TREM2与TDP-43相互作用并介导小胶质细胞对TDP-43相关神经变性的神经保护作用

TREM2 interacts with TDP-43 and mediates microglial neuroprotection against TDP-43-related neurodegeneration

作者信息Manling Xie, Yong U Liu, Shunyi Zhao, Lingxin Zhang, Dale B Bosco, Yuan-Ping Pang, Jun Zhong, Udit Sheth, Yuka A Martens, Na Zhao, Chia-Chen Liu, Yongxian Zhuang, Liewei Wang, Dennis W Dickson, Mark P Mattson, Guojun Bu, Long-Jun Wu
PMID34916658
发布时间2022-01
DOI10.1038/s41593-021-00975-6

实验完整度

包含多种独立证据层级:体外共免疫沉淀、体内免疫共沉淀、SILAC质谱、SPR、MD模拟及多种小鼠模型和人类组织验证,并进行功能验证。

主要模型

新生小鼠ICV注射AAV9.CAG.hTDP-43.GFP模型 成年小鼠初级运动皮层立体定位注射模型 rNLS8转基因小鼠模型 人iPSC来源神经元

重点核对

TREM2敲除对hTDP-43诱导的行为和病理的影响(新生ICV模型) hTDP-43诱导的CD11c+小胶质细胞亚群是否依赖TREM2 TREM2介导的小胶质细胞对hTDP-43的吞噬作用 TDP-43与TREM2的相互作用(体外、体内及人组织) TREM2与hTDP-43的SPR结合动力学

摘要

髓系细胞触发受体2(TREM2)与神经退行性疾病风险相关。然而,TREM2在神经变性中的功能仍不完全清楚。本研究利用病毒介导和转基因小鼠模型,探讨了小胶质细胞TREM2在TAR-DNA结合蛋白43 kDa(TDP-43)相关神经变性中的作用。我们发现,TREM2缺陷损害了小胶质细胞对病理性TDP-43的吞噬清除,并加剧了神经元损伤和运动障碍。质谱流式分析显示,hTDP-43诱导了一个TREM2依赖的、具有高CD11c表达和吞噬能力的小胶质细胞亚群。利用质谱和表面等离子体共振分析,我们进一步证明了TDP-43与TREM2在体外和体内以及ALS患者组织中的相互作用。我们通过计算鉴定了hTDP-43中与TREM2相互作用的区域。我们的数据强调,TDP-43可能是小胶质细胞TREM2的一个配体,这种相互作用介导了小胶质细胞在TDP-43相关神经变性中的神经保护作用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
TREM2在TDP-43相关神经变性中的功能及其机制是什么?
核心机制
TDP-43是TREM2的配体,TREM2与病理性TDP-43的相互作用介导小胶质细胞对TDP-43的吞噬清除和神经保护。
主要证据
TREM2缺失导致小胶质细胞吞噬功能受损、CD11c+亚群消失、TDP-43累积增加和运动功能恶化;免疫共沉淀、SILAC质谱和SPR证实TDP-43与TREM2直接结合。
研究意义
本研究指出小胶质细胞TREM2是改善TDP-43相关神经变性的潜在治疗靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立hTDP-43小鼠模型

