肥胖状态下YAP/TAZ激活的观察
验证人和小鼠肥胖时白色脂肪细胞中YAP/TAZ是否被激活。
检测人瘦与肥胖受试者内脏脂肪细胞及SD/HFD小鼠vWAT、sWAT中YAP/TAZ亚细胞定位和靶基因(Cyr61、AmotL2、Lats2等)表达。
YAP and TAZ protect against white adipocyte cell death during obesity.
含人脂肪细胞、小鼠模型、体外3T3-L1及SVF分化、RNA-seq、ChIP及体内AAV干预等多层功能与机制验证
人内脏白色脂肪细胞(瘦与肥胖受试者) 小鼠白色脂肪组织(vWAT、sWAT,SD/HFD喂养) iAd-Yap/Taz-KO与Ad-Yap/Taz-KO小鼠 分化3T3-L1脂肪细胞及SVF来源分化脂肪细胞
HFD喂养时长:小鼠4周、12/14/16周等不同时间点 iAd-Yap/Taz-KO用1 mg他莫昔芬连续5天腹腔注射诱导,5周龄开始 HFD为含30%脂肪的Western型高脂饲料,6周龄起喂养 体内AAV-shBim注射:2.5×10^10 viral genomes/ml,每侧脂肪垫50 μl分五点注射 etanercept 10 mg/kg与anakinra 25 mg/kg腹腔注射连续7天 TNFα 1.1 nM、IL-1β 5.9 nM、IL-6 0.8 nM、CCL2 1.2 nM、palmitic acid 500 nM处理3T3-L1脂肪细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证人和小鼠肥胖时白色脂肪细胞中YAP/TAZ是否被激活。
检测人瘦与肥胖受试者内脏脂肪细胞及SD/HFD小鼠vWAT、sWAT中YAP/TAZ亚细胞定位和靶基因(Cyr61、AmotL2、Lats2等)表达。
验证肥胖时脂肪细胞YAP/TAZ缺失对体重、糖耐量和脂肪组织的影响。
构建iAd-Yap/Taz-KO小鼠,HFD喂养后检测体重、葡萄糖耐量、vWAT/sWAT质量、脂肪细胞数目、CLS、巨噬细胞和TUNEL阳性细胞。
验证YAP/TAZ缺失导致的脂肪细胞死亡是否引起代偿性脂肪生成。
将Adipoq-CreERT2与mT/mG报告小鼠及Yap/Taz floxed小鼠杂交,他莫昔芬诱导后HFD 8或16周,全组织共聚焦计数Tomato阳性脂肪细胞。
避免缺失脂肪细胞被野生型细胞替代,确认YAP/TAZ对肥胖时脂肪细胞存活的必要性。
构建Ad-Yap/Taz-KO小鼠,HFD喂养后检测体重、糖耐量、vWAT/sWAT质量、TUNEL、CLS、perilipin-1、CD68、M1/M2标志基因及脂肪细胞标志基因。
确定YAP/TAZ保护脂肪细胞存活的分子机制是否通过BIM等凋亡相关基因。
对HFD 4周Ad-Yap/Taz-KO与WT脂肪细胞行RNA-seq和RT-qPCR,检测Bcl2、Bcl2l2、Bim;ChIP检测YAP与Bim启动子TEAD位点结合;3T3-L1及SVF分化脂肪细胞中siRNA敲低Yap/Taz、Bim并检测凋亡;体内AAV-shBim敲低Bim检测CLS和TUNEL。
识别肥胖脂肪组织中激活YAP/TAZ的细胞因子及其信号通路。
在3T3-L1脂肪细胞中测试palmitic acid、TNFα、IL-1β、CCL2、IL-6对YAP/TAZ靶基因和核转位的影响;体内用etanercept和anakinra干预;用C3-exoenzyme、latrunculin B、blebbistatin及siRNA敲低Arhgef2、Lats1/2、Jnk、c-Jun检测信号依赖。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 诱导Cre重组 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 |
| 脂肪细胞分离 | II型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C6885 |
| 信号通路抑制 | 渥曼青霉素 | Sigma-Aldrich | W3144 |
| 细胞处理 | 拉春库林B | Sigma-Aldrich | 428020 |
| 白细胞介素-6 | Sigma-Aldrich | I1395 | |
| SC514 | Santa Cruz Biotechnology | 354812-17-2 | |
| JNK抑制 | SP600125 | Merck Chemicals GmbH | S5567 |
| p38抑制 | p38 MAPK抑制剂III | Merck Chemicals GmbH | 506148 |
| RhoA抑制 | C3转移酶 | Cytoskeleton | CT03-A |
| 细胞处理 | 小鼠TNFα | PeproTech | 315-01 A |
| 白细胞介素-1β | Life Technologies GmbH | 10139-HNAE | |
| CCL2 | Bio-Techne GmbH | 479-JE-10 | |
| 免疫印迹/免疫荧光 | 抗YAP/TAZ抗体 | Cell Signaling Technology | 8418 |
| 染色质免疫沉淀 | 抗YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 4912 |
| 免疫印迹 | 抗磷酸化YAP (Ser127)抗体 | Cell Signaling Technology | 4911 |
| 抗磷酸化TAZ (Ser89)抗体 | Cell Signaling Technology | 59971 | |
