CNOT3表达受EGFR信号调控验证
探究CNOT3表达是否受EGFR信号通路调控
使用EGFR抑制剂(gefitinib、PD153035)处理PC-9和HCC827细胞,观察CNOT3蛋白水平变化;用EGF刺激A549细胞观察CNOT3表达变化;使用TCGA数据库分析CNOT3与ErbB家族表达相关性。
Targeting the up-regulated CNOT3 reverses therapeutic resistance and metastatic progression of EGFR-mutant non-small cell lung cancer.
包含体外细胞实验(EGFR调控、反馈回路、耐药机制)、体内异种移植模型,以及TCGA和Oncomine数据库分析等多层级验证。
PC-9人非小细胞肺癌细胞系 HCC827人非小细胞肺癌细胞系 PC-9 GR1/GR2吉非替尼耐药细胞系 BALB/c裸鼠异种移植模型
EGFR抑制剂处理(gefitinib、PD153035)对CNOT3表达的影响 c-Jun siRNA敲低对CNOT3转录及蛋白表达的影响 CNOT3 siRNA敲低对吉非替尼敏感性的影响(PC-9 GR2和H1975细胞) 体内实验中CNOT3敲低(DOX诱导shRNA)联合吉非替尼对肿瘤生长和转移的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究CNOT3表达是否受EGFR信号通路调控
使用EGFR抑制剂(gefitinib、PD153035)处理PC-9和HCC827细胞,观察CNOT3蛋白水平变化;用EGF刺激A549细胞观察CNOT3表达变化;使用TCGA数据库分析CNOT3与ErbB家族表达相关性。
验证c-Jun是否在转录水平调控CNOT3表达
使用c-Jun siRNA敲低PC-9和HCC827细胞中c-Jun,检测CNOT3 mRNA和蛋白水平;使用JNK抑制剂SP600125处理;构建CNOT3启动子截短报告基因质粒进行荧光素酶检测。
探究CNOT3对c-Jun表达的影响及其机制
敲低CNOT3后检测c-Jun mRNA和蛋白水平;使用CHX和MG132处理检测c-Jun蛋白稳定性;通过免疫共沉淀检测c-Jun泛素化水平;免疫细胞化学观察c-Jun定位。
验证CNOT3对细胞增殖和存活的作用及其机制
敲低CNOT3后通过CCK-8检测细胞增殖和活力;gefitinib处理后检测凋亡(流式);检测TSC1表达和mTOR磷酸化;敲低TSC1观察对gefitinib敏感性的影响。
探究吉非替尼耐药细胞中CNOT3表达失调的机制
建立PC-9 GR1和GR2耐药细胞系,检测CNOT3、HER2、c-Jun表达;使用gefitinib和tucatinib联合处理观察对CNOT3、c-Jun的影响;分析数据库(Oncomine)CNOT3表达与吉非替尼敏感性关系。
验证体外敲低CNOT3能否增敏吉非替尼
在PC-9 GR1、PC-9 GR2和H1975细胞中敲低CNOT3,gefitinib处理72小时,检测细胞活力(CCK-8)和蛋白表达。
验证体内敲低CNOT3能否克服吉非替尼耐药并抑制转移
将表达CNOT3-shRNA(Tet-on)的PC-9 GR2细胞皮下注射到BALB/c裸鼠,建立异种移植模型;给予DOX诱导敲低,gefitinib灌胃,监测肿瘤体积和体重,并进行组织学分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 吉非替尼 | MedChemExpress | HY-50895 |
| 图卡替尼 | MedChemExpress | HY-16069 | |
| MG132 | MedChemExpress | HY-13259 | |
| SP600125 | Sigma-Aldrich | S5567 | |
| 人表皮生长因子 | Sigma-Aldrich | E9644 | |
| PD153035 | Selleck | S6546 | |
| Western blot | 抗CNOT3抗体 | Proteintech | 11135-1-AP |
| 抗c-Jun抗体 | Cell Signaling Technology | 9165 | |
| 抗PARP-1抗体 | Cell Signaling Technology | 9532 | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 抗磷酸化mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 5536 | |
| 抗TSC1抗体 | Cell Signaling Technology | 6935 | |
| 抗JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9252 | |
| 抗磷酸化JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 4668 | |
| 抗磷酸化c-Jun抗体 | Abcam | ab30620 | |
| 抗ki67抗体 | Abcam | Ab16667 | |
| 抗泛素抗体 | Abcam | ab134953 | |
