验证Ccl3在DTX化疗中的作用
确定Ccl3是否为DTX疗效所必需。
使用Ccl3敲除小鼠和Ccl3敲低/过表达细胞系,进行肿瘤移植和DTX处理,观察肿瘤生长。
Ccl3 enhances docetaxel chemosensitivity in breast cancer by triggering proinflammatory macrophage polarization
包含体外细胞实验、多种转基因小鼠模型、类器官样共培养、患者样本分析及机制验证。
小鼠乳腺癌细胞系Py8119、Mvt1、4T1 永生化骨髓来源巨噬细胞 Ccl3敲除小鼠 乳腺癌患者肿瘤及血清样本
Ccl3敲除小鼠模型 Ccl3敲低/过表达肿瘤细胞系 巨噬细胞耗竭实验 RNA测序和GSEA分析 体外吞噬实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Ccl3是否为DTX疗效所必需。
使用Ccl3敲除小鼠和Ccl3敲低/过表达细胞系,进行肿瘤移植和DTX处理,观察肿瘤生长。
探究Ccl3是否促进促炎性巨噬细胞极化。
通过流式细胞术和Western blot检测巨噬细胞标志物,使用Ccl3敲低或敲除的巨噬细胞。
确定Ccl3下游信号通路。
敲低Ccr5、p38或Irf5,检测促炎标志物和通路蛋白磷酸化。
验证Ccl3是否增强巨噬细胞对癌细胞及干细胞的吞噬。
使用DTX预处理的巨噬细胞与癌细胞共培养,通过流式和共聚焦检测吞噬率。
探究DTX如何诱导Ccl3表达。
检测ROS水平,使用H2O2和NAC处理,并检测Creb和Ccl3表达。
验证CCL3表达与乳腺癌患者预后和化疗反应的相关性。
使用Kaplan-Meier数据库和患者血清、肿瘤样本进行ELISA和IHC分析。
评估Creb抑制剂或rmCcl3与DTX联合治疗的疗效。
在小鼠模型中联合给药,观察肿瘤生长和巨噬细胞极化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 多西他赛 | Hengrui | H20020543 |
| Creb抑制剂666-15 | MedChemExpress | HY-101120 | |
| 体内治疗 | 重组小鼠Ccl3 | R&D | 450-MA-050/CF |
| 药物处理 | N-乙酰-L-半胱氨酸 | Beyotime | S0077 |
| 过氧化氢 | Chinasun Specialty Products Co, Ltd | CN51001 | |
| 细胞培养 | Ham's F12培养基 | Gibco | 21 700-075 |
| RPMI1640培养基 | Gibco | 31 800-022 | |
| DMEM培养基 | Gibco | 12 800-017 | |
| 胎牛血清 | Ausbian | vs500T | |
| 链霉素/青霉素 | Beyotime | C0222 | |
| 庆大霉素 | Sigma | G1397 | |
| 氢化可的松 | Aladdin | H110523 | |
| 表皮生长因子 | PeproTech | AF-315-09 | |
| 胰岛素 | Biosharp | BS901 | |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | 354234 |
| PBS脂质体 | Yeasen Biotechnology | 40 338ES10 | |
| RNA分析 | TRIzol试剂 | Takara | 9109 |
| HiScript II第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | R211-02 | |
| AceQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q511 | |
| 7300Plus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 蛋白分析 | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | P0013C |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo | 23227 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 化学发光底物 | Millipore | WBKLS0500 | |
| Ccl3抗体 | R&D | AF-450-NA | |
| Gapdh抗体 | TransGen | HC301 | |
| iNos抗体 | CTS | 13120 | |
| Cox2抗体 | Cayman | 160106 | |
| p38抗体 | CST | 9212 | |
| p-p38抗体 | CST | 4631 | |
| Erk抗体 | CST | 4695 | |
| p-Erk抗体 | CST | 9101 | |
| Jnk抗体 | CST | 9252 | |
| p-Jnk抗体 | CST | 9251 | |
| Irf5抗体 | Proteintech | 10 547-1-AP | |
| Creb抗体 | CST | 9197 | |
| p-Creb抗体 | CST | 9198 | |
| 过氧化物酶标记的驴抗山羊IgG | Proteintech | SA00001-3 | |
