建立Fasn缺陷脂肪细胞模型并检测自噬表型
验证Fasn缺失是否损害脂肪细胞自噬。
从FasnFl/Fl和cAdFasnKO小鼠来源的前脂肪细胞体外分化,通过电镜观察自噬泡,Western blot检测LC3和p62,qPCR检测自噬相关基因,并进行LC3II周转实验。
De novo lipogenesis fuels adipocyte autophagosome and lysosome membrane dynamics.
包含体外原代脂肪细胞、体内组成型和诱导型脂肪细胞特异性Fasn敲除小鼠、离体脂肪组织外植体、HepG2细胞及脂质组学等多层级证据,并进行功能与机制验证
体外分化的FasnFl/Fl和cAdFasnKO原代脂肪细胞 组成型脂肪细胞特异性Fasn敲除(cAdFasnKO)小鼠 他莫昔芬诱导型脂肪细胞特异性Fasn敲除(iAdFasnKO)小鼠 HepG2细胞
自噬通量检测中HBSS饥饿4小时和/或50 μM氯喹(CQ)处理4小时,计算LC3II合成比率和降解比率 cAdFasnKO脂肪细胞中可溶性和不可溶性p62及LC3II的Western blot定量,n=3样本,至少2次独立实验 离体脂肪组织外植体在含或不含50 μM CQ的无血清DMEM/F12中培养2小时,n=4-5个外植体 脂肪酸补充实验:200 μM棕榈酸钠和200 μM油酸从分化第0、2或5天开始补充,隔天更换 LC3B与Fasn免疫荧光共定位分析的Manders系数,n=7-19张单Z切片图像
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Fasn缺失是否损害脂肪细胞自噬。
从FasnFl/Fl和cAdFasnKO小鼠来源的前脂肪细胞体外分化,通过电镜观察自噬泡,Western blot检测LC3和p62,qPCR检测自噬相关基因,并进行LC3II周转实验。
判断Fasn缺失导致的自噬损害是否由乙酰-CoA或丙二酰-CoA水平变化介导。
LC-MS/MS测定乙酰-CoA和丙二酰-CoA水平;Western blot检测丙二酰化蛋白;使用ACC抑制剂ND-630处理脂肪细胞并检测自噬指标。
验证外源性脂肪酸能否恢复Fasn缺陷脂肪细胞的自噬功能,以及Fasn是否定位于新生自噬体。
向cAdFasnKO脂肪细胞补充棕榈酸和油酸混合物,检测p62和LC3II;免疫荧光共定位分析Fasn与LC3B。
在体内验证Fasn缺失是否损害脂肪组织自噬。
使用iAdFasnKO和cAdFasnKO小鼠,Western blot检测脂肪组织p62和LC3II,免疫组化检测p62,离体脂肪组织外植体自噬通量检测,以及高脂饮食干预。
探究Fasn缺失对细胞脂质组成和溶酶体功能的影响。
对体外分化的脂肪细胞和体内iWAT进行脂质组学分析;使用Magic Red Cathepsin B底物检测溶酶体活性,Western blot检测Lamp1和Cathepsin B。
验证Fasn抑制对自噬的影响是否普遍存在于非脂肪细胞。
在HepG2细胞中使用TVB3664抑制Fasn,检测p62、LC3B和LC3II周转。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 胶原酶 | Sigma | C6885 |
| firsocostat/ND-630 | Selleck Chemicals | S8893 | |
| TVB3664 | Selleck Chemicals | S8563 | |
| 自噬通量检测 | 氯喹 | Sigma | 6628 |
| Western blot | 抗Fasn抗体 | CST | 3180 |
| 抗Ucp1抗体 | Abcam | 10983 | |
| 抗p62抗体 | CST | 23214 | |
| 抗p62抗体 | R&D | MAB8028 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma | T5168 | |
| 抗LC3B抗体 | CST | 83506 | |
| 抗LC3A/B抗体 | CST | 12741 | |
| 抗Gapdh抗体 | CST | 8884 | |
| 抗丙二酰化赖氨酸抗体 | PTM Biolabs | 901 | |
| 抗vinculin抗体 | CST | 18799 | |
| 抗Gabarap抗体 | CST | 13733 | |
| 抗泛素抗体 | Proteintech | 10201-2-AP | |
| 抗Lamp1抗体 | BD Biosciences | 553792 | |
| 抗组织蛋白酶B抗体 | Proteintech | 12216-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Sigma | A5316 | |
| 免疫荧光 | 兔抗Fasn抗体 | Abcam | ab22759 |
| 兔抗p62抗体 | CST | 23214 | |
| 小鼠抗p62抗体 | R&D | MAB8028 | |
| 兔抗LC3A/B抗体 | CST | 12741 | |
| 小鼠抗LC3B抗体 | CST | 83506 | |
| Alexa Fluor-594山羊抗兔二抗 | Invitrogen | -- | |
| Alexa Fluor-488山羊抗小鼠二抗 | Invitrogen | -- | |
| DAPI | Invitrogen | -- | |
| Prolong Glass封片剂 | Invitrogen | -- | |
| 溶酶体活性检测 | Magic Red组织蛋白酶B底物 | Immunochemistry Technologies | 937 |
| 蛋白酶体活性检测 | 蛋白酶体活性荧光检测试剂盒II | UBPBio | J4120 |
| 乙酰-CoA和丙二酰-CoA检测 | 13C2-乙酰辅酶A | Sigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外脂肪细胞自噬通量检测 | 饥饿时间4小时、CQ浓度50 μM、处理时间4小时、样本量n=3、至少2次独立实验 阅读提示:Methods中Autophagy flux Assay/LC3II turnover assay小节及Fig. 1g-i图注 |
| 脂肪酸补充实验 | 棕榈酸钠和油酸各200 μM、BSA浓度0.5%、补充起始时间(第0、2或5天)、处理48小时 阅读提示:Methods中Primary preadipocyte isolation and differentiation小节及Fig. 3a-f图注 |
| 体内脂肪细胞Fasn敲除模型 | 他莫昔芬剂量1 mg/天连续5天腹腔注射、小鼠性别和年龄、饮食条件(普通饲料或60%高脂饮食)、样本量n=2-4只 阅读提示:Methods中Mice小节及Fig. 4a-j图注 |
| 离体脂肪组织外植体自噬通量检测 | 外植体大小约20 mg、CQ浓度50 μM、培养时间2小时、外植体数量n=4-5 阅读提示:Methods中Autophagy flux Assay/LC3II turnover assay小节及Fig. 4f-h图注 |
| ACC抑制剂ND-630处理 | ND-630浓度10 μM(部分实验15 μM)、处理时间48小时(部分实验24-72小时)、溶剂DMSO 阅读提示:Methods中Primary preadipocyte isolation and differentiation小节及Fig. 2c-k图注 |
| Fasn抑制剂TVB3664处理 | TVB3664浓度100 nM、处理时间48小时、溶剂为vehicle 阅读提示:Methods中Primary preadipocyte isolation and differentiation小节及Supplementary Fig. 4、6、7图注 |