αKlotho在Pkd1突变肾脏中的表达分析
确定αKlotho在Pkd1突变小鼠肾脏中是否下调
通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光染色检测Pkd1-HET和Pkd1-HOMO小鼠在出生后第7、14和21天肾脏中αKlotho的表达
α -Klotho Promotes Cell Death and Suppresses Inflammation through TNF-Cellular Inhibitor of Apoptosis Protein 1 Signaling in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
包含体外细胞系、两种体内小鼠模型和scRNA-seq组学数据,并进行了功能与机制验证。
PH2和PN24细胞(Pkd1野生型与突变型肾上皮细胞) Pkd1-HOMO和Pkd1-HOMO-KLTg小鼠肾脏 Pkd1fl/fl:tamoxifen-Cre可诱导小鼠肾脏 HEK293T细胞(用于截短体co-IP)
转基因αKlotho和重组αKlotho对Pkd1突变小鼠肾脏囊肿指数、肾脏/体重比和血尿素氮水平的影响 重组αKlotho给药剂量10 μg/kg,腹腔注射,每周一次,最长6个月 TUNEL检测囊衬上皮细胞凋亡和F4/80染色检测巨噬细胞募集 单细胞RNA测序分析Pkd1-HET、Pkd1-HOMO和Pkd1-HOMO-KLTg小鼠肾脏 αKlotho与cIAP1相互作用及其对cIAP1二聚化和稳定性的调控
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定αKlotho在Pkd1突变小鼠肾脏中是否下调
通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光染色检测Pkd1-HET和Pkd1-HOMO小鼠在出生后第7、14和21天肾脏中αKlotho的表达
验证转基因αKlotho是否延缓Pkd1突变小鼠肾脏囊肿生长
生成Pkd1-HOMO-KLTg小鼠,在出生后第21天评估囊肿指数、肾脏/体重比、血尿素氮水平、细胞增殖和生存率
验证重组αKlotho治疗是否延缓囊肿生长
在Pkd1fl/fl:tamoxifen-Cre小鼠中诱导Pkd1敲除,腹腔注射重组αKlotho(10 μg/kg,每周一次)至6个月,评估囊肿指数、KW/BW、BUN和信号通路
验证αKlotho是否影响Pkd1突变肾脏中的细胞死亡和炎症
使用TUNEL检测囊衬上皮细胞凋亡,F4/80染色检测巨噬细胞募集
在单细胞分辨率下揭示转基因αKlotho介导的转录组变化和细胞间通讯
对Pkd1-HET、Pkd1-HOMO和Pkd1-HOMO-KLTg小鼠第7、14、21天肾脏进行scRNA-seq,分析差异表达基因、通路富集和CellChat细胞间通讯
确定cIAP1是否为αKlotho的靶点并研究其调控机制
在PN24和PH2细胞中检测αKlotho对cIAP1蛋白和mRNA水平的影响,使用MG132、co-IP、GST pull-down、GFP截短体构建、二聚化分析
验证αKlotho是否通过cIAP1降解促进死亡复合物形成
在PN24细胞中处理TNF(20 ng/ml)、αKlotho(1 μg/ml)、MG132(10 μM)、Z-VAD(2 μM)6小时,检测caspase-8/RIPK1/FADD复合物及caspase-3活化
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 抗STAT3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-482 |
| 抗绿色荧光蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9996 | |
| 抗caspase8抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7890 | |
| 抗磷酸化STAT3-Y705抗体 | Cell Signaling Technology | 9131 | |
| 抗磷酸化p65-S536抗体 | Cell Signaling Technology | 3031 | |
| 抗磷酸化AKT-S473抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗FLIP L/S抗体 | Cell Signaling Technology | 56343 | |
| 抗GFP抗体 | Cell Signaling Technology | 2956 | |
| 抗泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 3936 | |
| 抗PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| 抗cleaved caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 免疫荧光 | Ki67抗体 | Abcam | ab15580 |
| Western blot | 抗Klotho抗体 | R&D System | AF1819 |
| 免疫沉淀 | 抗p65抗体 | Protein Tech | 10745-1-AP |
| 抗GFP抗体 | Protein Tech | 50430-2-AP | |
| 抗Klotho抗体 | Protein Tech | 28100-1-AP | |
| 抗cIAP1抗体 | Protein Tech | 66626-1-Ig | |
| 抗TNFR1抗体 | Protein Tech | 21574-1-AP | |
| Western blot | 抗cIAP1抗体 | Enzo Diagnostics | ALX-803-335-C100 |
| 抗FADD抗体 | Enzo Diagnostics | ADI-AAM-212 | |
| 免疫沉淀和Western blot | 抗RIPK1/RIP1抗体 | BD Biosciences | 610458 |
| Western blot | 抗actin抗体 | Sigma-Aldrich | A5316 |
| 驴抗兔IgG-辣根过氧化物酶 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2313 | |
| 驴抗山羊IgG-辣根过氧化物酶 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2020 | |
| 山羊抗小鼠IgG-辣根过氧化物酶 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2005 | |
| 药物处理 | 重组小鼠Klotho | R&D System | 1819-KL |
| MG132 | -- | -- | |
| Z-VAD | -- | -- | |
| 肿瘤坏死因子 | -- | -- | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 转基因αKlotho小鼠囊肿生长评估 | 小鼠模型:Pkd1-HOMO-KLTg和Pkd1-HOMO;时间点:出生后第21天;样本量:n=12每组;检测指标:囊肿指数、KW/BW、BUN、Ki67、生存率 阅读提示:Methods中的Mouse Strains and Treatments和Results中Transgenic αKlotho Delayed Cyst Growth部分,Figure 2 |
| 重组αKlotho治疗实验 | 模型:Pkd1fl/fl:tamoxifen-Cre小鼠;给药剂量:10 μg/kg;给药方式:腹腔注射;频率:每周一次;持续时间:至6个月;对照:vehicle 阅读提示:Methods中的Mouse Strains and Treatments和Results中Treatment with Recombinant αKlotho部分,Figure 3 |
| 细胞凋亡和巨噬细胞募集检测 | 模型:Pkd1-HOMO-KLTg、Pkd1-HOMO和重组αKlotho治疗小鼠;检测方法:TUNEL和F4/80免疫染色;时间点:出生后第21天 阅读提示:Results中Transgenic and Recombinant αKlotho Induced Cyst-Lining Epithelial Cell Apoptosis部分,Figure 4 |
| 单细胞RNA测序分析 | 模型:Pkd1-HET、Pkd1-HOMO、Pkd1-HOMO-KLTg小鼠;时间点:第7、14、21天;方法:scRNA-seq和CellChat分析 阅读提示:Methods中的ScRNA-seq in Mouse Kidneys和Results中Transgenic αKlotho Played a Systematical Role部分,Supplemental Methods |
| αKlotho与cIAP1相互作用及降解实验 | 细胞:PH2和PN24;处理:重组αKlotho 1 μg/ml,MG132 10 μM,6小时;检测:co-IP、GST pull-down、Western blot 阅读提示:Results中cIAP1 Was the Novel Target of αKlotho部分,Figure 6和Supplemental Figure 11 |
| 死亡复合物形成实验 | 细胞:PN24;处理:TNF 20 ng/ml,αKlotho 1 μg/ml,MG132 10 μM,Z-VAD 2 μM,6小时;检测:caspase-8/RIPK1/FADD复合物和cleaved PARP 阅读提示:Results中αKlotho Mediated the Downregulation of cIAP1部分,Figure 7 |