构建TET2/RHOA双突变细胞模型
建立携带TET2和RHOA双突变(TET2MUT/RHOAMUT)的T淋巴瘤细胞系,用于药物筛选和机制研究。
通过慢病毒转染将TET2H1380Y和RHOA G17V突变体导入Jurkat、H9、Karpas-299和DL-40细胞,经流式分选获得双阳性细胞。
XPO1 inhibitor selinexor enhances the apoptotic effect of azacitidine in T-cell lymphoma with TET2/RHOA mutations via JAK3/STAT3 axis.
包含体外细胞系、斑马鱼异种移植、CDX小鼠模型和患者样本等多个独立证据层级,并进行了功能验证(凋亡、增殖)和机制验证(JAK3/STAT3通路)。
TET2/RHOA双突变Jurkat细胞 TET2/RHOA双突变H9细胞 TET2/RHOA双突变Karpas-299细胞 TET2/RHOA双突变DL-40细胞
TET2和RHOA双突变状态(TET2MUT/RHOAMUT)是协同敏感性的关键决定因素 组合处理浓度(阿扎胞苷和selinexor的剂量范围) 处理时间(24小时、48小时等) CDX模型中给药剂量和方案:阿扎胞苷8 mg/kg腹腔注射每周一次,selinexor 10 mg/kg口服灌胃每周两次,持续3周 临床病例中患者携带TET2/RHOA突变并接受联合治疗
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立携带TET2和RHOA双突变(TET2MUT/RHOAMUT)的T淋巴瘤细胞系,用于药物筛选和机制研究。
通过慢病毒转染将TET2H1380Y和RHOA G17V突变体导入Jurkat、H9、Karpas-299和DL-40细胞,经流式分选获得双阳性细胞。
从633种抗肿瘤化合物中筛选出与阿扎胞苷联用具有协同杀伤TET2/RHOA突变细胞作用的候选药物。
将TET2MUT/RHOAMUT Jurkat细胞与1 μmol/L阿扎胞苷及40 nmol/L化合物共处理24小时,使用Celltiter Glo检测细胞活力,选出细胞死亡率增加最显著的前15种化合物,再从中选出5种进行协同验证。
验证selinexor与阿扎胞苷在TET2/RHOA突变细胞中的协同杀伤效果。
在TET2MUT/RHOAMUT Jurkat、H9、Karpas-299和DL-40细胞中,使用CCK-8法测定不同浓度组合下的细胞活力,并利用ZIP模型计算协同分数(δ)。
评估selinexor与阿扎胞啶单药及联合处理对TET2/RHOA突变细胞凋亡的影响,并验证凋亡途径。
流式细胞术检测Annexin V/7-AAD染色;电子显微镜观察凋亡小体;Western blot检测凋亡相关蛋白(caspase-3、caspase-8、caspase-9、PARP、细胞色素c);使用caspase抑制剂(Z-VAD-FMK、Z-IETD-FMK、Z-LEHD-FMK)进行功能验证。
探究联合处理对TET2/RHOA突变细胞基因表达的影响,并识别相关信号通路。
对DMSO、selinexor、阿扎胞苷及联合处理24小时的TET2MUT/RHOAMUT Jurkat细胞进行RNA-seq,鉴定差异表达基因(DEGs),进行基因集富集分析(GSEA),并利用RT-qPCR验证关键基因表达。
验证联合处理对JAK3/STAT3信号通路的抑制作用及其机制。
Western blot检测p-JAK3、JAK3、p-STAT3、STAT3、SOCS1蛋白表达;分离核浆蛋白检测STAT3亚细胞定位;免疫荧光观察STAT3在细胞内的分布。
在CDX小鼠模型中验证selinexor与阿扎胞苷联合治疗的抗肿瘤效果。
建立Jurkat和Karpas-299皮下异种移植模型,随机分组给予vehicle、阿扎胞苷(8 mg/kg,腹腔注射,每周一次)、selinexor(10 mg/kg,口服灌胃,每周两次)或联合治疗,为期3周,测量肿瘤体积和重量,并通过HE和IHC染色评估肿瘤组织学变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 化合物筛选 | Celltiter Glo细胞活力测定试剂盒 | Promega | -- |
| 细胞活力测定 | CCK-8试剂盒 | MedChemExpress | -- |
| 流式细胞术 | 凋亡检测APC/7-AAD试剂盒 | Elabscience | -- |
| BD™ LSR II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 蛋白质提取 | Pierce IP裂解液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 核浆提取试剂盒 | Pierce Biotechnology | -- | |
