基质-上皮细胞间通讯的系统分析揭示FGF21-FGFR3轴是角膜伤口愈合的关键驱动因素

Systematic Analysis of Stromal-Epithelial Crosstalk Reveals the FGF21-FGFR3 Axis as a Key Driver of Corneal Wound Healing

作者信息Zhe Zhu, Hongran Zhao, Qingjun Zhou, Shengqian Dou, Weiyun Shi
PMID42734304
发布时间2026-09-01
DOI10.1167/iovs.67.11.25

实验完整度

scRNA-seq分析、Transwell共培养、FGFR3药理/遗传扰动、AAV体内敲低、FGF21滴眼液体内验证及bulk RNA-seq

主要模型

C57BL/6J小鼠角膜上皮缺损模型 人角膜上皮细胞系HCECs 人角膜基质细胞系HTK cells/CSCs 正常与伤口愈合小鼠角膜scRNA-seq数据

重点核对

FGFR3抑制剂dabogratinib(TYRA-300)处理浓度50 nM,预处理6小时,FGF21处理12小时 FGF21处理浓度1 µg/mL,处理时间24小时 Transwell共培养膜孔径0.4 µm,共培养24小时后进行划痕和EdU实验 AAV9-shFgf21角膜基质内注射体积2.5–3 µL,滴度1 × 1012 vg FGF21滴眼液浓度50 µg/mL,每剂5 µL,每日三次

摘要

目的:角膜上皮缺损是一个重要的临床问题,严重威胁视力。然而,其潜在机制在很大程度上仍不清楚。在此,我们使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)并构建了角膜基质细胞(CSCs)与上皮细胞(CEpCs)之间的细胞-细胞通讯网络,以阐明角膜上皮伤口修复的病理机制。方法:对正常和角膜上皮缺损小鼠的角膜组织进行scRNA-seq。进行了全面的生物信息学分析,包括无监督聚类、差异基因表达、功能富集、拟时序和RNA速率分析,以阐明CSC异质性。使用CellChat识别CEpCs和CSCs之间的信号串扰。使用共培养、FGFR3扰动、FGF21操作、功能测定和bulk RNA-seq的机制研究,以剖析CEpCs和CSCs中的FGF21-FGFR3轴。结果:scRNA-seq数据的无偏聚类揭示了八个不同的CSC亚群。细胞-细胞通讯图谱和免疫荧光验证显示,CSCs通过FGF21-FGFR3轴主动与CEpCs相互作用。与FGF21过表达CSCs共培养的CEpCs显示出更大的伤口闭合和EdU摄取。FGF21刺激ERK/AKT磷酸化,促进伤口愈合和增殖,这些效应被dabogratinib或FGFR3敲低减弱,并通过FGFR3重新表达而恢复。功能实验表明,Fgf21敲低显著延迟角膜伤口愈合,而局部施用FGF21滴眼液在体内促进角膜上皮伤口修复。Bulk RNA-seq进一步揭示了涉及细胞外基质重塑、细胞粘附、迁移相关过程和MAPK信号传导的FGF21响应转录程序。结论:我们的研究揭示了由FGF21-FGFR3轴介导的CSCs和CEpCs之间的新型相互作用。外源性FGF21促进CEpCs的伤口愈合,表明一种有前景的新型角膜上皮修复治疗策略。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
角膜基质细胞如何通过细胞间通讯调控角膜上皮伤口愈合,以及其中关键的配体-受体通路是什么。
核心机制
损伤后角膜基质细胞分泌FGF21,通过上皮细胞上的FGFR3受体激活ERK/AKT磷酸化,促进上皮细胞增殖、迁移和屏障修复,从而驱动角膜上皮伤口愈合。
主要证据
scRNA-seq和CellChat分析揭示CSC与CEpC间FGF21-FGFR3通讯增强;Transwell共培养显示FGF21过表达CSCs增强HCEC划痕闭合和EdU摄取;dabogratinib或FGFR3敲低削弱FGF21效应,FGFR3回补恢复;AAV9-shFgf21体内敲低延迟愈合,FGF21滴眼液加速愈合;bulk RNA-seq显示ECM重塑、粘附、迁移和MAPK信号相关转录程序。
研究意义
揭示了CSCs与CEpCs之间由FGF21-FGFR3轴介导的新型旁分泌相互作用,外源性FGF21促进角膜上皮修复,提示其作为角膜上皮修复的新型治疗策略的潜力。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

scRNA-seq与生物信息学分析

表征角膜伤口愈合过程中细胞组成和CSC异质性,推断细胞间通讯。

对正常和角膜上皮缺损小鼠角膜组织进行scRNA-seq,经质控、标准化、降维聚类、细胞注释、差异表达、GO/GSEA富集、hdWGCNA、伪时序和RNA速率分析,使用CellChat推断细胞间通讯。

