 8H-J |