| 凋亡抑制 | Z-VAD-FMK | Selleck | S7023 |
| Z-IETD-FMK | Selleck | S7314 | |
| Z-LEHD-FMK | Selleck | S7313 | |
| 蛋白质印迹 | Caspase-8抗体 | Selleck | F0067 |
| Cleaved Caspase-8抗体 | Cell Signaling Technology | #9429 | |
| Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | #9662 | |
| Cleaved Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | #9664 | |
| Caspase-9抗体 | Proteintech | 10380-1-AP | |
| Cleaved Caspase-9抗体 | Selleck | F0326 | |
| 细胞色素C抗体 | Proteintech | 10993-1-AP | |
| PARP抗体 | Proteintech | 66520-1-Ig | |
| p-JAK3抗体 | Cell Signaling Technology | #5031 | |
| JAK3抗体 | Cell Signaling Technology | #8827 | |
| p-STAT3 (Tyr705)抗体 | AiFang Biological | AF00753 | |
| STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | #12640 | |
| SOCS1抗体 | AiFang Biological | AF03521 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | #2118 | |
| Histone H3抗体 | Cell Signaling Technology | #9715 | |
| HRP标记的抗鼠IgG | Cell Signaling Technology | #7076 | |
| HRP标记的抗兔IgG | Cell Signaling Technology | #7074 | |
| RNA-seq | KAPA RNA HyperPrep试剂盒(含RiboErase) | KAPA Biosystems | -- |
| RT-qPCR | FastPure® 细胞/组织总RNA提取试剂盒V2 | Vazyme | -- |
| HiScript III qRT SuperMix | Vazyme | -- | |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG H&L (Alexa Fluor® 647) | Abcam | ab150079 |
| DAPI | -- | -- | |
| 免疫组织化学 | Dako EnVision HRP偶联二抗 | Dako | K5007 |
| 动物实验 | NCG小鼠 | GemPharmatech | T001475 |
| 斑马鱼异种移植 | DiI染料 | Molecular Probes, Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系构建 | TET2和RHOA突变体构建(TET2H1380Y和RHOA G17V),慢病毒转染细胞系(Jurkat、H9、Karpas-299、DL-40),polybrene浓度(8 μg/ml),转染时间(72小时) 阅读提示:Methods:Cell culture and transfection |
| 药物处理 | 阿扎胞苷和selinexor的浓度范围、处理时间(24小时或48小时) 阅读提示:Methods:Cell growth inhibition assays and drug combination analysis;Results:Figure 2F-I |
| 体内药效 | CDX模型中细胞接种量(Jurkat 1×10^7,Karpas-299 5×10^6)、小鼠品系(NCG雌性,4周龄)、给药剂量和频率(阿扎胞苷8 mg/kg腹腔注射每周一次,selinexor 10 mg/kg口服灌胃每周两次)、治疗周期(3周)、每组小鼠数(4只) 阅读提示:Methods:Cell line-derived mouse xenografts;Figure 5 |
| 机制验证 | 处理时间(24小时),Western blot检测p-JAK3、p-STAT3、SOCS1、STAT3等蛋白表达,核浆分离方法 阅读提示:Methods:Protein lysate and western blot;Results:Figure 4E-H |