确认M. bovis感染诱导ERS
验证M. bovis感染是否诱导巨噬细胞发生ERS
使用Western blot检测BMDM感染M. bovis后不同时间点Bip和磷酸化IRE1α的表达,以衣霉素(TM)作为阳性对照。
Endoplasmic Reticulum Stress Induces Macrophages to Produce IL-1β During Mycobacterium bovis Infection via a Positive Feedback Loop Between Mitochondrial Damage and Inflammasome Activation.
包含体外细胞实验(BMDM感染、siRNA敲低、抑制剂处理)和体内动物实验(小鼠感染模型),并通过Western blot、ELISA、qPCR、TEM等多层级验证功能与机制。
骨髓来源巨噬细胞(BMDM) C57BL/6小鼠感染模型
M. bovis感染BMDM的MOI为10,感染时间点0、6、24、48小时 ERS抑制剂4-PBA浓度5 mM(体外)、18.6 mg/mouse/day(体内) NLRP3、AIM2、Bid的siRNA敲低(50 nM) caspase-8抑制剂z-IETD-fmk(50 μM)和caspase-1抑制剂belnacasan(20 μM) 线粒体损伤指标:mtDNA释放和胞浆细胞色素c水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证M. bovis感染是否诱导巨噬细胞发生ERS
使用Western blot检测BMDM感染M. bovis后不同时间点Bip和磷酸化IRE1α的表达,以衣霉素(TM)作为阳性对照。
检测抑制ERS是否影响M. bovis感染诱导的IL-1β产生
使用ERS抑制剂4-PBA预处理BMDM,然后感染M. bovis,通过Western blot和ELISA检测上清中IL-1β水平,同时检测TNF-α和IL-6。
确定M. bovis感染诱导的ERS是否导致线粒体损伤,以及线粒体损伤是否参与炎症小体激活
通过透射电镜观察线粒体超微结构,检测ROS产生、mtDNA释放和胞浆细胞色素c水平;使用MPTP抑制剂CsA预处理,检测IL-1β产生。
确定NLRP3和AIM2是否介导线粒体损伤
检测NLRP3和AIM2在线粒体部分的招募;使用siRNA敲低NLRP3或AIM2,检测mtDNA和细胞色素c释放。
验证caspase-8是否参与NLRP3介导的线粒体损伤
检测M. bovis感染后caspase-8的切割和线粒体招募;使用caspase-8抑制剂z-IETD-fmk,检测mtDNA和细胞色素c释放。
确定Bid是否作为NLRP3和caspase-8下游效应分子导致线粒体损伤
检测M. bovis感染后Bid的截短(tBid)水平;使用siRNA敲低Bid或抑制剂(z-IETD-fmk、belnacasan)处理,检测mtDNA和细胞色素c释放。
评估ERS在体内对M. bovis感染诱导的炎症小体激活和疾病进展的影响
C57BL/6小鼠感染M. bovis,给予4-PBA处理,检测血清和肺组织IL-1β、TNF-α水平,以及肺组织病理损伤和细菌载量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | Hyclone | -- |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Pepro Tech | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细菌培养 | 7H9培养基 | BD Biosciences | -- |
| 7H11琼脂 | BD Biosciences | -- | |
| ADC富集液 | -- | -- | |
| 吐温80 | Difco | -- | |
| ERS抑制 | 4-苯基丁酸 | Cayman Chemical | 11323 |
| ERS诱导 | 衣霉素 | Fermentek Ltd | -- |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Solarbio | L8880 |
| 三磷酸腺苷 | Solarbio | IA0590 | |
| 依托泊苷 | Solarbio | IE0270 | |
| ROS清除 | N-乙酰-L-半胱氨酸 | Beyotime Biotechnology | S0077 |
| 线粒体靶向抗氧化 | MitoTEMPOL | Abcam | ab144644 |
| caspase-1抑制 | 贝那卡桑 | Selleckchem | S2228 |
| caspase-8抑制 | z-IETD-fmk | Selleckchem | S7314 |
| 线粒体通透性转换孔抑制 | 环孢素A | Beyotime Biotechnology | S1563 |
| Western blot | 抗BiP抗体 | Abcam | ab108615 |
| 抗磷酸化IRE1抗体 | Abcam | ab48187 | |
| 抗tBid抗体 | Abcam | ab10640 | |
| 抗全长caspase-8抗体 | Abcam | ab108333 | |
| 抗细胞色素c抗体 | Proteintech | 10993-1-AP | |
| 抗TOM20抗体 | Proteintech | 11802-1-AP | |
| 抗AIM2抗体 | Proteintech | 20590-1-AP | |
| 抗切割caspase-8抗体 | Proteintech | 13423-1-AP | |
| 抗Bid抗体 | Proteintech | 10988-1-AP | |
| 抗VDAC抗体 | Proteintech | 66345-1-lg | |
| 抗NLRP3抗体 | Cell Signaling Technology | 15101 | |
| 抗切割IL-1β抗体 | Cell Signaling Technology | 63124 | |
| 抗IL-1β抗体 | R&D Systems | AF-401-NA | |
| 山羊抗兔二抗 | Beijing ZSGB Biotechnology | ZB-5301 | |
| 兔抗山羊二抗 | Beijing ZSGB Biotechnology | ZB-2306 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Solarbio | RG000120 | |
| siRNA转染 | HiPerFect转染试剂 | Qiagen | -- |
| 线粒体分离 | 细胞线粒体分离试剂盒 | Beyotime | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| cDNA合成 | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| mtDNA提取 | 基因组DNA小提试剂盒 | Beyotime | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green预混液 | Bio-Rad | -- |
| ViiA7快速实时荧光定量PCR仪 | ABI | -- | |
| Western blot | Immobilon-P转印膜 | Millipore | -- |
| 快速蛋白沉淀浓缩试剂盒 | Boster Biotech | -- | |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | Cusabio | -- |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- | |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 细胞活力检测 | CellTiter 96 AQueous One Solution细胞增殖检测试剂盒 | Promega | -- |
| 组织裂解 | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物感染模型 | 小鼠品系、周龄、性别、感染剂量、感染途径、4-PBA剂量及处理时间 阅读提示:见Materials and Methods - Animal Infection Model |
| 细胞培养 | BMDM制备方法、细胞数量、培养时间、M-CSF浓度、培养条件 阅读提示:见Materials and Methods - Cell Culture |
| 细菌感染 | MOI、感染时间、洗脱步骤、时间点选择 阅读提示:见Materials and Methods - Bacterial Culture and Infection |
| 抑制剂处理 | 抑制剂浓度、预处理时间、溶剂对照 阅读提示:见Materials and Methods - Bacterial Culture and Infection 中抑制剂预处理部分 |
| siRNA转染 | siRNA序列、浓度、转染试剂、转染时间 阅读提示:见Materials and Methods - Small Interfering RNA (siRNA) Transfection 和 Table 1 |