2

FGF21-FGFR3轴的功能验证(体外)

验证基质来源FGF21是否通过FGFR3促进上皮修复行为,并明确受体依赖性。

构建FGF21过表达CSCs与HCECs非接触共培养,进行划痕和EdU实验;用FGF21处理HCECs,联合FGFR3抑制剂dabogratinib或FGFR3 shRNA敲低及回补,检测划痕闭合、EdU摄取和ERK/AKT磷酸化。

3

FGF21在体内角膜上皮伤口愈合中的作用验证

验证基质FGF21对体内角膜上皮修复的必要性和充分性。

通过角膜基质内注射AAV9-shFgf21敲低基质FGF21,观察角膜上皮缺损愈合;局部施用FGF21滴眼液,通过荧光素钠染色评估缺损面积,免疫荧光检测ZO-1和occludin。

4

FGF21响应转录组分析

解析FGF21处理上皮细胞后的转录程序变化。

对FGF21处理的HCECs进行bulk RNA-seq,DESeq2分析差异基因,GO富集,STRING PPI网络和ChEA_2022转录因子富集。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM-F12培养基Gibco--
胎牛血清Gibco--
青霉素-链霉素Gibco--
FGF21重组蛋白MedChemExpressHY-P72651
dabogratinibMedChemExpressTYRA-300
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
FGF21过表达质粒Genechem--
靶向FGFR3的慢病毒shRNAGenechem--
AAV9-shFgf21Shanghai Genechem Co., Ltd.--
EdU细胞增殖检测试剂盒CellorLabCX002
DAPIAbcamAB104139
抗FGF21抗体Proteintech26272-1-AP
抗FGF10抗体Proteintech29749-1-AP
抗ZO-1抗体Thermo Fisher33–9100
抗occludin抗体Abcamab216327
抗FGFR3抗体Proteintech30202-1-AP
抗磷酸化ERK1/2抗体Proteintech80031-1-RR
抗ERK1/2抗体Proteintech11257-1-AP
抗磷酸化AKT抗体Proteintech28731-1-AP
抗AKT抗体Proteintech10176-2-AP
抗GAPDH抗体Proteintech10494-1-AP
TRIzol试剂Invitrogen--
VAHTS Universal V10 RNA-seq文库构建试剂盒----
Alger Brush II角膜锈环去除器AlgerBR2–5
盐酸丙美卡因滴眼液Alcon--
荧光素钠Jingming--
荧光显微镜LeicaDMi8
Transwell小室Corning--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
scRNA-seq与生物信息学分析
小鼠品系与年龄、质控标准、高变基因数、差异基因阈值、GO显著性阈值、CellChat参数、注释标记基因
阅读提示:Methods中ScRNA-Seq Data Analysis、Differential Expression Analysis、Cell-Cell Communication Analysis小节及Supplementary Fig. S1
FGF21-FGFR3轴体外功能验证
HCEC接种密度、血清饥饿时间、FGF21浓度与处理时间、dabogratinib浓度与预处理时间、Transwell孔径与共培养时间、shRNA MOI、划痕成像时间点、EdU浓度与孵育时间、Western blot抗体货号
阅读提示:Methods中Culture and Treatment、CSCs Transfection and Non-Contact Co-Culture、FGFR3 Inhibition, Knockdown, and Rescue、Scratch Wound-Healing Assay、EdU Proliferation Assay小节及Figure 4J–L、Figure 5C–G图注
体内FGF21功能验证
AAV9-shFgf21注射体积与滴度、FGF21滴眼液浓度与给药频率、角膜刮除直径、观察时间点、荧光素染色与免疫荧光样本量
阅读提示:Methods中Intrastromal Injection of AAV、Corneal Epithelial Wound Healing In Vivo、Treatment With FGF21、Immunofluorescence小节及Figure 6图注
bulk RNA-seq分析
FGF21浓度、生物学重复数、差异基因阈值、测序平台与读长、PPI与转录因子富集数据库
阅读提示:Methods中Bulk RNA-Seq Analysis小节及Figure 7图注