筛选MYSM1为DOX心脏毒性的潜在调节因子
鉴定JAMMs家族中参与DOX诱导心脏毒性的关键成员。
分析GSE224157和GSE133054 RNA-seq数据,比较DOX处理与对照心脏组织中JAMMs家族基因表达;在HL-1细胞中过表达JAMMs家族基因并检测细胞活力。
Deubiquitinase MYSM1 promotes doxorubicin-induced cardiotoxicity by mediating TRIM21-ferroptosis axis in cardiomyocytes.
包含体内动物模型(Mysm1+/−小鼠、AAV9心肌细胞特异性敲低)、体外心肌细胞(HL-1、NRPCs)功能实验、Co-IP/LC-MS/MS机制验证及铁死亡通路检测。
Mysm1+/−小鼠 AAV9-cTNT-shMYSM1小鼠 HL-1细胞 新生大鼠原代心肌细胞
DOX剂量:15 mg/kg/周,每周三次,持续2周 AAV9-shMYSM1总剂量:2×10^11 vg/只,尾静脉注射 体外DOX处理浓度:1 µM,处理24小时 Fer-1处理浓度:5 µM,处理2小时 CHX浓度:25 µg/mL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定JAMMs家族中参与DOX诱导心脏毒性的关键成员。
分析GSE224157和GSE133054 RNA-seq数据,比较DOX处理与对照心脏组织中JAMMs家族基因表达;在HL-1细胞中过表达JAMMs家族基因并检测细胞活力。
评估MYSM1敲低是否缓解DOX诱导的心脏损伤。
使用Mysm1+/−小鼠和AAV9-cTNT-shMYSM1小鼠,腹腔注射DOX建立心脏毒性模型,通过超声、血清指标、组织染色等评估心脏功能与损伤。
确证MYSM1对DOX诱导心肌细胞损伤的调控作用。
在HL-1细胞和NRPCs中敲低或过表达MYSM1,检测细胞活力、LDH释放和PI染色。
寻找MYSM1的底物,验证MYSM1与TRIM21的相互作用。
通过Co-IP联合LC-MS/MS筛选MYSM1结合蛋白;通过Co-IP和免疫荧光验证内源与外源MYSM1-TRIM21互作及共定位。
探究MYSM1是否影响TRIM21蛋白稳定性及泛素化状态。
在NIH/3T3细胞中过表达MYSM1,检测TRIM21蛋白水平;使用CHX处理检测蛋白降解速率;通过泛素化实验检测TRIM21的K48/K63泛素化。
确定MYSM1与TRIM21结合及去泛素化所需的结构域。
转染MYSM1截短突变体(ΔSANT、ΔSWIRM、ΔMPN),通过Co-IP检测与TRIM21的结合,通过泛素化实验和CHX实验检测去泛素化能力。
探究MYSM1是否通过铁死亡介导DOX心脏毒性。
在MYSM1敲低或过表达的HL-1细胞中检测铁死亡指标(Fe2+、MDA、GSH、SOD、ROS、线粒体膜电位),以及相关蛋白Nrf2、SLC7A11、GPX4表达,并加入铁死亡抑制剂Fer-1验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 多柔比星 | Sigma | D1515 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- |
| Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Solarbio | CA1210 |
| 细胞毒性检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime | C0016 |
| 免疫共沉淀 | 抗Flag磁珠 | Bimake | B26102 |
| 抗Myc磁珠 | Bimake | B26102 | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL底物 | Merck Millipore | WBKLS0500 | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596018CN |
| Prime Script RT Master Mix | Takara | RR036A | |
| SYBR Green Premix Ex Taq II | Takara | RR820A | |
| 组织学分析 | 麦胚凝集素 | Solarbio | I3300 |
| 天狼星红 | Solarbio | G1472 | |
| TUNEL染色试剂盒 | Beyotime | C1098 | |
| 免疫荧光染色 | Triton X-100 | Solarbio | T8200 |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | A8020 | |
| DAPI | Solarbio | C0065 | |
| ROS检测 | 二氢乙锭 | Beyotime | S0063 |
| 氧化应激检测 | SOD检测试剂盒 | Beyotime | S0101 |
| GSH检测试剂盒 | Beyotime | S0053 | |
| MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131 | |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1染料 | Beyotime | C2006 |
| 铁离子检测 | 亚铁离子比色法检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K881-M |
| 血清生化分析 | LDH检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A020-2-2 |
| CK-MB ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | E-EL-M0355c | |
| cTnT ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | E-EL-M1801c | |
| 抗体 | 抗MYSM1抗体 | Absin | abs136708 |
| 抗α-actinin抗体 | CST | 69758 | |
| 抗vimentin抗体 | Huabio | EM0401 | |
| 抗F4/80抗体 | Santa Cruz | sc-377009 | |
| Alexa Fluor 594标记的山羊抗兔二抗 | CST | 8889 | |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗小鼠二抗 | CST | 4408 | |
| 抗TRIM21抗体 | Proteintech | 12108-1-AP | |
| 抗γ-H2AX抗体 | Abcam | ab81299 | |
| 抗SLC7A11抗体 | Proteintech | 26864-1-AP | |
| 抗GPX4抗体 | Proteintech | 67763-1-Ig | |
| 抗Nrf2抗体 | CST | 12721 | |
| 抗Histone H3抗体 | Proteintech | 68345-1-Ig | |
| 抗Tubulin抗体 | CST | 2128 | |
| 抗GAPDH抗体 | CST | 5174 | |
| 山羊抗兔二抗 | CST | 7074 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | CST | 7076 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | Mysm1+/−小鼠(C57BL/6J背景)和野生型小鼠;DOX剂量:15 mg/kg/周,每周三次,持续2周;AAV9-shMYSM1剂量:2×10^11 vg/只,尾静脉注射,注射后4周开始DOX处理。 阅读提示:Methods: Animal experiments; Figure 2A; Figure 3A |
| 细胞培养和处理 | HL-1、NIH/3T3、NRPCs和AVCMs;DOX处理浓度1 µM,24小时;转染试剂:Lipofectamine 3000或2000。 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment |
| 功能实验 | CCK-8、LDH、PI染色;MYSM1敲低(siRNA或shRNA)或过表达(Flag-MYSM1质粒)后DOX处理。 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment; Figure 4 |
| 机制实验 | CHX浓度25 µg/mL;MG132浓度10 µM,处理4小时;泛素化检测时共转染HA-Ub、HA-K48、HA-K63。 阅读提示:Methods: Western blotting and Co-IP assay; Figure 5, 6 |
| 铁死亡检测 | 检测Fe2+、MDA、GSH、SOD、DHE、JC-1;铁死亡抑制剂Fer-1浓度5 µM,预处理2小时。 阅读提示:Methods: Determination of ROS, JC-1 staining, Measurement of ferrous iron; Figure 7 |