| 抗Lamin A/C抗体 | Cell Signaling Technology | 2032 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| 抗磷酸化JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9251 | |
| 抗IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 4812 | |
| 抗P65抗体 | Cell Signaling Technology | 4764 | |
| 抗磷酸化P65 (Ser536)抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 抗BIM抗体 | Cell Signaling Technology | 2933 | |
| 抗TAZ抗体 | Sigma-Aldrich | HPA007415 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T9026 | |
| 免疫组化 | 抗CD68抗体 | Bio-rad | MCA1957 |
| 抗Perilipin-1抗体 | Cell Signaling Technology | 3470 | |
| 免疫荧光 | CellMask橙色质膜染料 | Life Technologies, Thermo Fisher Scientific | C10045 |
| TUNEL检测 | 原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche Applied Sciences | -- |
| RNA提取 | RNeasy脂肪组织小型试剂盒 | Qiagen | -- |
| cDNA合成 | ProtoScript II逆转录酶 | New England Biolabs | -- |
| RNA-seq | RiboGone哺乳动物rRNA去除试剂 | Clontech | -- |
| SMARTer链特异性总RNA样本制备试剂盒 | Clontech | -- | |
| NextSeq500测序仪 | Illumina | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMax转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 核质分离 | NE-PER核质提取试剂 | Thermo Scientific | -- |
| Western blot检测 | Pierce ECL免疫印迹底物 | Thermo Scientific | -- |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Merck | -- | |
| 血糖检测 | Accu-Chek Aviva血糖仪 | Roche | -- |
| 组织匀浆 | Retsch MM 300组织匀浆仪 | Retsch | -- |
| 染色质超声打断 | Bandelin Sonopuls hd 2070超声破碎仪 | Bandelin | -- |
| ChIP | 磁力ChIP A珠 | Millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 高脂饮食与小鼠模型 | HFD配方(含30%脂肪的Western型饲料)、开始周龄6周、喂养时长4/8/12/14/16周及SD对照 阅读提示:Methods中Animals小节及图2–图6图注 |
| iAd-Yap/Taz-KO诱导 | 他莫昔芬1 mg连续5天腹腔注射、5周龄开始、对照为处理的Yapfl/fl;Tazfl/fl同窝鼠 阅读提示:Methods中Animals小节及Supplementary Fig. 1a |
| 脂肪细胞pulse-chase | Adipoq-CreERT2;mT/mG杂交、他莫昔芬诱导、HFD 8或16周、每鼠计数细胞数 阅读提示:Methods中Adipocyte pulse-chase experiments及图2i–k |
| 体外细胞因子与抑制剂处理 | TNFα 1.1 nM、IL-1β 5.9 nM、IL-6 0.8 nM、CCL2 1.2 nM、palmitic acid 500 nM;latrunculin B 2.5 µM、blebbistatin 20 µM、C3-exoenzyme 1 µg/ml、SP600125 5 µM的处理时长与顺序 阅读提示:图5、图6图注及Methods中Reagents |
| 体内etanercept与anakinra干预 | etanercept 10 mg/kg与anakinra 25 mg/kg、腹腔注射连续7天、HFD第4周给药 阅读提示:Methods中Etanercept and anakira treatment in vivo及图5d、e |
| AAV-shBim体内敲低 | AAV血清型8、2.5×10^10 viral genomes/ml、每侧脂肪垫50 μl分五点注射、注射后HFD 4周 阅读提示:Methods中Administration of adeno-associated virus及图4k–m |
| RNA-seq与ChIP | RNA-seq每库平均35 M reads、1×75 bp单端、DESeq2阈值;ChIP使用抗YAP #4912及Bim启动子引物 阅读提示:Methods中Quantitative RT-PCR and RNA-seq、Chromatin immunoprecipitation及图4d |