小鼠 ALI 模型建立与 EV 表征
建立 LPS 诱导的 ALI 小鼠模型,并分析 BALF 中 EVs 的亚群和表面蛋白特征。
C57BL/6 小鼠气管内注射 LPS(5 mg/kg)诱导 ALI。收集 BALF,通过 PBA 技术进行单 EV 分析,鉴定出 15 个 EV 亚群,其中 CD31+ EVs(内皮来源)在 ALI 小鼠中比例升高。
Endothelium-Treg Communication Through Extracellular Vesicle Transfer Exacerbates Acute Respiratory Distress Syndrome.
包含体外细胞实验、动物模型、基因敲除小鼠、骨髓嵌合模型、患者样本验证,以及机制研究(ChIP-qPCR、双荧光素酶等),功能验证和机制验证明确。
小鼠 LPS 诱导 ALI 模型 小鼠肺微血管内皮细胞系 小鼠脾脏来源的初始 CD4+ T 细胞分化的 Tregs ARDS 患者 BALF 样本
LPS 气管内注射诱导 ALI 模型,剂量:5 mg/kg(生存研究为 25 mg/kg) Treg 极化条件:抗 CD3 2 µg/mL、抗 CD28 1 µg/mL、Treg 分化补充物等,培养 5 天 EV 处理浓度:10 µg EC-EVs 或 LPS-EC-EVs/mL 培养基 EV 分离方法:超速离心 200,000 × g 2 小时 患者样本:ARDS 患者 9 例,对照 5 例
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立 LPS 诱导的 ALI 小鼠模型,并分析 BALF 中 EVs 的亚群和表面蛋白特征。
C57BL/6 小鼠气管内注射 LPS(5 mg/kg)诱导 ALI。收集 BALF,通过 PBA 技术进行单 EV 分析,鉴定出 15 个 EV 亚群,其中 CD31+ EVs(内皮来源)在 ALI 小鼠中比例升高。
检测活化肺内皮细胞来源的 EVs(LPS-EC-EVs)对初始 CD4+ T 细胞向 Treg 分化的影响。
从小鼠脾脏分离初始 CD4+ T 细胞,在抗 CD3/抗 CD28 和 Treg 极化条件下培养,同时加入 EC-EVs 或 LPS-EC-EVs(10 µg/mL),培养 5 天,通过流式细胞术检测 Foxp3+ 细胞比例。
评估 LPS-EC-EVs 是否影响 Tregs 的稳定性。
将 Foxp3YFP/Cre 与 Rosa26-LSL-tdTomato 小鼠杂交,分离脾脏初始 CD4+ T 细胞进行 Treg 极化,检测 YFP+tdTomato+ 细胞(稳定 Treg)和 YFP−tdTomato+ 细胞(exTreg)比例。
探索 LPS-EC-EVs 抑制 Treg 分化的分子机制。
对 EC-EVs 和 LPS-EC-EVs 处理的 Tregs 进行 mRNA 测序,发现 IL-21 显著上调;通过 RT-qPCR、ELISA、流式细胞术和免疫印迹验证 IL-21/STAT3 信号通路激活。
验证阻断 IL-21 信号通路能否逆转 LPS-EC-EVs 诱导的 Treg 抑制。
在 Treg 极化体系中加入抗 IL-21 抗体、抗 IL-21R 抗体或 STAT3 抑制剂 Stattic,检测 Treg 比例的变化。
确证 IL-21 在 T 细胞内在信号中的作用。
将 WT 或 Il21−/− 小鼠的骨髓细胞移植到经辐照的 Tcrα−/− 小鼠中,重建免疫系统后,经 LPS-EC-EVs 预处理并诱导 ALI,检测 Treg 比例和肺损伤程度。
鉴定 LPS-EC-EVs 中负责抑制 Treg 的关键蛋白。
通过蛋白质组学比较 EC-EVs 和 LPS-EC-EVs 的蛋白组成,结合转录因子预测数据库筛选出 Med1;通过免疫印迹和免疫电镜验证 Med1 在 LPS-EC-EVs 中富集。
证明 EV 中的 Med1 能进入 Treg 细胞核并结合 IL-21 启动子。
用 Flag 标记的 Med1 过表达内皮细胞来源的 EVs 处理 Tregs,通过细胞亚组分分离和免疫印迹确认 Med1 入核;通过 Flag-ChIP-qPCR 检测 Med1 与 IL-21 启动子的结合;双荧光素酶实验验证转录激活功能。
验证 Med1 在 LPS-EC-EVs 中的致病功能。
通过 shRNA 敲低 MPMECs 中的 Med1 表达,收集 EVs 进行体外 Treg 极化实验;通过 AAV-shMed1 靶向肺内皮敲低 Med1,在 LPS 诱导的 ALI 模型中检测 Treg 比例、肺损伤和生存率。
验证 Med1 在 ARDS 患者 BALF-EVs 中的表达及其临床相关性。
收集 ARDS 患者和对照(非 ARDS)患者的 BALF,超速离心分离 EVs,通过 capture beads FCM 检测 CD31+ EVs 比例,免疫印迹检测 Med1 表达,ELISA 检测 IL-21 浓度,并进行相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ALI 模型诱导 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L2637 |
| EV 分离 | 超速离心机 | Beckman Coulter | A99846 |
| EV 表面蛋白检测 | EV 捕获磁珠 | WAKO | 297-79701 |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | BD Bioscience | -- |
| 细胞培养 | DMEM-F12 培养基 | Gibco | C11330500BT |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F8318 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 1514012 | |
| 嘌呤霉素 | Beyotime | ST551 | |
| Treg 极化 | RPMI-1640 培养基 | STEMCELL | 36750 |
