缺氧性CA9高表达间充质样胶质瘤干细胞促进复发性胶质母细胞瘤中ANXA1-FPR1依赖性巨噬细胞极化

Hypoxic CA9-high mesenchymal-like glioma stem cells promote ANXA1-FPR1-dependent macrophage polarization in recurrent glioblastoma

作者信息Hangqi Gao, Guiting You, Jianhuang Huang, Yijing Lin, Jiexin Huang, Risheng Liang, Caihou Lin
PMID42374432
发布时间2026-06-29
DOI10.1186/s12974-026-03905-0

实验完整度

含单细胞、蛋白质组、配对临床标本及体外/体内功能验证,涵盖CA9敲低/过表达、ANXA1挽救和FPR1阻断。

主要模型

U87-MG和U251人胶质瘤细胞系 患者来源胶质瘤干细胞(GSCs) THP-1来源巨噬细胞 BALB/c nude小鼠皮下异种移植瘤模型

重点核对

CA9敲低效率:U251和U87-MG中CA9 mRNA分别降低80.19%和77.38%(qRT-PCR) 缺氧处理条件:1% O₂、5% CO₂、94% N₂培养48 h,常氧对照为21% O₂ FPR1阻断:环孢素H(CsH)10 µM预处理1 h(体外)或10 mg/kg腹腔注射隔日一次(体内) CA9敲低对ANXA1分泌的影响:U87-MG中从512.8 ± 45.2 pg/mL降至186.4 ± 23.7 pg/mL(ELISA) 体内实验样本量:每组n = 8只小鼠,皮下注射5 × 10⁶个细胞

摘要

背景:复发性胶质母细胞瘤(rGBM)的特征是显著髓系重塑和深度免疫抑制微环境。尽管碳酸酐酶9(CA9)是与侵袭性胶质母细胞瘤(GBM)行为相关的经典缺氧诱导分子,但其在rGBM中的细胞状态特异性分布及其在胶质瘤干细胞(GSC)-巨噬细胞串扰中的作用仍不完全清楚。方法:我们整合了公共转录组队列、单细胞RNA测序、定量蛋白质组学、配对临床标本以及体外/体内功能实验,以确定CA9在rGBM中的作用。在单细胞分辨率下解析恶性细胞状态和肿瘤相关巨噬细胞(TAM)亚群,并通过计算推断细胞间通讯。在GBM细胞系和患者来源GSC中建立CA9功能获得和缺失模型。通过qRT-PCR、Western blotting、ELISA和启动子报告基因实验评估ANXA1表达和分泌。使用条件培养基转移、重组ANXA1挽救和环孢素H药理学FPR1阻断评估巨噬细胞极化。结果:CA9在GBM中上调,在间充质和复发性肿瘤中进一步富集,并与较差生存相关。单细胞分析将CA9主要定位在一个缺氧相关的MES样GSC亚群,该亚群在复发性样本中扩增并表现出升高的干性。复发性肿瘤还显示SPP1+免疫抑制性TAM增加。蛋白质组学、转录组学和细胞-细胞通讯分析优先将ANXA1作为具有分泌性免疫调节潜力的CA9相关下游介质。缺氧诱导CA9和ANXA1,缺氧反应元件的突变减弱了ANXA1启动子激活。CA9敲低降低了ANXA1表达和分泌,损害了GBM生长表型,并减弱了缺氧驱动的ANXA1诱导。CellChat突出了复发性GBM中缺氧MES样GSC与SPP1+TAM之间增强的信号传导,提名ANXA1-FPR1作为领先的配体-受体轴。在功能上,CA9高表达GBM细胞的条件培养基促进M2样巨噬细胞极化,该作用被CA9敲低减弱,被重组ANXA1部分恢复,并被FPR1拮抗显著抑制,支持ANXA1作为贡献性旁分泌介质,并被FPR1拮抗显著抑制。在体内,CA9敲低以及在CA9完整肿瘤中FPR1阻断,减少了M2样巨噬细胞相关信号。结论:CA9在rGBM中富集于缺氧MES样GSC,并促进支持免疫抑制性巨噬细胞极化的ANXA1依赖性旁分泌程序。这些发现确定了一个CA9-ANXA1-FPR1相关的神经免疫串扰轴,将缺氧干细胞样肿瘤状态与复发性GBM中的髓系重塑联系起来,其中ANXA1作为贡献性旁分泌介质而非CA9驱动的免疫抑制的唯一效应器。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
CA9在复发性胶质母细胞瘤中是否富集于特定胶质瘤干细胞状态,并通过旁分泌信号参与肿瘤-髓系细胞通讯?
核心机制
缺氧诱导的CA9在MES样GSC中放大ANXA1的表达和分泌,分泌的ANXA1通过FPR1相关信号促进SPP1+肿瘤相关巨噬细胞向M2样免疫抑制表型极化。
主要证据
单细胞RNA测序显示CA9富集于复发性GBM的缺氧相关MES样GSC亚群;蛋白质组学和分子实验证明CA9正向调节ANXA1表达和分泌;条件培养基、重组ANXA1挽救和FPR1拮抗实验证实ANXA1-FPR1轴介导巨噬细胞M2样极化;体内CA9敲低和CsH处理减少M2样巨噬细胞信号。
研究意义
研究确定了CA9-ANXA1-FPR1相关的神经免疫串扰轴,将缺氧干细胞样肿瘤状态与复发性GBM中的髓系重塑联系起来,为理解缺氧适应与髓系重编程交叉点的神经免疫串扰提供了框架。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