| 抗ERK1/2抗体 | Abcam | ab54230 | |
| 抗ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 抗mTOR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-517464 | |
| 免疫组织化学 | 抗角蛋白7抗体 | ZSGB-BIO | ZM-0071 |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒8 | TargetMol | C0005 |
| 质粒构建和转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | 11668019 |
| CNOT3特异性shRNA Tet-on诱导型质粒载体 | GENECHEM | GV307 | |
| RNA干扰 | 人CNOT3、c-Jun、TSC1及非靶向siRNA | GenePharma | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC/7-AAD凋亡检测试剂盒 | Keygen Biotech | KGA1025 |
| Annexin V-APC/7-AAD凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A218 | |
| 流式分析 | FACSCalibur流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- |
| RNA提取 | E.Z.N.A.总RNA提取试剂盒II | Omega Bio-tek | -- |
| cDNA合成 | PrimeScript RT预混液 | Takara | RR036A |
| qPCR | TB Green Premix Ex Taq II | Takara | RR820A |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| Immobilon-P膜 | Millipore | -- | |
| 免疫沉淀 | Pierce免疫共沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26149 |
| 免疫细胞化学 | 内质网示踪剂绿色 | Invitrogen | E34251 |
| DAPI | -- | -- | |
| 荧光显微镜 | 奥林巴斯FV10i-LIV显微镜 | Olympus | -- |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测 | Promega | E1910 |
| 动物实验 | 多西环素 | -- | -- |
| 免疫组织化学 | SP试剂盒 | ZSGB-BIO | SP-9002 |
| 科尔苏木素 | Solarbio | G1140 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CNOT3表达调控验证 | EGFR抑制剂(gefitinib、PD153035)浓度和处理时间;EGF处理时间;血清饥饿时间 阅读提示:参见Results部分“EGFR signaling regulates CNOT3 expression”及图1图注 |
| c-Jun调控CNOT3验证 | c-Jun siRNA序列和转染浓度;SP600125浓度和处理时间;CNOT3启动子报告基因构建 阅读提示:参见图1图注和Materials and methods中“RNA interference”和“Dual-Luciferase reporter assay” |
| c-Jun与CNOT3反馈回路验证 | CHX浓度和处理时间;MG132浓度和处理时间;免疫沉淀抗体 阅读提示:参见图2图注和Materials and methods中“Western blotting and immunoprecipitation” |
| 细胞增殖和凋亡检测 | gefitinib浓度和处理时间;CCK-8检测细胞数和孵育时间;流式凋亡检测试剂盒 阅读提示:参见Materials and methods中“Cell survival and cell proliferation assay”和“Flow cytometry analysis” |
| 耐药细胞建立和处理 | 耐药细胞建立方法(gefitinib浓度递增方案和持续时间);gefitinib和tucatinib处理浓度和时间 阅读提示:参见Materials and methods中“Cell culture and cell death induction”和Results“The c-Jun/CNOT3 axis is dysregulated in PC-9 GR cells” |
| 体内异种移植实验 | PC-9 GR2细胞接种数量;DOX给药方案(食物中浓度100mg/kg);gefitinib给药方案(20mg/kg每日口服灌胃);肿瘤体积测量频率;样本量(每组4只) 阅读提示:参见Materials and methods中“Tumor xenografts”和图6图注 |