| Treg 分化补充物 | STEMCELL | 10957 | |
| 谷氨酰胺补充剂 | Gibco | 35050061 | |
| 抗小鼠 CD3 抗体 | Biogems | 05112-25 | |
| 抗小鼠 CD28 抗体 | Biogems | 05112-25 | |
| EV 蛋白消化 | 蛋白酶 K | Invitrogen | 25530049 |
| EV 透化 | Triton X-100 | Beyotime | -- |
| 蛋白质定量 | BCA 蛋白定量试剂盒 | KeyGEN | KGB2101 |
| Western blot | 考马斯亮蓝溶液 | Beyotime | P0003S |
| 丽春红 S 溶液 | Beyotime | P0022 | |
| 快速封闭液 | Servicebio | G2052 | |
| 一抗 | 多种 | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗兔二抗 | CST | 7074 | |
| Treg 增殖检测 | CFSE 染料 | KeyGEN | KGA9503 |
| 凋亡检测 | 膜联蛋白 V-PI 试剂盒 | Beyotime | C1062S |
| ELISA | TGF-β1 ELISA 试剂盒 | R&D | DB100C |
| KGF ELISA 试剂盒 | ELK Biotech | ELK3081 | |
| IFN-γ ELISA 试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0048 | |
| IL-4 ELISA 试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0043 | |
| IL-17A ELISA 试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0047 | |
| IL-21 ELISA 试剂盒 | BOSTER | EK0797 | |
| RT-qPCR | SPARKeasy 总 RNA 提取试剂盒 | SparkJade | ACS201 |
| HiScript III 逆转录预混液 | Vazyme | R323 | |
| ChamQ SYBR qPCR 预混液 | Vazyme | Q341-02 | |
| mRNA 测序 | 总 RNA 纯化试剂盒 | LC Science | -- |
| TruSeq 链特异性 mRNA 文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| Illumina HiSeq X Ten 测序平台 | Illumina | -- | |
| 核质蛋白提取 | 核质蛋白提取试剂盒 | Abbkine | KTP3001 |
| Western blot 上样 | 上样缓冲液 | Invitrogen | NP0007 |
| ChIP | ChIP 试剂盒 | Active Motif | 53035 |
| 双荧光素酶报告基因 | DNA/RNA 转染试剂 | Zeta-life | AD600100 |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E2940 | |
| 免疫荧光封片 | 含 DAPI 的封片剂 | Sigma-Aldrich | F6057 |
| 细胞培养 | ImmunoCult-XF T 细胞扩增培养基 | STEMCELL | 10981 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ALI 模型建立 | 小鼠品系:雄性 C57BL/6 6-8 周龄;LPS 剂量:5 mg/kg(生存研究 25 mg/kg);给药方式:气管内注射;麻醉:戊巴比妥钠 40 mg/kg;BALF 采集时间:24 小时 阅读提示:Methods 2.1 Animals |
| EV 分离与表征 | 超速离心条件:200,000 × g 2 小时;细胞培养上清;EV-depleted FBS;LPS 刺激浓度:1 µg/mL 培养 24 小时 阅读提示:Methods 2.5 Cell Culture and EV Isolation |
| Treg 极化 | 初始 CD4+ T 细胞分离方法(STEMCELL 试剂盒);培养条件:抗 CD3 2 µg/mL 包被、抗 CD28 1 µg/mL、Treg 分化补充物、10 µg/mL EC-EVs 或 LPS-EC-EVs;培养时间:5 天;在第 2 天更换半量培养基 阅读提示:Methods 2.8 Treg Polarization In Vitro |
| IL-21 信号通路干预 | IL-21 NmAb、IL-21R NmAb、Stattic 的剂量梯度;Treg 极化过程中加入抑制剂 阅读提示:Results 3.5 和 Figure 4 legends |
| 骨髓嵌合模型 | 受体鼠:Tcrα−/−小鼠,5 Gy 照射;供体骨髓细胞:WT 或 Il21−/−小鼠,约 10^7 细胞/只;恢复期:8 周;LPS-EC-EVs 预处理:两次,每次 100 µg;ALI 诱导:LPS IT 阅读提示:Methods 2.1 Animals 和 Results 3.5 |
| Med1 敲低实验 | 体外:shMed1 慢病毒感染 MPMECs;体内:AAV-shMed1-LungX 或 shNC-AAV-LungX 5×10^11 vg/只静脉注射,4 周后 LPS 诱导 ALI 阅读提示:Methods 2.1 Animals 和 Results 3.7 |
| 患者样本 | ARDS 患者:符合柏林标准,入 ICU 后 72 小时内,机械通气;对照组:无肺部疾病的术后机械通气患者;BALF 采集:机械通气 24 小时内;EV 分离:超速离心 200,000 × g 2 小时 阅读提示:Methods 2.23 Patient Enrolment 和 2.24 Human Samples |