公共队列与临床样本分析CA9表达

确定CA9在GBM中的临床相关性及其与分子亚型、复发和预后的关系

分析TCGA-GBM、CGGA-GBM公共转录组数据,比较CA9在GBM与对照、不同分子亚型、原发与复发组织中的表达,并进行生存分析和ROC分析;对配对原发/复发GBM临床标本进行免疫荧光共染色检测CA9和Nestin。

2

单细胞RNA测序解析细胞异质性和CA9分布

在单细胞分辨率下解析原发和复发GBM的细胞组成,定位CA9表达的恶性细胞状态

分析GSE174554中80例IDH野生型GBM样本(40原发,40复发)的scRNA-seq数据,进行质量控制、聚类、细胞类型注释、恶性细胞鉴定和亚群再聚类,使用Monocle2进行伪时间分析,CytoTRACE2评估分化潜能,CellChat推断细胞间通讯。

3

CA9功能获得/缺失对GBM恶性表型的影响

验证CA9对GBM细胞增殖、凋亡、细胞周期和TMZ敏感性的功能贡献

在U251和U87-MG中建立CA9敲低(shRNA)和过表达稳转株,通过CCK-8检测增殖,Annexin V-FITC/PI流式检测凋亡,PI流式检测细胞周期,TMZ剂量反应评估IC50。

4

定量蛋白质组学筛选CA9下游介质

鉴定CA9调控的下游分泌性免疫调节候选蛋白

对CA9-NC和CA9-KD U87-MG细胞(各3个生物学重复)进行FASP酶解、TMT 6plex标记、nanoLC-MS/MS分析,筛选差异表达蛋白,结合公共队列相关性和巨噬细胞丰度关联优先筛选ANXA1。

5

验证CA9对ANXA1的转录和分泌调控

确认CA9在转录和分泌水平正向调控ANXA1

通过qRT-PCR和Western blotting检测CA9敲低/过表达后ANXA1 mRNA和蛋白变化;ELISA检测条件培养基中分泌型ANXA1;双荧光素酶报告基因实验检测野生型或HRE突变型ANXA1启动子活性。

6

缺氧处理验证CA9对ANXA1诱导的放大作用

确定缺氧条件下CA9对ANXA1表达和分泌的贡献

将U87-MG和患者来源GSC在1% O₂缺氧条件下培养48 h,检测HIF-1α、CA9和ANXA1 mRNA及分泌型ANXA1;比较CA9-NC和CA9-KD细胞在缺氧下ANXA1诱导倍数。

7

体外巨噬细胞极化实验和ANXA1挽救

验证CA9高表达肿瘤细胞条件培养基通过分泌ANXA1促进巨噬细胞M2样极化

用PMA分化THP-1细胞为巨噬细胞,分别用新鲜培养基、CA9-NC条件培养基、CA9-KD条件培养基、CA9-KD条件培养基+重组ANXA1处理48 h,检测M2/M1标志物mRNA和分泌细胞因子。

8

FPR1拮抗实验验证ANXA1-FPR1轴

确定FPR1介导CA9-ANXA1轴驱动的巨噬细胞M2样极化

在条件培养基刺激前用选择性FPR1拮抗剂环孢素H(CsH,10 µM)预处理THP-1来源巨噬细胞1 h,检测早期反应基因(1 h)和M2样极化标志物(48 h);在体内对CA9-NC或CA9-KD异种移植瘤小鼠给予CsH(10 mg/kg,腹腔注射,隔日一次)。

