BMI1 不依赖于多梳抑制复合物 1 调控前列腺癌中的雄激素受体

BMI1 regulates androgen receptor in prostate cancer independently of the polycomb repressive complex 1.

作者信息Sen Zhu, Dongyu Zhao, Lin Yan, Weihua Jiang, Jung-Sun Kim, Bingnan Gu, Qipeng Liu, Rui Wang, Bo Xia, Jonathan C Zhao, Gang Song, Wenyi Mi, Rong-Fu Wang, Xiaobing Shi, Hung-Ming Lam, Xuesen Dong, Jindan Yu, Kaifu Chen, Qi Cao
PMID29402932
发布时间2018-02-05
DOI10.1038/s41467-018-02863-3

实验完整度

高

含细胞系敲低/回补、蛋白互作与泛素化、RNA-seq/ChIP-seq及多种移植瘤和PDX体内验证

主要模型

C4-2 去势抵抗性前列腺癌细胞系 22Rv1 去势抵抗性前列腺癌细胞系 去势抵抗性 VCaP 移植瘤小鼠模型 LuCaP 35CR 患者来源移植瘤(PDX)模型

重点核对

BMI1 siRNA 敲低后 AR 蛋白下降而 AR 转录水平不变,且非细胞生长抑制所致对照实验 CHX 处理测定 AR 半衰期及 MG132/NH4Cl/氯喹对 AR 降解途径的区分 纯化蛋白体外竞争结合实验:His-BMI1 剂量依赖减少 AR-NTD 与 GST-MDM2 结合 RING1B/RING1A 双敲低及 mBMI1、mBMI1-RING、mBMI1ΔRING 回补实验 PTC209 60 mg/kg 每日5天/周体内给药及与恩杂鲁胺 10 mg/kg 联合的移植瘤实验

摘要

BMI1 是一种多梳组(PcG)蛋白,在细胞分化与增殖的表观遗传调控以及癌症干细胞自我更新中发挥关键作用。BMI1 在多种癌症中表达上调,包括前列腺癌。作为多梳抑制复合物 1(PRC1)的关键组分,BMI1 通过增强 RING1B 的酶活性,使组蛋白 H2A 第 119 位赖氨酸泛素化并抑制基因转录,从而发挥其致癌功能。在此,我们报道 BMI1 一种不依赖于 PRC1 的作用,该作用对去势抵抗性前列腺癌(CRPC)进展至关重要。BMI1 结合雄激素受体(AR),并阻止 MDM2 介导的 AR 蛋白降解,导致前列腺癌细胞中 AR 信号持续存在。更重要的是,我们证明靶向 BMI1 可有效抑制已对手术去势和恩杂鲁胺治疗产生耐药性的移植瘤生长。这些结果提示,单独阻断 BMI1 或与抗 AR 治疗联合可能更有效地抑制前列腺肿瘤生长。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
BMI1 是否以及如何调控前列腺癌细胞中雄激素受体的蛋白表达和转录活性,并能否作为去势抵抗性前列腺癌的治疗靶点。
核心机制
BMI1 不依赖 PRC1,通过其 ΔRING 结构域直接结合 AR 的 N 端结构域,竞争性抑制 MDM2 与 AR-NTD 的结合,从而阻止 MDM2 介导的 AR 泛素化和蛋白酶体降解,维持 AR 信号。
主要证据
C4-2 和 22Rv1 细胞中 BMI1 敲低降低 AR/AR-V7/PSA 蛋白而不降低 AR 转录;co-IP、凝胶过滤和纯化蛋白竞争结合实验证明 BMI1 结合 AR-NTD 并剂量依赖阻断 MDM2 结合;RING1B/RING1A 敲低不影响 AR 而 BMI1ΔRING 可回补 AR;RNA-seq、ChIP-seq 及 PTC209 在 VCaP、LuCaP 35CR 和恩杂鲁胺耐药移植瘤中抑制肿瘤生长。
研究意义
作者提出 BMI1 除作为 PRC1 转录抑制因子外,还具有不依赖 PRC1 的转录激活功能;靶向 BMI1 单独或联合抗 AR 治疗可能是抑制去势抵抗性前列腺癌特别是恩杂鲁胺耐药 CRPC 生长的潜在策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

