检测人OA软骨中铁死亡标志物
评估OA软骨中是否存在铁死亡特征。
配对完整和受损的人OA软骨中检测铁含量、LPO水平、GSH水平、GSH/GSSG比率和GPX4活性,并通过Western blot检测铁死亡相关蛋白表达。
Single cell RNA-seq analysis identifies ferroptotic chondrocyte cluster and reveals TRPV1 as an anti-ferroptotic target in osteoarthritis.
包含人软骨样本、scRNA-seq、体外细胞实验、DMM小鼠模型及Gpx4+/−小鼠机制验证等多层级证据。
人OA软骨组织(完整与受损区域) 原代小鼠软骨细胞 DMM诱导的OA小鼠模型 人OA软骨外植体
人OA软骨配对完整和受损区域样本量:11对用于生化检测,8对用于蛋白提取 单细胞RNA测序:3对完整和受损人OA软骨,共17,638个细胞 DMM小鼠模型:10周龄雄性C57BL/6小鼠,DMM手术,术后2、4、8周取材 辣椒素(CPS)处理:关节腔注射50 μM,8 μL每次,每周3次 Gpx4+/−小鼠模型用于验证GPX4介导TRPV1抗铁死亡作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估OA软骨中是否存在铁死亡特征。
配对完整和受损的人OA软骨中检测铁含量、LPO水平、GSH水平、GSH/GSSG比率和GPX4活性,并通过Western blot检测铁死亡相关蛋白表达。
鉴定铁死亡软骨细胞簇并研究其分子特征。
对3对完整和受损人OA软骨进行scRNA-seq,聚类分析并鉴定铁死亡软骨细胞簇(C1-3-4),进行GSEA和GSVA分析。
验证TRPV1激活是否保护软骨细胞免受铁死亡。
使用TBHP诱导原代小鼠软骨细胞铁死亡,并用CPS激活TRPV1或JNJ抑制TRPV1,检测细胞活力、ROS、脂质过氧化和Fe2+水平。
验证TRPV1激活在DMM诱导的OA小鼠模型中是否减轻软骨退变。
对DMM小鼠关节腔注射CPS,评估软骨损伤、OARSI评分、软骨细胞数、软骨厚度及铁死亡标志物表达。
验证TRPV1的抗铁死亡作用是否依赖于GPX4。
在体外用siRNA敲低Gpx4,在体内使用Gpx4+/−小鼠,观察TRPV1激活的保护作用是否消失。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 软骨消化 | II型胶原酶 | Gibco | 2195526 |
| 细胞悬液 | DPS缓冲液 | Thermo Fisher | 14190144 |
| 细胞计数 | Countess II 自动细胞计数仪 | Thermo Fisher | -- |
| 单细胞测序 | Chromium 单细胞3'文库凝胶珠试剂盒 | 10x Genomics | -- |
| Chromium 单细胞A芯片试剂盒 | 10x Genomics | -- | |
| Illumina HiSeq Xten 测序仪 | Illumina | -- | |
| 动物实验 | 辣椒素 | Abcam | ab141000 |
| 生化检测 | 铁含量检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K139-S |
| 脂质过氧化检测试剂盒 | Jiancheng | A106-1-1 | |
| GPX4活性检测试剂盒 | Jiancheng | A005 | |
| 滑液检测 | 铁检测试剂盒 | Jiancheng | A039-1-1 |
| MMP3酶联免疫吸附试剂盒 | Proteintech | KE00160 | |
| 组织学染色 | 番红O/固绿 | Solarbio | G1371 |
| 免疫组化 | 抗II型胶原蛋白一抗 | Boster | BA0533 |
| 抗MMP3一抗 | Cell Signaling Technology | 14351 | |
| 抗4-羟基壬烯醛一抗 | Abcam | ab46545 | |
| 抗COX2一抗 | Proteintech | 66351-1-Ig | |
| 抗TRPV1一抗 | Proteintech | 66983-1-Ig | |
| 抗FTH1一抗 | Cell Signaling Technology | 4393 | |
| 抗GPX4一抗 | Abcam | ab125066 | |
| 抗NCOA4一抗 | Cell Signaling Technology | 66849 | |
| 抗转铁蛋白一抗 | Proteintech | 17435-1-AP | |
| 抗MMP13一抗 | Abcam | ab219620 | |
| 抗磷酸化CaMKII一抗 | Abcam | ab124880 | |
| FITC标记二抗 | Abcam | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Biosharp | BL003A | |
| 超敏DAB显色试剂盒 | Typing | 1205250 | |
| 显微CT | VivaCT 80扫描仪 | Scanco Medical AG | -- |
| TUNEL检测 | CF488-Tunel检测试剂盒 | Servicebio | G1504-50T |
| 细胞培养 | 胶原酶2 | Gibco | -- |
| 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | JNJ-17203212 | MCE-MedChemExpress | HY-100129 |
| RSL3 | Selleck | S8155 | |
| 去铁胺 | MCE | HY-B0988 | |
| Ferrostatin-1 | Selleck | S7243 | |
| ZVAD-FMK | MCE | HY-16658B | |
| 坏死磺酰胺 | MCE | HY-100573 | |
| siRNA转染 | 靶向Trpv1的siRNA | Hippobio | -- |
| 靶向Gpx4的siRNA | Hippobio | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Bimake | B15002 | |
| Western blot | 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 |
| qPCR | RNA快速纯化试剂盒 | ES Science | RN001 |
| SYBR Green实时荧光定量PCR试剂盒 | Vazyme | Q411-02 | |
| LightCycler 480 PCR仪 | Roche | -- | |
| 活性氧检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | S0033S |
| C11-BODIPY 581/591探针 | GLPBIO | GC40165 | |
| FerroOrange探针 | Dojindo | F374 | |
| 流式检测 | BD AccuriC6 Plus流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | CK04 |
| AM/PI染色 | BestBio | 41260A |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人软骨样本处理 | OA患者年龄、Kellgren-Lawrence分级、完整与受损区域划分标准 阅读提示:临床标本采集部分 |
| 单细胞RNA测序 | 样本数量、细胞数量、质量控制参数(基因数、线粒体基因比例)、分析软件版本 阅读提示:单细胞RNA测序文库构建、质量控制与预处理部分 |
| 体外细胞实验 | TBHP浓度、CPS浓度、JNJ浓度、处理时间、检测指标 阅读提示:细胞培养与处理部分及图4图注 |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别、DMM手术细节、CPS给药方式、剂量、频率、取材时间 阅读提示:动物研究、DMM手术诱导OA模型部分及图5图注 |
| 机制验证 | siRNA序列、Gpx4+/−小鼠来源、CPS处理对Gpx4+/−鼠的效果 阅读提示:siRNA转染部分、动物研究部分及图6图注 |