临床样本分析
评估HCC组织中乳酸及乳酰化水平与疾病分期和预后的关联
收集89例HCC患者肿瘤及癌旁组织,检测乳酸浓度,通过Western blot和免疫组化分析Pan Kla及H3K18la表达,并根据TNM分期分层。
Targeting KIF20A blocks lactylation modification to suppress immune escape in hepatocellular carcinoma.
包含临床样本分析(89对组织)、细胞实验、共培养、动物模型及机制验证(ChIP、报告基因),并进行功能回复和联合治疗实验。
肝细胞癌细胞系(Huh7、HCCLM3等) 小鼠皮下移植瘤模型(Hepa1-6细胞) 小鼠原位肝癌模型(Hepa1-6细胞) 89例HCC患者肿瘤及癌旁组织
H3K18la和Pan Kla在HCC组织及细胞系中高表达;H3K18la水平随TNM分期升高 糖酵解抑制剂(2-DG、oxamate)处理Huh7细胞24小时,剂量依赖性降低乳酸、Pan Kla和H3K18la LDHA/B双敲除(DKO)后与CD8+ T细胞共培养,可恢复T细胞增殖和效应分子(GzMB、IFN-γ)表达 体外CD8+ T细胞共培养:HCC细胞与CD8+ T细胞比例1:3,使用1 μg/ml CD3/CD28抗体维持刺激 体内动物模型:皮下注射2×10^5 Hepa1-6细胞;组合治疗组使用oxamate(250 mg/kg/天,腹腔注射)和抗PD-1抗体(250 μg/小鼠,每3天一次)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HCC组织中乳酸及乳酰化水平与疾病分期和预后的关联
收集89例HCC患者肿瘤及癌旁组织,检测乳酸浓度,通过Western blot和免疫组化分析Pan Kla及H3K18la表达,并根据TNM分期分层。
确定糖酵解抑制对HCC细胞乳酸及乳酰化的影响
用2-DG和oxamate处理Huh7细胞,检测乳酸水平和Pan Kla/H3K18la表达;通过siRNA或shRNA构建LDHA/LDHB单敲和双敲细胞,检测乳酸及乳酰化变化。
验证HCC细胞乳酸化修饰对CD8+ T细胞功能的影响
将对照组或LDHA/B DKO的Huh7细胞与活化CD8+ T细胞共培养,检测肿瘤细胞增殖(集落形成、CCK-8)以及CD8+ T细胞的增殖和效应分子(GzMB、IFN-γ)表达。
评估LDHA/B敲除对HCC肿瘤生长和CTL浸润的影响
将对照或LDHA/B DKO的Hepa1-6细胞皮下接种C57BL/6J小鼠,监测肿瘤体积和生存期,分析肿瘤组织乳酸、H3K18la和Pan Kla表达,并通过流式检测TIL。
验证LDHA/B敲除的抗肿瘤作用依赖于CD8+ T细胞
植入肿瘤前48小时腹腔注射抗CD8抗体(500 μg/只),随后每两周注射维持CD8+ T细胞清除,比较肿瘤生长。
阐明H3K18la调控KIF20A转录及KIF20A调控PD-L1的机制
构建KIF20A启动子荧光素酶报告基因,检测乳酸的影响;ChIP-PCR检测H3K18la和EP300结合KIF20A启动子;敲低/过表达KIF20A,检测c-Myc和PD-L1表达及启动子结合;共转染c-Myc siRNA和KIF20A过表达质粒,验证KIF20A通过c-Myc调控PD-L1。
评估oxamate联合抗PD-1对HCC的疗效
皮下接种Hepa1-6细胞的小鼠,当肿瘤体积达100 mm3时随机分为4组:对照(IgG)、oxamate、抗PD-1、联合组,监测肿瘤体积、生存期,并检测肿瘤组织乳酸、Ki-67、Pan Kla、H3K18la、KIF20A、c-Myc和PD-L1表达,以及CTL功能。
验证KIF20A敲除能否逆转乳酸诱导的HCC进展
将Hepa1-6-sgNC或Hepa1-6-sgKif20a-Luc细胞原位注射到小鼠肝脏,腹腔注射乳酸(2 g/kg/天),通过生物发光成像监测肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫印迹 | KIF20A多克隆抗体 | Proteintech | 15911-1-AP |
| c-Myc多克隆抗体 | Proteintech | 10828-1-AP | |
| PD-L1/CD274多克隆抗体 | Proteintech | 28076-1-AP | |
| LDHA特异性多克隆抗体 | Proteintech | 19987-1-AP | |
| LDHB多克隆抗体 | Proteintech | 14824-1-AP | |
| β-肌动蛋白多克隆抗体 | Proteintech | 20536-1-AP | |
| 抗L-乳酰赖氨酸兔单克隆抗体 | PTM BIO | PTM-1401 | |
| 抗L-乳酰组蛋白H3 (Lys18)兔单克隆抗体 | PTM BIO | PTM-1406RM | |
| 染色质免疫沉淀 | 抗L-乳酰组蛋白H3 (Lys18)兔单克隆抗体(ChIP级) | PTM BIO | PTM-1427RM |
| 免疫印迹 | 组蛋白H3K18ac抗体 | Proteintech | 39130 |
| 组蛋白H3多克隆抗体 | Proteintech | 17168-1-AP | |
| 流式细胞术 | 颗粒酶B单克隆抗体(PE) | Thermo Fisher | 12-8898-82 |