| 过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | TransGen | HS101-01 | |
| 过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgG | TransGen | HS201-01 | |
| ELISA | CCL3 ELISA试剂盒 | RayBio | ELH-MIP1a |
| 细胞培养 | 红细胞裂解液 | Invitrogen | 00-4333-57 |
| 流式分析 | 抗小鼠CD16/32抗体 | BioLegend | 101302 |
| ALDEFLUOR试剂盒 | STEMCELL Technologies | 01700 | |
| DAPI | Sigma | D9564 | |
| Moflo Astrios流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| CytoFlex流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 抗小鼠CD45-FITC抗体 | BioLegend | 103108 | |
| 抗小鼠F4/80-APC抗体 | BioLegend | 123116 | |
| 抗小鼠MHCII-APC/Cy7抗体 | BioLegend | 107628 | |
| 抗小鼠CD11b-PE抗体 | BioLegend | 101208 | |
| 抗小鼠CD140b-PE抗体 | BioLegend | 136006 | |
| 抗小鼠CD19-PE抗体 | BioLegend | 115507 | |
| 抗小鼠CD3-APC/Cy7抗体 | BioLegend | 100221 | |
| 抗小鼠CD31-PE抗体 | BD Biosciences | 553373 | |
| 抗小鼠CD45-PE抗体 | BD Biosciences | 553081 | |
| 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯探针 | Sigma-Aldrich | 287810 | |
| 质粒构建 | 一步克隆试剂盒 | Vazyme | C112 |
| pLKO.1-puro载体 | Addgene | 8453 | |
| 病毒包装 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences | 23966 |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | 31 985-062 | |
| 聚凝胺 | Sigma | H9268 | |
| 免疫组织化学 | 曲拉通X-100 | Sangon | A600198 |
| DAB显色试剂盒 | MaxVision | DAB-0031 | |
| 中性树胶 | Biomiky | BL085A-100g | |
| CD68抗体 | Santa Cruz | sc-9139 | |
| Cox2抗体 | Cayman | 160106 | |
| CCL3抗体 | GeneTex | GTX52606 | |
| 过氧化物酶标记的山羊抗小鼠/兔IgG | MaxVision | KIT-5010 | |
| 趋化实验 | 8µm孔径Transwell小室 | Corning | 353097 |
| 吞噬实验 | CFDA-SE染料 | Beyotime | C0051 |
| 共聚焦显微镜 | Leica | TCS SP5 II | |
| 统计 | GraphPad Prism软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| Ccl3敲除小鼠的生成与基因分型 | 小鼠背景、sgRNA序列、基因分型引物PCR产物大小 阅读提示:Methods 部分:Transgenic mice and genotyping |
| 肿瘤移植模型 | 细胞系、注射细胞数、Matrigel体积、DTX剂量、给药方式、治疗时间点 阅读提示:Methods 部分:In vivo mouse models |
| 巨噬细胞耗竭 | 氯膦酸盐脂质体剂量、给药频率和时长 阅读提示:Methods 部分:Macrophage clearance in mice |
| 体外共培养实验 | 癌细胞与巨噬细胞类型、DTX浓度、共培养时间 阅读提示:Methods 部分:In vitro coculture |
| 吞噬实验 | DTX预处理浓度和时间、巨噬细胞与靶细胞比例、共培养时间、标记物 阅读提示:Methods 部分:Phagocytosis assay |
| 患者样本分析 | 患者队列特征、TNC化疗方案、采样时间点、MP评分标准、ELISA和IHC方法 阅读提示:Methods 部分:Human breast cancer patient serum and tumor samples; Results 部分:High CCL3 expression... |
| 联合治疗实验 | Creb抑制剂或rmCcl3剂量、给药方式、与DTX联合的治疗方案 阅读提示:Methods 部分:Reagents; Results 部分:Both Creb inhibitor and rmCcl3... |