验证基质细胞分泌IL-8及对PCa细胞放射抗性的影响
确定基质细胞是否通过IL-8影响PCa细胞的放射敏感性。
用RT-qPCR、免疫印迹和ELISA检测PCa细胞系与基质细胞系中IL-8表达;将PCa细胞与基质细胞条件培养基共培养,或使用IL-8中和抗体和EV抑制剂GW4869,检测照射后细胞活力和集落形成。
Stromal cell-derived small extracellular vesicles enhance radioresistance of prostate cancer cells via interleukin-8-induced autophagy.
体外细胞模型(LNCaP、22Rv1等)验证功能与机制,斑马鱼和小鼠异种移植模型进行体内验证,并包含临床样本分离CAFs及组学数据生信分析。
LNCaP人前列腺癌细胞系 22Rv1人前列腺癌细胞系 WPMY-1人前列腺基质肌成纤维细胞系 CAFs原代细胞(从前列腺癌组织分离) 斑马鱼异种移植模型 裸鼠异种移植模型
sEVs来源:WPMY-1细胞、CAFs、LNCaP、22Rv1 IL-8沉默:WPMY-1细胞中shRNA靶向CXCL8序列GCTCTGTGTGAAGGTGCAGTT CXCR2抑制:AZD-5069处理或shRNA沉默CXCR2 AMPK抑制:BAY-3827处理或shRNA沉默AMPKα 自噬抑制:氯喹(CQ)10μM预处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定基质细胞是否通过IL-8影响PCa细胞的放射敏感性。
用RT-qPCR、免疫印迹和ELISA检测PCa细胞系与基质细胞系中IL-8表达;将PCa细胞与基质细胞条件培养基共培养,或使用IL-8中和抗体和EV抑制剂GW4869,检测照射后细胞活力和集落形成。
确认基质细胞来源的sEVs中确实包裹IL-8并能被PCa细胞摄取。
超速离心和超滤法分离sEVs,用TEM、免疫印迹、蛋白酶保护实验和ELISA表征;用PKH26标记sEVs与PCa细胞共培养,通过免疫荧光检测IL-8内化。
确定sEVs携带的IL-8是否为增强PCa细胞放射抗性的关键因子。
PCa细胞与不同剂量sEVs共培养后照射,用CCK-8和集落形成实验评估细胞存活;使用IL-8沉默的基质细胞来源sEVs、CXCR2抑制剂或重组IL-8处理,观察放射抗性变化。
探究sEV-IL-8增强放射抗性的分子机制是否依赖于AMPK激活的自噬。
检测sEV-IR处理后PCa细胞中ATP水平和自噬标志物;免疫印迹分析磷酸化AMPKα、LC3、Lamp2;用AMPK抑制剂或shRNA沉默AMPKα,评估对自噬和放射抗性的影响。
在体内模型中验证基质sEVs通过递送IL-8增强PCa肿瘤放射抗性的作用。
建立斑马鱼和裸鼠异种移植模型,将sEV预处理的22Rv1细胞植入,照射后监测肿瘤生长;免疫印迹和免疫组化检测肿瘤组织中IL-8、p-AMPKα、LC3、Lamp2及Ki67、caspase3表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | Gibco | -- | |
| 链霉素 | Gibco | -- | |
| CAF分离 | IV型胶原酶 | BioFroxx | 2091 |
| 分散酶II | Roche | 04942078001 | |
| 抗成纤维细胞微珠 | Miltenyi Biotec | 130-050-601 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine试剂 | Invitrogen | -- |
| 靶向CXCL8的shRNA质粒 | Merck | -- | |
| 靶向AMPKα的shRNA表达质粒 | Merck | -- | |
| 靶向CXCR2的shRNA表达质粒 | Merck | -- | |
| 靶向ATG5的shRNA表达质粒 | Tsingke | -- | |
| 靶向ATG7的shRNA表达质粒 | Tsingke | -- | |
| pCMV3-SV40-neo载体 | Corues | a2302024822 | |
| sEV分离 | 超速离心机 | Beckman | -- |
| Amicon Ultra-0.5超滤管,截留分子量100 kDa | Millipore | UFC510024 | |
| Amicon Ultra-15超滤管,截留分子量30 kDa | Millipore | UFC903008 | |
| Amicon Ultra-0.5超滤管,截留分子量3 kDa | Millipore | UFC500396 | |
| sEV表征 | 磷钨酸 | -- | -- |
| 明胶 | -- | -- | |
| 蔗糖 | -- | -- | |
| IL-8一抗 | Abcam | ab7747 | |
| 山羊抗兔IgG(10nm金)二抗 | Abcam | ab6712 | |
| CD63抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365604 | |
| Tsg101抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7964 | |
| 钙联蛋白抗体 | CST | 2433 | |
| 细胞因子芯片 | Bio-Plex人细胞因子筛选试剂盒 | Bio-Rad | 12007283 |
| 蛋白酶保护实验 | 蛋白酶K | Biosharp | BS080 |
| Triton X-100 | Biofroxx | -- | |
| RIPA裂解液 | Beyotime | -- | |
| 共定位实验 | PKH26 | Sigma | PKH26GL |
| IL-8抗体 | -- | -- | |
| CD63抗体 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 胞浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | 0028 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G磁珠免疫共沉淀试剂盒 | ACE | AM001-01 |
