患者原代克隆性浆细胞的凋亡预激与促生存蛋白依赖性分析
明确AL淀粉样变性克隆性浆细胞的凋亡调控状态和对BCL-2家族促生存蛋白的依赖性
收集患者骨髓穿刺液,Ficoll-Paque分离单个核细胞,进行BH3谱分析,以BIM、BID、PUMA等BH3肽刺激后流式检测细胞色素c释放,并用BAD BH3、HRK BH3和MS1肽评估对BCL-2/BCL-W/BCL-XL和MCL-1的依赖性
Exploiting endogenous and therapy-induced apoptotic vulnerabilities in immunoglobulin light chain amyloidosis with BH3 mimetics.
含患者原代样本BH3谱分析、细胞系体外功能验证、siRNA机制验证、异种移植瘤体内验证及蛋白质组学分析
AL淀粉样变性患者骨髓来源的克隆性浆细胞 ALMC-1细胞系(AL淀粉样变性) ALMC-2细胞系(多发性骨髓瘤) ALMC-1异种移植瘤NSG小鼠模型
患者骨髓单个核细胞经Ficoll-Paque分离后进行BH3谱分析,BH3肽暴露60分钟,以细胞色素c释放评估MOMP 离体化学敏感性检测:细胞以500,000细胞/mL培养,药物处理24或48小时后以Annexin V和CD138染色流式检测 ALMC-1异种移植:皮下注射106个细胞于matrigel,肿瘤体积达150 mm3起始治疗,疗程4周 ABT-199以100 mg/kg每日口服灌胃,硼替佐米以0.8 mg/kg隔日腹腔注射 免疫印迹和质谱每组实验仅进行一次,其他实验至少三次重复(除非另注明)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确AL淀粉样变性克隆性浆细胞的凋亡调控状态和对BCL-2家族促生存蛋白的依赖性
收集患者骨髓穿刺液,Ficoll-Paque分离单个核细胞,进行BH3谱分析,以BIM、BID、PUMA等BH3肽刺激后流式检测细胞色素c释放,并用BAD BH3、HRK BH3和MS1肽评估对BCL-2/BCL-W/BCL-XL和MCL-1的依赖性
验证克隆性浆细胞对BH3模拟物单药及与标准治疗联合的敏感性
将骨髓单个核细胞离体培养,分别用ABT-199、ABT-263、S63845、WEHI-539、硼替佐米、伊沙佐米、来那度胺、泊马度胺、地塞米松单药或联合处理,流式检测CD138阳性细胞丢失和Annexin V阳性
阐明硼替佐米改变凋亡依赖性的机制及Noxa和BIM的作用
对硼替佐米处理后的患者浆细胞和ALMC-1/ALMC-2细胞进行BH3谱分析、免疫印迹检测BCL-2家族蛋白表达、免疫共沉淀检测BCL-2和MCL-1结合伙伴变化,并用siRNA敲低BIM或Noxa后检测药物敏感性
在体内比较ABT-199与硼替佐米的疗效
将ALMC-1细胞皮下注射至NSG小鼠建立异种移植瘤,肿瘤体积达150 mm3后分别给予溶媒、ABT-199或硼替佐米治疗4周,监测肿瘤生长和总生存期
揭示AL淀粉样变性和多发性骨髓瘤细胞在基线和硼替佐米处理后的信号通路差异
对未处理及10 nM硼替佐米处理0、2、4、6、12小时的ALMC-1和ALMC-2细胞进行TMT标记质谱蛋白质组学分析,定量约7900种蛋白,并进行GO富集、GSEA和PCA分析
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | Ficoll-Paque分离液 | GE Healthcare | -- |
| 流式分析 | CD38 APC/Cy7抗体 | Biolegend | 102728 |
| CD138 Pacific Blue抗体 | Biolegend | 356532 | |
| 细胞色素C AlexaFluor 647抗体 | Biolegend | 612310 | |
| Kappa轻链FITC抗体 | Invitrogen | 11-9970-42 | |
| Lambda轻链抗体 | Invitrogen | 12-9990-42 | |
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | Gibco | 11995065 |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | ThermoFisher Scientific | -- |
| Opti-MEM培养基 | ThermoFisher | -- | |
| Noxa siRNA | Santa Cruz Biotechnologies | sc-37305 | |
| Bim siRNA | Santa Cruz Biotechnologies | sc-29802 | |
| 对照siRNA | Santa Cruz Biotechnologies | sc-37007 | |
| 免疫印迹 | 抗Noxa抗体(114C307) | Millipore Sigma | OP180 |
| 抗BAX抗体 | Cell Signaling Technology | 2772 | |
| 抗BCL-xL抗体 | Cell Signaling Technology | 2764 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| 抗MCL-1重组抗体 | Cell Signaling Technology | 94296 | |
| 抗BCL-2抗体 | Cell Signaling Technology | 2872 | |
| 抗BIM抗体 | Cell Signaling Technology | 2933 | |
| 抗ATF4抗体 | Cell Signaling Technology | 11815 | |
| 抗CHOP抗体 | Cell Signaling Technology | 2895 | |
| 免疫共沉淀 | 抗MCL-1克隆22抗体 | BD Pharmingen | 559027 |
| 抗BIM抗体 | Cell Signaling Technology | 2819 | |
| 抗BCL-2抗体 | Cell Signaling Technology | 15071 | |
| 抗小鼠IgG1(G3A1) | Cell Signaling Technology | 5415 | |
| Protein A/G琼脂糖珠 | Thermo Fisher | -- | |
| 动物实验 | ABT-199(维奈克拉) | Medchem express | -- |
| 硼替佐米 | Medchem express | -- | |
| qPCR | Qiagen RNeasy迷你试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher | 4368814 | |
| SYBR Green预混液 | BIO RAD | 1725270 | |
| Seahorse分析 | Seahorse XF微孔板 | Agilent | -- |
| Cell-TAK细胞黏附剂 | Corning | 354249 | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解缓冲液 | New England Biolabs | -- |
| 质谱 | LysC蛋白酶 | Wako | -- |
| 胰蛋白酶 | Promega | V5111 | |
| TMT 11plex标记试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式分析 | Attune NxT流式细胞仪 | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本BH3谱分析 | 样本纳入标准(活检证实的AL淀粉样变性、克隆性浆细胞优势)、BH3肽浓度(BIM和BID 10 µM)、暴露时间60分钟、细胞色素c染色抗体稀释度 阅读提示:Methods中BH3 Profiling小节及Fig. 1图注 |
| 离体化学敏感性检测 | 细胞接种浓度500,000细胞/mL、药物处理时间24或48小时、联合处理时BH3模拟物浓度100 nM、细胞死亡计算公式 阅读提示:Methods中Ex vivo chemosensitivity小节及Fig. 2、Fig. 3图注 |
| ALMC-1异种移植瘤体内实验 | 小鼠品系(NOD-scid IL2Rgammanull NSG)、细胞接种数量(106)和途径(皮下matrigel)、起始治疗肿瘤体积(150 mm3)、ABT-199剂量100 mg/kg每日口服灌胃、硼替佐米剂量0.8 mg/kg隔日腹腔注射、每组n=4 阅读提示:Methods中Mouse housing and ALMC-1 xenograft model小节及Fig. 5图注 |
| 质谱蛋白质组学 | 硼替佐米浓度10 nM、时间点0、2、4、6、12小时、TMT 11plex标记、质谱平台Orbitrap Lumos 阅读提示:Methods中Whole cell proteomics和Mass spectrometry analysis小节 |
| siRNA敲低实验 | siRNA浓度10 µM、Lipofectamine RNAiMAX用量81 µL、转染24小时、药物处理12小时后检测 阅读提示:Methods中Cell line siRNA knockdown小节及Fig. 4k图注 |