单细胞RNA测序分析鉴定铁死亡软骨细胞簇并揭示TRPV1作为骨关节炎的抗铁死亡靶点

Single cell RNA-seq analysis identifies ferroptotic chondrocyte cluster and reveals TRPV1 as an anti-ferroptotic target in osteoarthritis.

作者信息Zhongyang Lv, Jie Han, Jiawei Li, Hu Guo, Yuxiang Fei, Ziying Sun, Jian Dong, Maochun Wang, Chunmei Fan, Weitong Li, Ya Xie, Wei Sun, Jiaqi Chen, Yuan Liu, Fufei Chen, Zizheng Liu, Anlong Liu, Rui Wu, Xingquan Xu, Wenjin Yan, Qing Jiang, Shiro Ikegawa, Xiao Chen, Dongquan Shi
PMID36137413
发布时间2022-10
DOI10.1016/j.ebiom.2022.104258

实验完整度

包含人软骨样本、scRNA-seq、体外细胞实验、DMM小鼠模型及Gpx4+/−小鼠机制验证等多层级证据。

主要模型

人OA软骨组织(完整与受损区域) 原代小鼠软骨细胞 DMM诱导的OA小鼠模型 人OA软骨外植体

重点核对

人OA软骨配对完整和受损区域样本量:11对用于生化检测,8对用于蛋白提取 单细胞RNA测序:3对完整和受损人OA软骨,共17,638个细胞 DMM小鼠模型:10周龄雄性C57BL/6小鼠,DMM手术,术后2、4、8周取材 辣椒素(CPS)处理:关节腔注射50 μM,8 μL每次,每周3次 Gpx4+/−小鼠模型用于验证GPX4介导TRPV1抗铁死亡作用

摘要

背景:骨关节炎(OA)是最常见的退行性关节疾病,主要以软骨破坏为特征。本研究旨在探讨软骨细胞铁死亡在OA发病机制中的作用、分子特征和潜在治疗靶点。方法:分析了OA患者配对完整和受损软骨中铁死亡标志物(铁和脂质过氧化积累、谷胱甘肽缺失)的表达。对17,638个软骨细胞进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析,以验证人OA软骨中铁死亡软骨细胞簇的存在、研究其分子特征并揭示潜在治疗靶点。使用内侧半月板失稳(DMM)诱导的OA模型和叔丁基过氧化氢(TBHP)处理的原代小鼠软骨细胞和人软骨外植体,评估药理学激活瞬时受体电位香草酸亚型1(TRPV1)的保护作用。进一步在谷胱甘肽过氧化物酶4(Gpx4)杂合基因敲除小鼠(Gpx4+/−)中研究TRPV1的下游分子机制。发现:人OA软骨受损区域中铁和脂质过氧化浓度以及铁死亡驱动因子的表达显著高于完整软骨。scRNA-seq分析揭示了一个以优先表达铁死亡标志物和基因为特征的软骨细胞簇,即铁死亡软骨细胞簇。综合基因集变异分析揭示TRPV1是人OA软骨中的抗铁死亡靶点。药理学激活TRPV1通过保护软骨细胞免受铁死亡显著减轻了软骨退变。机制上,TRPV1促进GPX4的表达,其抗铁死亡作用在Gpx4+/−小鼠的OA模型中大部分被减弱。解释:TRPV1激活通过上调GPX4保护软骨细胞免受铁死亡并改善OA进展。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
人OA软骨中是否存在具有特定分子特征的铁死亡软骨细胞簇,以及能否找到针对软骨细胞铁死亡的治疗靶点?
核心机制
TRPV1激活通过上调GPX4表达抑制软骨细胞铁死亡,从而减轻OA进展。
主要证据
通过人OA软骨生化检测和scRNA-seq鉴定铁死亡软骨细胞簇;在TBHP处理的原代软骨细胞、人软骨外植体和DMM小鼠模型中,TRPV1激动剂CPS抑制铁死亡并保护软骨,而Gpx4敲低或Gpx4+/−小鼠中该保护作用减弱。
研究意义
本研究揭示了铁死亡软骨细胞簇在OA中的作用和分子特征,并筛选验证TRPV1作为抗铁死亡靶点,为缓解OA进展提供了潜在治疗靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