| 抗Flag磁珠 | Beyotime | P2115 | |
| 抗IgG磁珠 | Beyotime | P2171 | |
| 流式分析 | APC偶联抗Flag抗体 | Biolegend | 637307 |
| 免疫荧光 | Flag抗体 | Proteintech | 66008-4-Ig |
| CXCR2抗体 | Proteintech | 20634-1-AP | |
| 红色荧光二抗 | Proteintech | SA00013-4 | |
| 绿色荧光二抗 | Proteintech | SA00013-1 | |
| 药物处理 | GW4869 | MCE | HY-19363 |
| 抗IL-8抗体(HuMax-IL-8) | Chemstan | CSD00668 | |
| AZD-5069 | MCE | HY-19855 | |
| 重组人IL-8 | Novus Biologicals | 208-IL-010 | |
| BAY-3827 | MCE | HY-112083 | |
| 氯喹 | MCE | HY-17589A | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | APExBIO | K1018 |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| 自噬检测 | LC3抗体 | Proteintech | 14600-1-AP |
| Lamp2抗体 | Proteintech | 66301-1-Ig | |
| 慢病毒LC3-GFP-RFP | Genomeditech | GM-1314L204H | |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 溶酶体检测 | 酸性磷酸酶试剂盒 | Beyotime | P0326 |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| PrimeScript RT试剂盒 | Takara | RR037Q | |
| Taq Pro通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q712-02 | |
| 免疫印迹 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| LC3抗体 | Proteintech | -- | |
| Lamp2抗体 | Proteintech | -- | |
| β-actin抗体 | Proteintech | -- | |
| AMPKα抗体 | Millipore | 07-350 | |
| 磷酸化AMPKα抗体 | CST | 50081 | |
| mTOR抗体 | CST | 2972 | |
| 磷酸化mTOR抗体 | CST | 2971 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2357 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | CST | 7076 | |
| ELISA | 人IL-8细胞因子试剂盒 | Xinbosheng | EHC008.96 |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0027 |
| 体内实验(斑马鱼) | CM-Dil | UE | -- |
| 免疫组织化学 | Ki-67抗体 | Proteintech | 27309-1-AP |
| Caspase3抗体 | CST | 9662 | |
| DAB显色试剂盒 | Cell signalling Tech | -- | |
| 组织成像 | 数字病理系统(Pannoramic MIDI) | 3DHISTECH | -- |
| 辐照 | X射线机(Rad Source RS2000 X-ray) | Rad Source | -- |
| 显微镜 | 透射电子显微镜(JEOL) | JEOL | -- |
| FEI Tecnai Spirit透射电子显微镜 | FEI | -- | |
| 共聚焦显微镜(LSM800) | Carl Zeiss Jena | -- | |
| 流式分析 | FACSCalibur流式细胞仪 | BD Sciences | -- |
| NTA分析 | ZetaView纳米颗粒跟踪分析仪 | Particle Metrix | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(ATCC),培养基(PCa用RPMI 1640,WPMY-1/RWPE-1用DMEM),血清浓度(10% FBS),青霉素/链霉素浓度(100 U/mL / 100 μg/mL),培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods 2.1 |
| sEV分离与纯化 | 超速离心转速和时间(100,000 × g,1h),0.22 μm滤膜过滤,超滤管MWCO 100 kDa和30 kDa的使用,FBS去EV处理(110,000 × g,18h) 阅读提示:Materials and Methods 2.4 |
| 细胞处理与照射 | sEV共培养浓度(3.8×10^10 particles/mL)和时间(24h),照射剂量(2 Gy),照射设备(Rad Source RS2000 X-ray) 阅读提示:Materials and Methods 2.10, Figure legends 3.1-3.3 |
| 药物处理 | GW4869浓度(10 μM)和时间(48h),AZD-5069浓度,BAY-3827浓度,CQ浓度(10 μM)和处理时间(1h预处理) 阅读提示:Materials and Methods 2.10, 2.12 |
| 基因沉默 | shRNA靶序列(CXCL8, AMPKα, CXCR2, ATG5, ATG7),转染试剂(Lipofectamine),筛选抗生素(嘌呤霉素、新霉素) 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |