纳米抗体免疫与噬菌体展示筛选
获得靶向IL-18Rα和IL-18Rβ的高亲和力纳米抗体家族
用纯化的IL-18Rα或IL-18Rβ抗原免疫三只双峰驼,构建免疫纳米抗体噬菌体展示库,经生物淘选和流式细胞术筛选结合细胞表面抗原的克隆,测序并基于CDR3分型。
Nanobody-engineered bispecific IL-18 mimetics drive antitumor immunity by engaging CD8+ T cell and evading IL-18BP in preclinical models
包含PBMC、CD8+ T细胞体外功能验证、RNA-seq机制分析及CDX/PDX体内模型,含CD8+ T细胞清除验证。
健康供体外周血单个核细胞(PBMCs)及分离的CD8+ T细胞 PK-59细胞系来源异种移植(CDX)huPBMC-NCG小鼠模型 H23细胞系来源异种移植(CDX)huPBMC-NCG小鼠模型 两例患者来源异种移植(PDX)肺癌huPBMC-NCG小鼠模型
A4B2-mdFc单药剂量:0.37、1.86、9.32 mg/kg,腹腔注射每周两次共3周;IL-18对照0.32 mg/kg PDX模型A4B2-mdFc剂量1.86 mg/kg,腹腔注射每3天一次共6次;anti-CD8抗体10 mg/kg,于A4B2-mdFc前1天给药 联合治疗剂量:anti-PD-1(nivolumab)5 mg/kg,anti-CTLA-4(ipilimumab)5 mg/kg,A4B2-mdFc 1.86 mg/kg RNA-seq处理条件:CD8+ T细胞经isotype、10 nM IL-18、10 nM IL-18+100 nM IL-18BP、10 nM A4B2-mdFc、10 nM A4B2-mdFc+100 nM IL-18BP处理24小时,含10 ng/mL human IL-12 IFN-γ释放筛选条件:1 nM抗体+10 ng/mL human IL-12,孵育17–24小时;PBMC 200,000细胞/孔
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得靶向IL-18Rα和IL-18Rβ的高亲和力纳米抗体家族
用纯化的IL-18Rα或IL-18Rβ抗原免疫三只双峰驼,构建免疫纳米抗体噬菌体展示库,经生物淘选和流式细胞术筛选结合细胞表面抗原的克隆,测序并基于CDR3分型。
评估筛选获得的纳米抗体对人和食蟹猴IL-18Rα/IL-18Rβ的亲和力及细胞表面结合能力
通过ELISA、表面等离子共振(SPR)和流式细胞术检测9个抗IL-18Rα纳米抗体家族和15个抗IL-18Rβ纳米抗体家族与hIL-18Rα/hIL-18Rβ及CynoIL-18Rα/CynoIL-18Rβ蛋白及过表达293T细胞的结合。
筛选能有效诱导IFN-γ释放的最佳双特异性纳米抗体构型
将9个抗IL-18Rα纳米抗体与15个抗IL-18Rβ纳米抗体进行组合融合,连接至人IgG1 Fc,构建270种双特异性抗体,通过PBMC IFN-γ释放实验筛选,并优化连接子长度和Fc修饰。
验证A4B2-mdFc激活CD8+ T细胞的转录组特征及其规避IL-18BP抑制的能力
从PBMC分离CD8+ T细胞,分别用isotype、IL-18、IL-18+IL-18BP、A4B2-mdFc、A4B2-mdFc+IL-18BP处理,进行RNA-seq、差异表达基因分析、PCA、热图、KEGG/GO富集和GSEA。
评估A4B2-mdFc单药在细胞系来源异种移植模型中的剂量依赖性抗肿瘤效果及CD8+ T细胞浸润
建立PK-59和H23 huPBMC-NCG CDX模型,随机分组给予isotype、IL-18或A4B2-mdFc三个剂量,监测肿瘤生长、肿瘤重量,免疫荧光检测hCD8阳性细胞浸润。
在患者来源异种移植模型中评估A4B2-mdFc疗效并验证CD8+ T细胞的关键作用
建立两例肺癌PDX模型,给予isotype、A4B2-mdFc或A4B2-mdFc+anti-CD8抗体,监测肿瘤生长,流式细胞术检测CD8+ T细胞和IFN-γ+CD8+ T细胞浸润。
评估A4B2-mdFc与anti-PD-1或anti-CTLA-4联合治疗是否增强抗肿瘤效果及安全性