BMI1 敲低对 AR 信号的影响及生长抑制排除

验证 BMI1 是否调控 AR 蛋白水平及 AR 信号通路,并排除细胞生长抑制的间接效应。

用两条 BMI1 特异性 siRNA 敲低 C4-2 和 22Rv1 细胞,检测 AR、AR-V7、PSA 蛋白及 AR、PSA、TMPRSS2 转录水平;并用 c-Myc/AURKA 敲低及多柔比星、VX680、依托泊苷处理作为生长抑制对照检测 AR/PSA。

2

BMI1 与 AR 的相互作用及结合结构域定位

验证 BMI1 是否与 AR 及 AR 变体直接结合并定位结合结构域。

在 C4-2、22Rv1 细胞及 LuCaP 35CR、86.2CR PDX 组织中进行 co-IP;对 C4-2 核提取物进行 Sephacryl S-300 凝胶过滤及分馏 co-IP;在 293T 细胞中转染 Halo-AR 全长、DBD、LBD、NTD 及 AR-V7、AR-Ve567s 进行 pull-down 和 IP。

3

BMI1 稳定 AR 蛋白的降解途径与 MDM2 机制验证

验证 BMI1 是否通过蛋白酶体途径稳定 AR,并确认 MDM2 介导的泛素化参与其中。

siBMI1 后 CHX 处理检测 AR 半衰期;用 MG132、NH4Cl、氯喹区分降解途径;siBMI1 与 siMDM2 联合后 IP 检测 AR 泛素化;MDM2 siRNA 和抑制剂回补实验;纯化 AR-NTD、GST-MDM2 与不同剂量 His-BMI1 进行 GST pull-down 竞争结合实验。

4

PRC1 非依赖性验证与结构域回补

验证 BMI1 调控 AR 是否独立于 PRC1 及其 RING 结构域。

敲低 RING1B、RING1A、CBX7、CBX8、Mel-18 检测 AR/PSA;PRT4165 处理检测 H2A 泛素化与 AR/PSA;RING1B/RING1A 双敲低后进一步敲低 BMI1;用抗 siRNA 的小鼠全长 BMI1、mBMI1-RING、mBMI1ΔRING 慢病毒回补;纯化 GST-BMI1、GST-BMI1ΔRING、GST-RING1B 进行体外结合与竞争实验。

5

转录组与结合组学分析

在全基因组层面判断 BMI1 与 RING1B 调控基因的重叠及 BMI1 对 AR 靶基因的调控方式。

对 BMI1 或 RING1B 敲低的 C4-2 细胞进行 RNA-seq 和差异表达、KEGG、GSEA 及生存分析;用抗 AR 和抗 BMI1 抗体进行 ChIP-seq 及 ChIP-qPCR 检测 AR 在靶基因上游的富集。

6

PTC209 体外抑制 AR 信号及与恩杂鲁胺协同

评估 BMI1 抑制剂 PTC209 对 AR 信号和细胞增殖的作用及与恩杂鲁胺的联合效果。

PTC209 处理 C4-2 和 22Rv1 检测 BMI1、AR、AR-V7;检测 AR 半衰期及 MG132 回复;BMI1 各突变体回补;在 LNCaP、VCaP、C4-2、22Rv1 及 AR 阴性 DU145、PC3 中检测 PTC209 与恩杂鲁胺联合的细胞活力与联合指数。