9

体内异种移植瘤模型验证CA9和FPR1对肿瘤生长和巨噬细胞表型的影响

在体内验证CA9敲低和FPR1阻断对肿瘤生长和巨噬细胞极化的影响

将CA9-NC或CA9-KD U87-MG细胞皮下注射至BALB/c nude小鼠,监测肿瘤生长,终点检测肿瘤重量,通过小鼠特异性qRT-PCR和免疫荧光检测巨噬细胞标志物。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
高糖DMEMYuanpeiL110KJ
胎牛血清Tianhang11011 − 8611
青霉素-链霉素BeyotimeC0222
RPMI-1640培养基YuanpeiL210KJ
聚凝胺BeyotimeC0351
嘌呤霉素BeyotimeST551
佛波酯BeyotimeS1819
重组人ANXA1Cloud-Clone Corp.RPA511Hu01
环孢素HMedChemExpressHY-100183
TRIzol试剂TiangenDP424
PrimeScript RT预混液TakaraRR036A
TB Green Premix Ex Taq IITakaraRR820A
RIPA裂解液BeyotimeP0013B
BCA蛋白定量试剂盒BeyotimeP0012
CA9抗体Proteintech66243-1-Ig
ANXA1抗体Proteintech21990-1-AP
HIF-1α抗体Proteintech20960-1-AP
β-actin抗体Proteintech66009-1-Ig
HRP标记二抗ProteintechSA00001-2 or SA00001-1
ECL化学发光试剂BeyotimeP0018S
ANXA1 ELISA试剂盒ElabscienceE-EL-H0484c
IL-10 ELISA试剂盒ElabscienceE-EL-H0103c
TGF-β1 ELISA试剂盒ElabscienceE-EL-H0110c
CCK-8试剂BeyotimeC0038
替莫唑胺MedChemExpressMB1160
Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒KeyGenKGA108
细胞周期分析试剂盒BeyotimeC1052
柠檬酸盐缓冲液BeyotimeP0081
山羊血清BeyotimeC0265
CA9抗体Proteintech66243-1-Ig
Nestin抗体Proteintech19483-1-AP
CD163抗体Proteintech16646-1-AP
荧光标记二抗ProteintechSA00013-2 or SA00013-3
DAPIBeyotimeC1005
抗淬灭封片剂BeyotimeP0126
pGL3-Basic载体Promega--
Vazyme定点突变试剂盒VazymeC214-01
Lipofectamine转染试剂BeyotimeC0526
双荧光素酶报告基因检测系统BeyotimeRG027
TMT 6plex标记试剂Thermo Fisher Scientific--
timsTOF Pro质谱仪Bruker--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
临床样本
样本来源:福建医科大学协和医院神经外科,2018-2023年,n = 4对配对原发/复发GBM;纳入标准:IDH野生型GBM(2021 WHO CNS分类),原发标本未接受放化疗,复发标本经MRI和/或组织病理确认;伦理批号:2023kjcx034
阅读提示:Methods中Clinical sample collection小节
细胞培养
U87-MG和U251来源:中国科学院细胞库(上海);培养条件:高糖DMEM + 10% FBS + 1%青霉素-链霉素,37°C,5% CO₂;THP-1培养:RPMI-1640 + 10% FBS;患者来源GSC:无血清DMEM/F12 + B27 + EGF + bFGF,非贴壁成球条件
阅读提示:Methods中Cell culture小节
缺氧处理
缺氧条件:1% O₂, 5% CO₂, 94% N₂,48 h;常氧对照:21% O₂, 5% CO₂;样本收集:缺氧结束后立即收集细胞和条件培养基以最小化复氧伪影
阅读提示:Methods中Hypoxia treatment小节及Fig. 7图注
巨噬细胞极化实验
THP-1分化:100 ng/mL PMA处理24 h,PBS洗三次,新鲜培养基静置24 h;条件培养基:来自CA9-NC或CA9-KD胶质瘤细胞培养48 h,0.22 µm过滤,1:1稀释;重组ANXA1:100 ng/mL;处理时间:48 h
阅读提示:Methods中Conditioned medium preparation and macrophage polarization assay小节及Fig. 10图注
FPR1抑制实验
体外:CsH 10 µM预处理1 h,早期反应基因检测1 h,极化检测48 h;体内:CsH 10 mg/kg腹腔注射隔日一次从第3天开始,分组CA9-NC+vehicle, CA9-NC+CsH, CA9-KD+vehicle, CA9-KD+CsH,每组n = 8
阅读提示:Methods中FPR1 inhibition experiments小节及Fig. 11图注
动物实验
小鼠:4周龄雌性BALB/c nude小鼠(Slaccas, Shanghai),SPF条件;细胞注射:5 × 10⁶细胞/200 µL皮下注射至右侧腹;肿瘤监测:每3天测量,体积V = L × W²/2;终点:第21或23天处死;随机分组
阅读提示:Methods中Animal experiments小节