在PK-59 CDX模型中,分组给予isotype、A4B2-mdFc、anti-PD-1、anti-CTLA-4、A4B2-mdFc+anti-PD-1、A4B2-mdFc+anti-CTLA-4,监测肿瘤生长和重量,检测血清ALT/AST/ALP及主要器官H&E。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | BasalMedia | L220KJ |
| 胎牛血清 | BasalMedia | ST30-3302 | |
| ELISA | 抗HA.11表位标签抗体 | BioLegend | 901524 |
| TMB溶液 | Biopanda Diagnostics | TMB-S-004 | |
| IFN-γ释放实验 | 人IL-12 | -- | IL2-H5210 |
| IFN-γ检测试剂盒 | MultiSciences | EK180HS | |
| RNA-seq | CD8+ T细胞分离试剂盒 | BioLegend | 480012 |
| TruSeq RNA样本制备试剂盒 | -- | -- | |
| 动物实验 | 基质胶 | Yeasen | 40183ES08 |
| 免疫荧光 | 抗人CD8抗体 | Servicebio | GB114123 |
| 异硫氰酸荧光素标记二抗 | Servicebio | GB25303 | |
| 流式分析 | 抗CD45抗体 | BioLegend | 304028 |
| 抗CD3抗体 | BioLegend | 300440 | |
| 抗CD8抗体 | BioLegend | 300926 | |
| 抗人IFN-γ抗体 | BioLegend | 506506 | |
| 动物实验 | 抗CD8抗体 | Bio X Cell | BE0004-2 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 纳米抗体免疫与筛选 | 免疫动物数量(三只双峰驼)、抗原剂量(1 mg/次)、免疫次数(7次,每周一次)、淘选轮数(IL-18Rα 3轮,IL-18Rβ 4轮) 阅读提示:Methods 'Preparation and screening of anti-IL-18Rα or anti-IL-18Rβ nanobody candidates'及Figure 1 |
| 双特异性抗体构建与IFN-γ释放筛选 | 抗体浓度(1 nM)、IL-12浓度(10 ng/mL)、PBMC数量(200,000/孔)、孵育时间(17–24 h)、阳性对照(1 nM IL-18,0.1 nM DR-18)、连接子长度及Fc修饰 阅读提示:Methods 'IFN-γ release assay'及Figure 3 |
| CD8+ T细胞RNA-seq | 细胞处理浓度(10 nM IL-18或A4B2-mdFc,100 nM IL-18BP)、IL-12浓度(10 ng/mL)、孵育时间(24 h)、RNA质量标准、测序平台 阅读提示:Methods 'RNA-seq analysis'及Figure 4 |
| CDX模型单药治疗 | 细胞接种数量(1×10^8)、Matrigel比例(50%)、PBMC回输数量(5×10^6)、肿瘤体积分组标准(约100 mm³)、剂量(0.37/1.86/9.32 mg/kg及IL-18 0.32 mg/kg)、给药频率(每周两次,共3周)、终点时间(PK-59第21天,H23第25天) 阅读提示:Methods 'Tumor treatment'及Figures 5和6 |
| PDX模型及CD8+ T细胞清除 | PDX传代(P3用于正式实验)、PBMC回输数量(5×10^6)、肿瘤体积分组标准(50–100 mm³)、每组鼠数(5只)、A4B2-mdFc剂量(1.86 mg/kg)及给药频率(每3天一次共6次)、anti-CD8剂量(10 mg/kg)及给药时间(A4B2-mdFc前1天) 阅读提示:Methods 'Tumor treatment'及Figure 7 |
| 联合治疗及安全性评估 | A4B2-mdFc剂量(1.86 mg/kg)、anti-PD-1(nivolumab)和anti-CTLA-4(ipilimumab)剂量(5 mg/kg)、给药频率(每周两次共3周)、血清ALT/AST/ALP检测时间(每周)、主要器官H&E 阅读提示:Methods 'Tumor treatment'及Figure 8、Figures S14–S16 |