检测LPS诱导的AREG表达动态
评估LPS刺激下巨噬细胞中AREG的表达变化。
用LPS刺激RAW264.7细胞,在不同时间点检测AREG mRNA和蛋白表达;检测脓毒症小鼠血清和BMDM中的AREG蛋白水平。
LPS-induced extracellular AREG triggers macrophage pyroptosis through the EGFR/TLR4 signaling pathway.
包含体外细胞实验(BMDM、RAW264.7)、体内动物模型(CLP脓毒症小鼠)及临床患者样本(单核细胞、血清)等多层级证据,并进行功能验证(基因敲除、抑制剂)和机制验证(Co-IP、Western blot)。
骨髓来源巨噬细胞(BMDM) RAW264.7巨噬细胞系 CLP脓毒症小鼠模型 脓毒症患者外周血单核细胞
细胞外AREG浓度:100 ng/mL ATP浓度:5 mM LPS浓度:1 μg/mL EGFR抑制剂(Cetuximab)浓度:1 mM 中和抗体(Anti-AREG)浓度:300 ng/mL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估LPS刺激下巨噬细胞中AREG的表达变化。
用LPS刺激RAW264.7细胞,在不同时间点检测AREG mRNA和蛋白表达;检测脓毒症小鼠血清和BMDM中的AREG蛋白水平。
探究RPLP1是否在翻译水平调控LPS诱导的AREG表达。
通过siRNA敲低RAW264.7细胞中RPLP1,检测AREG的表达;分离核糖体新生链复合物(RNC)并检测AREG mRNA水平。
确定细胞外AREG是否通过EGFR/TLR4通路激活NF-κB。
用纯化的细胞外AREG刺激BMDM,检测EGFR、TLR4及NF-κB通路蛋白磷酸化;使用EGFR抑制剂和TLR4敲除细胞验证;通过Co-IP检测AREG与EGFR的结合。
研究细胞外AREG是否诱导炎症反应和焦亡。
检测细胞外AREG刺激后巨噬细胞释放的炎症因子和焦亡相关基因表达;用AREG和ATP共刺激BMDM,检测焦亡标志蛋白。
确认EGFR和TLR4是否介导细胞外AREG诱导的焦亡。
使用EGFR抑制剂或TLR4敲除的BMDM,检测AREG+ATP诱导的焦亡标志物表达和IL-1β/IL-18分泌。
探究中和细胞外AREG是否减弱LPS诱导的焦亡。
用AREG中和抗体预处理LPS诱导的BMDM,检测EGFR磷酸化、TLR4表达及焦亡标志物。
确定Myd88和NF-κB在细胞外AREG诱导焦亡中的作用。
使用Myd88敲除和Trif敲除的BMDM,以及NF-κB抑制剂,检测焦亡标志物表达。
测试二硫键还原剂DTT是否影响细胞外AREG诱导的焦亡。
用DTT或H2O2预处理细胞外AREG或LPS,再刺激BMDM并检测焦亡标志物。
评估细胞外AREG在脓毒症小鼠模型和患者中的作用。
在CLP脓毒症小鼠中注射细胞外AREG,观察存活率和组织病理;分析脓毒症患者血清AREG水平与严重程度和死亡率的关系,检测单核细胞中相关基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L2630 |
| 三磷酸腺苷 | Sigma-Aldrich | A6419 | |
| AREG中和抗体 | R&D | AF989 | |
| 西妥昔单抗 | Selleck | A2000 | |
| JSH-23 | MedChemExpress | HY-13982 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Scientific | 89901 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | 23227 | |
| PVDF膜 | Millipore | IEVH85R | |
| 抗EGFR抗体 | ABclonal | A2069 | |
| 抗p-EGFR抗体 | ABclonal | A23381 | |
| 抗TLR4抗体 | Immunoway | YT0744 | |
| 抗p-IκB抗体 | CST | 2859 | |
| 抗IκB抗体 | CST | 4812 | |
| 抗p-P65抗体 | CST | 3033 | |
| 抗P65抗体 | CST | 8242 | |
| 抗NLRP3抗体 | CST | 15101 | |
| 抗GAPDH抗体 | CST | 2118 | |
| 抗CASPASE1抗体 | AdipoGen | AG-20B-0042-C100 | |
| 抗GSDMD抗体 | Abcam | ab209845 | |
| 抗小鼠IgG二抗 | Proteintech | SA00001 | |
| 抗兔IgG二抗 | CST | 7074s | |
| ECL化学发光底物 | Biosharp | BL523A | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime | P0096 |
| 牛血清白蛋白 | Beyotime | ST023 | |
| 抗ASC抗体 | CST | 67824 | |
| Alexa Fluor 488偶联抗小鼠IgG | Thermo Scientific | A11029 | |
| Alexa Fluor 594偶联抗兔IgG | Thermo Scientific | 11012 | |
| DAPI | Beyotime | C1006 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Scientific | 15596018CN |
| ReverTra Ace qPCR反转录试剂盒 | Toyobo | FSQ-201 | |
| 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| SYBR Green PCR试剂盒 | Dongsheng Biotech | -- | |
| ELISA | AREG ELISA试剂盒 | R&D Systems | 989-AR |
| TNFα ELISA试剂盒 | QuantiCyto | EMC102 | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | QuantiCyto | EMC004 | |
| CCL2 ELISA试剂盒 | QuantiCyto | EMC113 | |
| CCL3 ELISA试剂盒 | QuantiCyto | EMC010 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0037 | |
| IL-18 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0730 | |
| 重组蛋白纯化 | Ni-NTA琼脂糖亲和层析 | Macherey-Nagel | 2403-001 |
| 内毒素去除凝胶 | Thermo Scientific | 20340 | |
| 内毒素检测试剂盒 | Thermo Scientific | Q32891 | |
| 免疫共沉淀 | 裂解缓冲液 | Thermo Scientific | 87787 |
| A/G磁珠 | Thermo Scientific | 80003 | |
| 抗His标签单克隆抗体 | Thermo Scientific | MA1-21315 | |
| 小鼠IgG同型对照 | MCE | HY-P80757 | |
| 单核细胞分离 | 单核细胞分离试剂盒 | TBD Science | TBD2011H |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞类型:RAW264.7、BMDM;LPS浓度:1 μg/mL;AREG浓度:100 ng/mL;ATP浓度:5 mM;中和抗体浓度:300 ng/mL 阅读提示:Materials and methods,2.2 Cell culture and treatment |
| 蛋白检测 | 抗体信息:EGFR (A2069)、p-EGFR (A23381)、TLR4 (YT0744)、p-IκB (2859)、CASPASE1 (AG-20B-0042-C100)、GSDMD (ab209845) 阅读提示:Materials and methods,2.3 Western blot |
| 基因表达检测 | 引物序列:AREG、Nlrp3、Caspase1、Il-1b、Egfr、Il-18、18S;内参:18S rRNA 阅读提示:Materials and methods,2.5 qRT-PCR analysis |
| 体内模型 | 小鼠品系:C57BL/6;周龄:8–12周;CLP模型;LPS剂量:20 mg/kg;AREG给药剂量:5 μg/小鼠(尾静脉注射) 阅读提示:Materials and methods,2.2 Cell culture and treatment;Results,3.9 Extracellular AREG mediates sepsis in mice and humans |
| 临床样本 | 患者分类:一般脓毒症、严重脓毒症、脓毒性休克;患者数量:54例;样本类型:血清、外周血单核细胞 阅读提示:Materials and methods,2.11 Isolation of monocytes in patients with sepsis;Results,3.9 Extracellular AREG mediates sepsis in mice and humans |