研究TREM2在TDP-43蛋白病中的作用

通过新生小鼠ICV注射AAV9.CAG.hTDP-43.GFP,以及成年小鼠初级运动皮层立体定位注射,在神经元中表达hTDP-43。

2

评估TREM2缺失对神经变性和运动功能的影响

确定TREM2在hTDP-43诱导的神经变性中的作用

比较WT和TREM2 KO小鼠的生存率、后肢抓握、转棒表现、Nissl染色和NeuN染色,并检测可溶性和不溶性hTDP-43水平。

3

分析小胶质细胞表型变化

研究TREM2缺陷对hTDP-43诱导的小胶质细胞反应的影响

使用CyTOF分析小胶质细胞亚群,并通过免疫染色检查CD11c、P2Y12和TMEM119等标记物。

4

验证TREM2介导的吞噬清除作用

确定TREM2是否介导小胶质细胞对hTDP-43的吞噬和清除

通过CD68染色、GFP-hTDP-43与Iba1共定位、以及可溶性和sarkosyl不溶性蛋白的Western blot检测。

5

验证TDP-43与TREM2的相互作用

证明TDP-43与TREM2在体外和体内相互作用

通过共免疫沉淀、LC-MS/MS和SILAC分析鉴定相互作用,并在rNLS8小鼠和ALS患者组织中验证。

6

计算模拟和SPR验证结合位点

确定TDP-43与TREM2的结合位点和亲和力

使用分子动力学模拟预测hTDP-43的低复杂度结构域片段与hTREM2胞外域的结合,并通过SPR测量结合动力学。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Gibco--
胎牛血清Gibco--
Geltrex基质胶Gibco--
AAV9.CAG.hTDP-43.GFP病毒----
抗NeuN抗体Abcamab104225
抗CD68抗体Abcamab125212
抗CD11c抗体Thermo14011482
抗P2Y12抗体AnaspecAS-55043A
抗Iba1抗体Abcamab178847
抗磷酸化TDP-43抗体Proteintech22309-1-AP
抗GFAP抗体CST3670
抗CNPase抗体Proteintech13427-1-AP
抗TMEM119抗体Abcamab209064
抗TREM2抗体R&DAF1729
Alexa Fluor二抗Thermoa32740, a11016
Alexa Fluor驴抗羊594Thermoa11016
Fluoromount-G封片剂SouthernBiotech--
hTDP-43抗体Proteintech60019-2-Ig
磷酸化hTDP-43抗体Proteintech22309-1-AP
M.O.M.免疫检测试剂盒Vector LaboratoriesBMK-2202
生物素化二抗Vector LaboratoriesBA-9200
Vectastain-ABC试剂盒Vector Laboratories--
ImmPACT DAB底物过氧化物酶(HRP)试剂盒Vector Laboratories--
DEPEX封片剂Electron Microscopy Science--
成人脑组织解离试剂盒Miltenyi Biotec130-107-677
Maxpar细胞染色缓冲液Fluidigm--
Helios质谱流式系统Fluidigm--
RIPA裂解缓冲液Cell signaling--
蛋白酶抑制剂混合物Thermo Fisher Scientific--
磷酸酶抑制剂Thermo Fisher Scientific--
十二烷基肌氨酸钠----
抗hTDP-43抗体Proteintech60019-2-Ig
抗总TDP-43抗体Proteintech10782-2-AP
抗磷酸化TDP-43(Ser409/410)抗体COSMOBIOCAC-TIP-PTD-M01
抗GFP抗体Cell signaling2956s
抗GAPDH抗体Santa Cruzsc-32233
Myc-Trap琼脂糖珠Chromotekyta-10
GFP-Trap琼脂糖珠Chromotekgta-10
抗Myc抗体SigmaSAB4700447
TREM2生物素化抗体R&DBAF1729
NeutrAvidin琼脂糖珠Thermo Fisher29200
抗小鼠TREM2抗体[5F4]abcamab252876
抗人TREM2抗体Cell Signaling91068
Dynabeads蛋白AThermo fisher22810
抗人TREM2抗体(山羊)R&DAF1828
两性离子去污剂3-16----
Q Exactive质谱仪Thermo Scientific--
纳升液相系统Dionex--
含重同位素氨基酸的DMEM----
Biacore T200生物大分子相互作用分析仪GE Healthcare Life Sciences--
人TREM2蛋白Sino Biological11084-H08H
人TDP-43蛋白R&DAP-190-100
CM5传感芯片GE Healthcare Life Sciences--
氨基偶联试剂盒GE Healthcare Life Sciences--
1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺(EDC)----
N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)----
共聚焦显微镜LSM510Zeiss--
荧光显微镜BZ-X800Keyence--
旷场活动箱Med Associates--
转棒仪Med Associates Inc--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
小鼠模型
新生小鼠ICV注射病毒滴度和体积(9.0E+12 vg/mL,2μL),成年小鼠立体定位注射坐标和参数,TREM2 KO小鼠品系
阅读提示:Methods: Intracerebroventricular injections, Stereotaxic intracerebral injection, Mice
病毒表达
AAV9.CAG.hTDP-43.GFP和AAV9.CAG.Empty对照,表达水平验证
阅读提示:Methods: Intracerebroventricular injections, 图1a,扩展数据图1
行为学测试
后肢抓握评分标准和测试时间,转棒加速方案,旷场测试时间
阅读提示:Methods: Hindlimb clasping, Open field testing, Rotarod
小胶质细胞表型分析
CyTOF抗体面板和样本处理,CD11c+亚群门控策略
阅读提示:Methods: Mass cytometry/CyTOF of isolated brain cells, 图2,扩展数据图4
蛋白相互作用
免疫共沉淀抗体和条件,SILAC标记,SPR蛋白浓度和芯片
阅读提示:Methods: Immunoprecipitation assay, SILAC, Surface Plasmon Resonance