临床样本中Menin表达分析
评估RIF患者与对照组子宫内膜中Menin的表达差异。
通过IHC、WB和qRT-PCR检测RIF患者和对照子宫内膜样本中Menin的表达,并分析其定位。
Endometrial stromal Menin supports endometrial receptivity by maintaining homeostasis of WNT signaling pathway through H3K4me3 during WOI.
包含患者样本、原代细胞、类器官/assembloid、小鼠模型和RNA-seq等多层次证据,并有功能验证及机制验证。
原代人子宫内膜基质细胞(hESCs) 子宫内膜上皮类器官与基质细胞共培养的assembloid模型 小鼠自然蜕膜化模型 小鼠油诱导人工蜕膜化模型
RIF患者与对照子宫内膜样本中Menin表达差异(n=6) shMEN1敲低效率及蜕膜化标志物PRL和IGFBP1的表达变化 LiCl处理剂量(60 mg/kg)及给药时间(D5-D7) ChIP-qPCR验证H3K4me3在SFRP2和DKK1启动子上的富集 IWR-1对WNT信号通路的抑制效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估RIF患者与对照组子宫内膜中Menin的表达差异。
通过IHC、WB和qRT-PCR检测RIF患者和对照子宫内膜样本中Menin的表达,并分析其定位。
确定MEN1缺失是否影响人子宫内膜基质细胞的蜕膜化过程。
使用慢病毒介导的shRNA敲低原代hESCs中MEN1,诱导蜕膜化后检测蜕膜化标志物PRL和IGFBP1的表达、细胞形态和增殖。
揭示MEN1敲低后hESCs中基因表达变化及相关通路。
对shMEN1和shCtrl hESCs进行RNA-seq,分析差异表达基因并进行GO、GSEA和KEGG通路富集分析。
确认MEN1敲低是否导致WNT/β-catenin信号通路的过度激活。
通过IF和WB检测β-catenin的核积聚,通过荧光素酶报告基因检测TCF/LEF转录活性。
评估WNT信号通路过度激活对小鼠蜕膜化过程的影响。
在自然蜕膜化模型和油诱导人工蜕膜化模型中,用LiCl处理小鼠以激活WNT通路,观察蜕膜反应和着床部位变化。
阐明Menin调控WNT信号通路的具体分子机制。
检测MEN1敲低和过表达时H3K4me3水平及SFRP2、DKK1的表达,并通过ChIP-qPCR分析H3K4me3在SFRP2和DKK1启动子上的富集;使用IWR-1抑制WNT通路观察对蜕膜化的恢复作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | I型胶原酶 | Thermo Scientific | 17100017 |
| DMEM/F12培养基 | Meilunbio | PWL005 | |
| 活性炭剥离胎牛血清 | easyall | CMS003.02 | |
| 抗生素 | Biosharp | BL505A | |
| 雌激素 | Sigma-Aldrich | E2758 | |
| 醋酸甲羟孕酮 | MedChemExpress | HY-B0648 | |
| 8-溴环磷酸腺苷 | MedChemExpress | HY-12306 | |
| 无酚红DMEM/F12 | Meilunbio | MA0214 | |
| 嘌呤霉素 | Meilunbio | MA0318 | |
| 免疫组织化学 | Tris-EDTA溶液 | Abcam | ab93684 |
| 牛血清白蛋白 | Meilunbio | MB0004 | |
| 过氧化氢 | Beyotime | P0100A | |
| 二抗 | Gene Tech | GK500710 | |
| DAB显色试剂 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Sigma-Aldrich | HFH10 |
| Hoechst 33342 | Invitrogen | H3570 | |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Zeiss | LSM800 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0020 |
| 蛋白酶抑制剂 | Solarbio | P1260 | |
| 核浆分离试剂盒 | Thermo Scientific | 78833 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | 23225 | |
| 5×上样缓冲液 | Solarbio | P1040 | |
| SDS-PAGE凝胶 | Epizyme | PG113 | |
| PVDF膜 | Merck | IPVH00010 | |
| HRP标记二抗 | Jackson ImmunoResearch | 111-035-003 | |
| 增强化学发光试剂 | Millipore | WBKLS0500 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Scientific | 15596018CN |
| RNA快速纯化试剂盒 | ES Science | RN001 | |
| RT-qPCR | cDNA合成试剂盒 | Vazyme | R223-01 |
| SYBR预混液 | Vazyme | Q711 | |
| 双荧光素酶报告基因 | TOPflash | Addgene | 12456 |
| FOPflash | Addgene | 12457 | |
| 萤火虫荧光素酶检测系统 | Beyotime | RG005 | |
| ELISA | PRL ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H0141 |
| 类器官培养 | 基质胶 | Corning | 356231 |
| B27添加剂 | Thermo Scientific | 12587010 | |
| N2添加剂 | Thermo Scientific | 17502048 | |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒 | Thermo Scientific | 41400045 | |
| 烟酰胺 | MedChemExpress | HY-B0150 | |
| 表皮生长因子 | PeproTech | 315-09 | |
| 成纤维细胞生长因子10 | Biolegend | 751006 | |
| Noggin | PeproTech | 250-38 | |
| A83-01 | MedChemExpress | HY10432 | |
| Y27632 | MedChemExpress | HY-10071 | |
| R-Spondin-1 | PeproTech | 315-32 | |
| 动物实验 | 氯化锂 | Sigma-Aldrich | L9650 |
| 芝麻油 | Thermo Scientific | C24100 | |
| ChIP-qPCR | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9003 |
| 抗H3K4me3抗体 | Cell Signaling Technology | 9751 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | RIF患者和对照组样本量均为6例;RIF诊断标准为年龄<40岁,至少3次优质胚胎移植或≥4个优质胚胎后未临床妊娠;对照组为男方因素接受ART的患者;着床窗口期取样时间(孕激素注射后第6天)。 阅读提示:Materials and methods 的 Sample collection |
| hESCs分离和蜕膜化诱导 | 子宫内膜组织消化方式(1% I型胶原酶2小时)、原代hESCs培养条件、分化培养基成分(10 nM E2、1 μM MPA、0.5 mM 8Br-cAMP)及处理时间(48-96小时)。 阅读提示:Materials and methods 的 Isolation, culture, and in vitro decidualization of hESCs |
| MEN1敲低 | shRNA序列(5'-CTGTACCTGAAAGGATCATAC-3')、慢病毒感染时间(8-12小时)、细胞密度(约50-70%)、筛选浓度(2 μg/ml 嘌呤霉素)和筛选时长(48小时)。 阅读提示:Materials and methods 的 Isolation, culture, and in vitro decidualization of hESCs |
| 体内LiCl处理 | LiCl剂量(60 mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、给药时间(D5开始连续3天)、取材时间(D8);动物品系ICR小鼠。 阅读提示:Materials and methods 的 Animals and artificially induced in vivo decidualization |
| RNA-seq | 生物学重复数(3个)、蜕膜化处理时间(96小时)、差异表达分析软件(DESeq2)及显著阈值(校正P<0.05)。 阅读提示:Materials and methods 的 RNA-seq and data analysis |
| ChIP-qPCR | 使用的细胞数(4×10^6)、抗体(anti-H3K4me3 #9751)、染色质剪切量(10 μg)、引物序列(见补充表2)。 阅读提示:Materials and methods 的 Chromatin immunoprecipitation (ChIP)-quantitative PCR (qPCR) |