细胞活力与凋亡检测
验证褪黑素对KRAS突变NSCLC细胞活力的影响及是否诱导凋亡。
将H460、A549和LLC1细胞用不同浓度褪黑素处理24和48小时,进行CCK8细胞活力检测、集落形成实验、显微镜观察和Annexin V/PI流式凋亡检测,并用Western blot检测凋亡相关蛋白。
Melatonin Downregulates PD-L1 Expression and Modulates Tumor Immunity in KRAS-Mutant Non-Small Cell Lung Cancer.
包含细胞活力与凋亡检测、PD-L1表达分析、YAP/TAZ机制验证、公共数据库临床分析、同基因小鼠模型体内验证等多个独立证据层级,并包含功能验证和机制验证。
人KRAS突变NSCLC细胞系A549、H460 小鼠KRAS突变肺癌细胞系LLC1 同基因小鼠LLC1移植瘤模型 TCGA肺腺癌患者队列
细胞系:A549、H460、LLC1(KRAS突变) 褪黑素处理浓度与时间:0-15 mM,24-48 h IFN-γ刺激条件:50 ng/mL,预处理褪黑素2.5 mM 60 min 动物实验:LLC1细胞皮下接种C57BL/6小鼠,褪黑素30 mg/kg腹腔注射每周三次共4周 YAP/TAZ抑制剂verteporfin (VP)浓度:1 μM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证褪黑素对KRAS突变NSCLC细胞活力的影响及是否诱导凋亡。
将H460、A549和LLC1细胞用不同浓度褪黑素处理24和48小时,进行CCK8细胞活力检测、集落形成实验、显微镜观察和Annexin V/PI流式凋亡检测,并用Western blot检测凋亡相关蛋白。
评估褪黑素对KRAS突变NSCLC细胞PD-L1表达的影响,包括基础表达和IFN-γ诱导表达。
使用CCLE数据库分析KRAS突变与野生型细胞中PD-L1 mRNA水平;Western blot检测PD-L1蛋白水平;RT-qPCR检测mRNA;用褪黑素预处理后加IFN-γ刺激,Western blot和流式检测PD-L1表达。
探究褪黑素下调PD-L1的潜在机制,验证是否通过抑制YAP/TAZ实现。
分析CCLE和TCGA数据库中YAP/TAZ与PD-L1的相关性;Western blot检测YAP/TAZ蛋白水平;RT-qPCR检测下游靶基因CTGF和Cyr61;使用YAP/TAZ抑制剂verteporfin (VP)单独或联合褪黑素处理,检测YAP和PD-L1表达。
评估褪黑素在体内对肿瘤生长和肿瘤免疫微环境的影响。
将LLC1细胞皮下注射至C57BL/6小鼠,褪黑素腹腔注射治疗4周,测量肿瘤体积和体重;流式细胞术分析肿瘤浸润淋巴细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Glutagro | Corning | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| 流式凋亡检测 | Annexin V-FITC/碘化丙啶凋亡检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 流式检测PD-L1 | PE偶联抗PD-L1抗体 | Abcam | -- |
| 流式细胞术 | BD FACSVia流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| YAP一抗 | Cell Signaling Technology | #12395 | |
| YAP/TAZ一抗 | Cell Signaling Technology | #8410 | |
| 磷酸化YAP(S127)一抗 | Cell Signaling Technology | #13008 | |
| Caspase 9一抗 | Cell Signaling Technology | #9504 | |
| PD-L1一抗 | Cell Signaling Technology | #13684 | |
| β-actin一抗 | GeneTex | GTX109639 | |
| Bcl-2一抗 | GeneTex | GTX100064 | |
| Bcl-xL一抗 | GeneTex | GTX105661 | |
| Caspase 3一抗 | GeneTex | GTX110543 | |
| Caspase 9一抗 | GeneTex | GTX112888 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| RNA提取 | GENzol TriRNA纯化试剂盒 | Geneaid | -- |
| RT-qPCR | M-MLV逆转录酶 | Promega | -- |
| GoTaq qPCR预混液 | Promega | -- | |
| StepOne Plus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 动物实验 | gentleMACS肿瘤解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| 流式分析 | CD45-APC抗体 | Miltenyi Biotec | -- |
| CD11b-PE抗体 | Miltenyi Biotec | -- | |
| CD3-FITC抗体 | Miltenyi Biotec | -- | |
| CD8-APC-Vio770抗体 | Miltenyi Biotec | -- | |
| Ly6G-FITC抗体 | Miltenyi Biotec | -- | |
| CD4-PE-Vio770抗体 | Miltenyi Biotec | -- | |
| F4/80-APC抗体 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 药物处理 | 褪黑素 | Selleck | -- |
| 维替泊芬 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 干扰素-γ | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 所用细胞系(A549、H460、LLC1等)及其来源;培养基(RPMI 1640)和添加物(7% FBS、1%青霉素-链霉素、1% Glutagro) 阅读提示:Materials and Methods, 4.1 Cell Culture |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度(6×10^3 cells/well)、褪黑素浓度(0-15 mM)、处理时间(24和48 h)、CCK-8试剂孵育时间(60 min) 阅读提示:Materials and Methods, 4.2 Cell Viability Assay; Figure 1A |
| 凋亡检测 | 细胞接种密度(5×10^5 cells/well)、褪黑素浓度(0-5 mM)、处理时间(24 h)、Annexin V-FITC/PI染色 阅读提示:Materials and Methods, 4.3 Flow Cytometry; Figure 1D |
| PD-L1表达检测 | 褪黑素浓度(1-5 mM)、处理时间(24 h)、IFN-γ浓度(50 ng/mL)及预处理时间(60 min) 阅读提示:Materials and Methods, 4.3 Flow Cytometry; Figure 2C-F |
| YAP/TAZ机制验证 | 褪黑素浓度(1-5 mM)、处理时间(24 h)、VP浓度(1 μM)、联合处理方式 阅读提示:Materials and Methods, 4.4 Western Blotting; Figure 3D-F |
| 动物实验 | 小鼠品系(C57BL/6)和年龄(8周)、细胞接种数量(1×10^6)、褪黑素剂量(30 mg/kg)、给药频率(每周三次)和持续时间(4周) 阅读提示:Materials and Methods, 4.6 Animal Study; Figure 4A-C |
| 肿瘤浸润淋巴细胞分析 | 肿瘤组织解离方法(gentleMACS kit)、抗体组合(CD45、CD11b、CD3、CD8、Ly6G、CD4、F4/80)、流式分析 阅读提示:Materials and Methods, 4.6 Animal Study; Figure 4D; Supplementary Figure S1 |