7

体内移植瘤与耐药模型验证

评估靶向 BMI1 对去势抵抗性及恩杂鲁胺耐药前列腺癌肿瘤生长的体内效果。

构建去势抵抗性 VCaP 移植瘤、22Rv1 恩杂鲁胺耐药移植瘤及 LuCaP 35CR PDX 模型,给予 PTC209、恩杂鲁胺或联合治疗,测量肿瘤体积、无进展生存及体重,检测肿瘤组织 BMI1、AR 蛋白。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
PTC209MedChem ExpressHY-15888
恩杂鲁胺DieckmannIN034
PRT4165TOCRIS5047
MG132Calbiochem133407-82-6
氯化铵Sigma12125-02-9
磷酸氯喹SigmaC6628
MDM2 抑制剂 373225Millipore--
MDM2 抑制剂 373226Millipore--
纯化 6×His AR-NTD 蛋白Ray BioteckRB-14-0003P
纯化 His-BMI1 蛋白ORIGENETP760041
谷胱甘肽琼脂糖 4B(GST 磁珠)GE Healthcare17-0756-01
Lipofectamine 2000 转染试剂Invitrogen1815561
Opti-MEM 培养基Gibco1774114
Dynabeads 蛋白 A 磁珠Invitrogen10002D
Dynabeads 蛋白 G 磁珠Invitrogen10004D
PVDF 膜BIO-RAD162-0177
RNA 小量制备试剂盒ZYMO ResearchR2052
amfiRivert cDNA 合成预混液GenDEPOTR5600-100
Power SYBR Green PCR 预混液Applied Biosystem4367659
染色质免疫沉淀试剂盒Millipore17-295
CellTiter-Glo 发光法细胞活力检测试剂盒----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞系与培养
细胞来源(LNCaP、VCaP、22Rv1 购自 ATCC,C4-2 由 Dr. Arul M. Chinnaiyan 提供)、传代次数(接收后 20 代以内)、培养基与血清类型(VCaP 用 10% BGS,其余用 10% FBS)
阅读提示:Methods 中 Cell culture 小节
siRNA/shRNA 敲低与回补
BMI1 siRNA #1 s2015、#2 s2016,RING1B siRNA #1 s12067、#2 s12068,MDM2 siRNA #1 s58628、#2 s58629;BMI1 shRNA TRCN0000020156;转染细胞数 3×10^5、80% 汇合度
阅读提示:Methods 中 Transfection 与 Lentiviral constructs 小节
蛋白降解与泛素化检测
CHX 10 µg/ml 时间点;MG132 20 µM、NH4Cl 10 mM、氯喹 200 µM;转染后加药时间(12 h 后 36 h 或 24 h 后 48 h)
阅读提示:Fig. 2a–c 图注及 Methods 中 Drug treatments and antibodies
PRC1 非依赖性验证
PRT4165 100 µM 处理 24 或 48 h;RING1B/RING1A 双敲低后回补小鼠 BMI1 各突变体;抗 BMI1 抗体仅识别人 BMI1 不识别小鼠 BMI1
阅读提示:Fig. 3a–c、Fig. 3g 图注
体外竞争结合实验
His-BMI1 剂量 0、2、10 µg;GST-BMI1ΔRING 0 或 2 µg;4°C 孵育 12 h
阅读提示:Fig. 2f、Fig. 3e–f 图注
体内移植瘤实验
VCaP 2×10^6 细胞加 50% Matrigel 皮下接种;去势时肿瘤 200–300 mm3;PTC209 60 mg/kg、恩杂鲁胺 10 mg/kg 每日 5 天/周;给药途径(PTC209 皮下、恩杂鲁胺灌胃);每组 n 值与终止时间
阅读提示:Methods 中 Murine prostate tumor xenograft model 及 Fig. 6 图注
联合用药细胞实验
药物浓度梯度、处理 96 h、联合指数计算软件 Calcusyn;AR 阳性与 AR 阴性细胞对比
阅读提示:Methods 中 Cell growth assay 及 Fig. 6a–b 图注