体外评估DSF对PEL细胞增殖和存活的影响
测定DSF对KSHV阳性PEL细胞和对照细胞增殖与凋亡的作用。
用不同浓度DSF处理DG75、BJAB、BJAB-KSHV、BC3、BCBL1、BCP1细胞,进行增殖曲线、活死细胞计数、IC50测定和凋亡流式检测,并通过Western blot检测c-Caspase 3。
Repurposing alcohol-abuse drug disulfiram for the treatment of KSHV-infected primary effusion lymphoma by activating antiviral innate immunity.
包括体外细胞增殖/凋亡实验、KSHV再激活检测、TBK1/IRF3敲除及抑制剂验证、异种移植小鼠模型等多层级体内外功能与机制验证。
PEL细胞系BCBL1、BC3、BCP1 KSHV阴性伯基特淋巴瘤细胞系BJAB、DG75 iSLK-BAC16-RGB细胞 NOD/SCID小鼠异种移植模型
DSF浓度:0-1 μM(体外) NaB诱导KSHV再激活:0.5 mM(72-96小时) TBK1敲除或GSK8612处理阻断DSF效应 IRF3敲除逆转DSF效应 体内DSF剂量:50 mg/kg或25 mg/kg(每日腹腔注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
测定DSF对KSHV阳性PEL细胞和对照细胞增殖与凋亡的作用。
用不同浓度DSF处理DG75、BJAB、BJAB-KSHV、BC3、BCBL1、BCP1细胞,进行增殖曲线、活死细胞计数、IC50测定和凋亡流式检测,并通过Western blot检测c-Caspase 3。
检测DSF是否能抑制PEL细胞中NaB诱导的KSHV裂解再激活。
用DSF和/或NaB处理BCBL1、BC3、BCP1细胞,通过RT-qPCR检测裂解基因表达、Western blot和免疫荧光检测K8蛋白,并通过qPCR定量上清中病毒颗粒。
确认DSF在内皮细胞来源的iSLK-BAC16-RGB细胞中抑制KSHV再激活和病毒产生。
用DSF和/或NaB+Dox处理iSLK-BAC16-RGB细胞,通过荧光显微镜和流式检测EGFP表达,RT-qPCR检测裂解基因,Western blot检测K8,qPCR定量病毒基因组,并用上清感染HEK293T细胞测定感染性病毒滴度。
探究DSF是否激活TBK1及下游干扰素信号通路。
用不同浓度DSF处理BJAB、BJAB-KSHV、BC3、BCBL1细胞,通过Western blot检测pTBK1,通过RT-qPCR检测IFNB1和ISGs表达。
使用TBK1敲除或抑制剂验证TBK1是否介导DSF的抗病毒和抗肿瘤效应。
在BCBL1和BC3野生型或TBK1敲除细胞中,用DSF、NaB和/或GSK8612处理,检测ISGs表达、KSHV裂解基因、K8蛋白、病毒产生、细胞增殖和凋亡。
确认TBK1下游效应器IRF3是否介导DSF的效应。
在BCBL1野生型或IRF3敲除细胞中,用DSF、NaB处理,检测ISGs、KSHV裂解基因、K8蛋白、病毒产生、细胞增殖和凋亡。
在异种移植小鼠模型中验证DSF的抗肿瘤效果是否依赖TBK1。
将BCBL1-Luc野生型或TBK1敲除细胞腹腔注射入NOD/SCID小鼠,每日给予DSF(50或25 mg/kg)或溶剂对照,通过活体成像监测肿瘤生长、腹水量、脾脏重量等。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | ExCell | -- | |
| 潮霉素 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| G418 | -- | -- | |
| 细胞增殖检测 | 台盼蓝溶液 | Yesen | 40207ES20 |
| 凋亡检测 | Annexin V-PE-Cy7 | Elabscience | E-CK-A217 |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | Thermo Fisher | Attune NxT |
| 病毒定量 | DNA酶I | Invitrogen | P30727 |
| 基因敲除 | pLentiCRISPR-V2载体 | -- | -- |
| 免疫荧光 | 抗K8单克隆抗体 | Santa Cruz | F33P1 |
| DAPI | Solarbio | C0060 | |
| 抗淬灭封片剂 | Solarbio | S2100 | |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜 | Zeiss | M2 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TransGen Biotech | ET111-01 |
| RNA提取试剂盒 | TransGen Biotech | ET111 | |
| 逆转录 | cDNA合成试剂盒 | TransGen Biotech | P40719 |
| qPCR | SYBR Green染料 | TransGen Biotech | AUQ-01 |
| 蛋白质印迹 | 抗β-肌动蛋白抗体 | ABclonal | AC026 |
| 抗TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 2880 | |
| 抗磷酸化TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 2880 | |
| 抗剪切型Caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 抗磷酸化p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 抗IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 4302 | |
| 抗GPX4抗体 | Proteintech | 67763 | |
| 抗Caspase 3抗体 | Abclonal | A19654 | |
| 抗GSDMD抗体 | Santa Cruz | sc-81868 | |
| 抗K8抗体 | Santa Cruz | F33P1 | |
| 动物实验 | 双硫仑 | MCE | HY-B0240 |
| D-荧光素 | PerkinElmer | 122799 | |
| 体内成像 | IVIS Lumina LT成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 蛋白质印迹 | West Dura ECL底物 | FTC lifetime | 047-500 mL |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基成分,包括胎牛血清浓度、抗生素及选择药物(潮霉素、嘌呤霉素、G418)浓度 阅读提示:Materials and methods: Cell lines and cell culture |
| 药物处理 | DSF浓度(0-1 μM)和溶剂(DMSO) 阅读提示:Results: DSF inhibits PEL cell proliferation, survival and progression / Figure legends |
| KSHV再激活诱导 | NaB浓度(0.5 mM)和Dox浓度(1 μg/mL),处理时间(48-96小时) 阅读提示:Results: DSF inhibits KSHV reactivation in PEL cells / Figure 2 legend |
| 信号通路抑制 | GSK8612浓度(0.2 μM或0.5 μM) 阅读提示:Results: DSF suppresses KSHV reactivation by triggering innate-immune responses / Figure 5 legend |
| 动物实验 | 小鼠品系(NOD/SCID)、细胞注射数量(1x10^7)、DSF剂量(50或25 mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、溶剂成分 阅读提示:Materials and methods: Animal Experiments / Figure 6 legend |