验证人吞噬细胞中线粒体STAT3定位
检测脓毒症患者与健康志愿者吞噬细胞线粒体中STAT3的表达差异
采集外周血,分离单核吞噬细胞,提取线粒体蛋白,通过质谱和免疫印迹检测STAT3。
Mitochondrial STAT3 exacerbates LPS-induced sepsis by driving CPT1a-mediated fatty acid oxidation.
包含体内小鼠模型(诱导性敲入、LPS脓毒症模型)、体外巨噬细胞代谢分析、单细胞测序、蛋白质互作与泛素化机制验证等多层次证据。
诱导性线粒体STAT3敲入小鼠(Rosa26LSL-MLS-Stat3;UbcERT2Cre/+) 骨髓来源巨噬细胞(BMDM) 脓毒症患者和健康志愿者的外周血单个核细胞吞噬细胞 HEK293T细胞
线粒体STAT3诱导表达:4-OHT 75 mg/kg隔天腹腔注射共7次 LPS脓毒症模型:LPS 20 mg/kg腹腔注射 姜黄素处理:10 mg/kg腹腔注射(LPS前1小时) CPT1a蛋白稳定性:放线菌酮处理及MG132抑制实验 FAO测定:Seahorse XF24分析仪,BSA-棕榈酸和依托莫司处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测脓毒症患者与健康志愿者吞噬细胞线粒体中STAT3的表达差异
采集外周血,分离单核吞噬细胞,提取线粒体蛋白,通过质谱和免疫印迹检测STAT3。
建立可诱导表达线粒体STAT3的小鼠模型,以研究其在体内的作用
利用CRISPR-Cas9技术将CAG-LSL-MLS-Stat3构建到Rosa26位点,与UbcERT2Cre/+杂交,通过4-OHT诱导表达,检测MEFs和组织的STAT3表达。
观察线粒体STAT3过表达对小鼠脓毒症严重程度的影响
LPS诱导脓毒症模型,监测生存率、组织病理、血清因子、肺组织免疫细胞浸润。
分析线粒体STAT3对骨髓祖细胞和巨噬细胞亚群的影响
FACS分选c-Kit+细胞,进行单细胞RNA测序,聚类分析和差异基因表达。
检测线粒体STAT3对全身及巨噬细胞能量代谢的影响
间接测热法测定VO2、VCO2和RER;Seahorse测定ECAR、OCR及FAO。
阐明线粒体STAT3调控CPT1a表达的机制
蛋白质半衰期实验、蛋白酶体抑制实验、泛素化实验检测CPT1a降解。
寻找介导CPT1a去泛素化的关键因子并验证其功能
免疫沉淀联合质谱鉴定CPT1a互作蛋白,敲低USP50验证对CPT1a表达和FAO的影响。
验证NF-κB是否直接结合USP50启动子并调控其表达
ChIP实验检测NF-κB结合USP50启动子;用ATP处理观察NF-κB核转位。
验证姜黄素能否缓解LPS诱导的脓毒症并抑制相关信号通路
给小鼠注射姜黄素后评价生存率、血清指标及肺组织巨噬细胞浸润;体外检测对STAT3、NF-κB及CPT1a泛素化的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小鼠模型 | 脂多糖 | Sigma | -- |
| 药物处理 | 姜黄素 | MCE | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 线粒体提取 | 线粒体分离试剂盒 | Beyotime | -- |
| 流式细胞术 | 红细胞裂解液 | FCMACS | -- |
| IV型胶原酶 | VICMED | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | VICMED | -- | |
| 单细胞测序 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 代谢分析 | Seahorse XF24细胞外通量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| Oxymax系统 | Columbus Instruments | -- | |
| 免疫荧光 | PANO四重免疫组化试剂盒 | Yuanxi | -- |
| APExBIO试剂盒 | APExBIO | -- | |
| Zeiss LSM880/800共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 质谱 | 抗Flag M2磁珠 | Sigma | M8823 |
| TripleTOF 5600+质谱仪 | AB SCIEX | -- | |
| 免疫印迹 | MG-132蛋白酶体抑制剂 | Selleck | -- |
| 抗CPT1a抗体 | Proteintech | 15184-1-AP | |
| 抗p-STAT3 (Tyr705)抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| 抗p-STAT3 (Ser727)抗体 | Cell Signaling Technology | 9134 | |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 12640 | |
| 抗组蛋白H3抗体 | Cell Signaling Technology | 9715 | |
| 抗HSP60抗体 | Cell Signaling Technology | 12165 | |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 抗USP50抗体 | Proteintech | 20374-1-AP | |
| 抗CPT2抗体 | Proteintech | 26555-1-AP | |
| 抗泛素抗体 | Proteintech | 10201-2-AP | |
| 抗HA抗体 | Proteintech | 51064-2-AP | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 抗α-tubulin抗体 | Santa Cruz | 66031-1-Igsc-5286 | |
| 抗p-p65 (Ser536)抗体 | Affinity | AF2006 | |
| 抗Myc抗体 | Abbkine | 02060 | |
| 抗Flag抗体 | Abmart | -- | |
| 转染 | jetPRIME转染试剂 | Polyplus | -- |
| RT-PCR | SYBR Green I预混液 | Roche Diagnostics | -- |
| LightCycler 480系统 | Roche Group | -- | |
| ChIP | ChIP试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 细胞因子检测 | RayBio小鼠细胞因子抗体阵列3 | RayBiotech | AAM-CYT-G3-8 |
| CBA试剂盒 | BioLegend | -- | |
| ATP检测 | 增强型ATP检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| LDH检测 | LDH检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| 白蛋白检测 | 白蛋白检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| ELISA | MCP-5 ELISA试剂盒 | Jiangsu Meimian industrial Co., Ltd | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠诱导性线粒体STAT3敲入 | 4-OHT剂量(75 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药次数(隔天一次,共7次) 阅读提示:Methods - Mice部分 |
| LPS脓毒症模型 | LPS剂量(20 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、观察时间(24小时至144小时) 阅读提示:Methods - Sepsis model部分 |
| 姜黄素处理 | 姜黄素剂量(10 mg/kg)、给药时间(LPS前1小时)、给药途径(腹腔注射) 阅读提示:Methods - Sepsis model部分 |
| 骨髓来源巨噬细胞分化 | M-CSF浓度(20 ng/mL)、培养时间(4天)、细胞因子去除抗体 阅读提示:Methods - Cell isolation and culture部分 |
| Seahorse代谢分析 | 细胞密度(8.0×10^4)、LPS浓度(100 ng/mL)、处理时间(6小时)、底物浓度(葡萄糖30 mmol/L,寡霉素2 μmol/L,2-DG 100 mmol/L,FCCP 4 μmol/L,鱼藤酮100 nmol/L,抗霉素A 1 μmol/L) 阅读提示:Methods - Metabolic assays部分 |
| CPT1a蛋白稳定性实验 | CHX浓度(100 μg/mL)、MG132浓度(10 μmol/L)、处理时间(8小时) 阅读提示:Methods - Immunoblot assay部分 |
| scRNA-seq | 细胞分选标记(c-Kit+)、细胞数量(约5000个细胞/样本) 阅读提示:Methods - Single-cell RNA-sequencing部分 |