检测人OA软骨中铁死亡标志物

评估OA软骨中是否存在铁死亡特征。

配对完整和受损的人OA软骨中检测铁含量、LPO水平、GSH水平、GSH/GSSG比率和GPX4活性,并通过Western blot检测铁死亡相关蛋白表达。

2

单细胞RNA测序分析人OA软骨细胞异质性

鉴定铁死亡软骨细胞簇并研究其分子特征。

对3对完整和受损人OA软骨进行scRNA-seq,聚类分析并鉴定铁死亡软骨细胞簇(C1-3-4),进行GSEA和GSVA分析。

3

体外验证TRPV1的抗铁死亡作用

验证TRPV1激活是否保护软骨细胞免受铁死亡。

使用TBHP诱导原代小鼠软骨细胞铁死亡,并用CPS激活TRPV1或JNJ抑制TRPV1,检测细胞活力、ROS、脂质过氧化和Fe2+水平。

4

体内验证TRPV1的软骨保护作用

验证TRPV1激活在DMM诱导的OA小鼠模型中是否减轻软骨退变。

对DMM小鼠关节腔注射CPS,评估软骨损伤、OARSI评分、软骨细胞数、软骨厚度及铁死亡标志物表达。

5

验证GPX4在TRPV1下游的作用

验证TRPV1的抗铁死亡作用是否依赖于GPX4。

在体外用siRNA敲低Gpx4,在体内使用Gpx4+/−小鼠,观察TRPV1激活的保护作用是否消失。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
II型胶原酶Gibco2195526
DPS缓冲液Thermo Fisher14190144
Countess II 自动细胞计数仪Thermo Fisher--
Chromium 单细胞3'文库凝胶珠试剂盒10x Genomics--
Chromium 单细胞A芯片试剂盒10x Genomics--
Illumina HiSeq Xten 测序仪Illumina--
辣椒素Abcamab141000
铁含量检测试剂盒ElabscienceE-BC-K139-S
脂质过氧化检测试剂盒JianchengA106-1-1
GPX4活性检测试剂盒JianchengA005
铁检测试剂盒JianchengA039-1-1
MMP3酶联免疫吸附试剂盒ProteintechKE00160
番红O/固绿SolarbioG1371
抗II型胶原蛋白一抗BosterBA0533
抗MMP3一抗Cell Signaling Technology14351
抗4-羟基壬烯醛一抗Abcamab46545
抗COX2一抗Proteintech66351-1-Ig
抗TRPV1一抗Proteintech66983-1-Ig
抗FTH1一抗Cell Signaling Technology4393
抗GPX4一抗Abcamab125066
抗NCOA4一抗Cell Signaling Technology66849
抗转铁蛋白一抗Proteintech17435-1-AP
抗MMP13一抗Abcamab219620
抗磷酸化CaMKII一抗Abcamab124880
FITC标记二抗Abcam--
辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgGBiosharpBL003A
超敏DAB显色试剂盒Typing1205250
VivaCT 80扫描仪Scanco Medical AG--
CF488-Tunel检测试剂盒ServicebioG1504-50T
胶原酶2Gibco--
杜氏改良Eagle培养基Gibco--
胎牛血清Gibco--
青霉素和链霉素Gibco--
JNJ-17203212MCE-MedChemExpressHY-100129
RSL3SelleckS8155
去铁胺MCEHY-B0988
Ferrostatin-1SelleckS7243
ZVAD-FMKMCEHY-16658B
坏死磺酰胺MCEHY-100573
靶向Trpv1的siRNAHippobio--
靶向Gpx4的siRNAHippobio--
RIPA裂解液SolarbioR0010
磷酸酶抑制剂混合物BimakeB15002
抗GAPDH抗体Cell Signaling Technology5174
RNA快速纯化试剂盒ES ScienceRN001
SYBR Green实时荧光定量PCR试剂盒VazymeQ411-02
LightCycler 480 PCR仪Roche--
DCFH-DA探针BeyotimeS0033S
C11-BODIPY 581/591探针GLPBIOGC40165
FerroOrange探针DojindoF374
BD AccuriC6 Plus流式细胞仪BD Biosciences--
CCK-8试剂盒DojindoCK04
AM/PI染色BestBio41260A

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
人软骨样本处理
OA患者年龄、Kellgren-Lawrence分级、完整与受损区域划分标准
阅读提示:临床标本采集部分
单细胞RNA测序
样本数量、细胞数量、质量控制参数(基因数、线粒体基因比例)、分析软件版本
阅读提示:单细胞RNA测序文库构建、质量控制与预处理部分
体外细胞实验
TBHP浓度、CPS浓度、JNJ浓度、处理时间、检测指标
阅读提示:细胞培养与处理部分及图4图注
动物实验
小鼠品系、周龄、性别、DMM手术细节、CPS给药方式、剂量、频率、取材时间
阅读提示:动物研究、DMM手术诱导OA模型部分及图5图注
机制验证
siRNA序列、Gpx4+/−小鼠来源、CPS处理对Gpx4+/−鼠的效果
阅读提示:siRNA转染部分、动物研究部分及图6图注