| 抗人/鼠颗粒酶B(APC/Cy7) | BioLegend | 372227 | |
| PE抗小鼠IFN-γ抗体 | Elabscience | E-AB-F1101D | |
| APC抗小鼠IFN-γ抗体 | Elabscience | E-AB-F1101E | |
| FITC抗小鼠IFN-γ抗体 | Elabscience | E-AB-F1101C | |
| 免疫组织化学 | Ki-67多克隆抗体 | Proteintech | 27309-1-AP |
| 染色质免疫沉淀 | p300 (D8Z4E)兔单克隆抗体 | CST | 86377 |
| 动物实验 | 抗小鼠PD-1抗体(体内用) | Bio X Cell | BE0273 |
| T细胞培养 | 抗人CD3抗体(体内用) | Bio X Cell | BE0001-2 |
| 抗人CD28抗体(体内用) | Bio X Cell | BE0248 | |
| 动物实验对照 | 大鼠IgG2a抗体(体内用) | Bio X Cell | BE0089 |
| 动物实验 | 抗小鼠CD8α抗体(体内用) | Bio X Cell | BE0117 |
| 流式细胞术 | FITC抗小鼠CD3抗体 | Elabscience | E-AB-F1013C |
| APC抗小鼠CD8a抗体 | Elabscience | E-AB-F1104E | |
| PerCP抗小鼠CD45抗体 | Elabscience | E-AB-F1136F | |
| 抗人CD44抗体 | Elabscience | E-AB-F1215A | |
| APC抗小鼠CD62L抗体 | Elabscience | E-AB-F1011E | |
| PE/Cyanine7抗小鼠TNFα抗体 | Elabscience | AN00567H | |
| FITC抗人Ki-67抗体 | Elabscience | AN00540C | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | GIBCO | 11965-092 |
| RPMI-1640培养基 | Thermo Fisher | 17104019 | |
| 胎牛血清 | GIBCO | 10437-028 | |
| 青霉素-链霉素 | GIBCO | 15140-122 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Yeasen | 40802ES01 |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | Solarbio | P8230 |
| ChIP实验 | ChIP裂解缓冲液 | Beyotime | P2078 |
| 核糖核酸酶A | Beyotime | ST579 | |
| 蛋白酶K | Beyotime | ST535 | |
| 糖酵解抑制 | 2-脱氧葡萄糖 | APExBIO | B1027 |
| 草氨酸盐 | MCE | HY-W013032A | |
| 细胞消化 | 脱氧核糖核酸酶I | Roche | 10104159001 |
| 乳酸检测 | 乳酸检测试剂盒 | Solarbio | BC2235 |
| T细胞分离 | CD8a+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-075 |
| T细胞培养 | 重组人IL-2 | PeproTech | 200-02 |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | Servicebio | G1014 |
| TIL分离 | Percoll梯度离心 | Cytiva | 17-0891-01 |
| 病毒包装 | pMD2.G质粒 | Addgene | 12259 |
| psPAX2质粒 | Addgene | 12260 | |
| 细胞培养 | Huh7细胞系 | FUHENG BIOLOGY | FH0075 |
| HCCLM3细胞系 | FUHENG BIOLOGY | FH0096 | |
| MHCC97-H细胞系 | FUHENG BIOLOGY | FH0095 | |
| MHCC97-L细胞系 | FUHENG BIOLOGY | FH0097 | |
| Hep3B细胞系 | FUHENG BIOLOGY | FH0861 | |
| Hepa 1-6细胞系 | FUHENG BIOLOGY | FH0862 | |
| HEK293T细胞系 | FUHENG BIOLOGY | FH0952 | |
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | Beijing HFK Bio-Technology.co., LTD | 0055670 |
| 肝特异性KIF20A敲除C57BL/6J小鼠 | cyagen (Nanjing, China) | S-KO-17831 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞处理 | 细胞系:Huh7和HCCLM3;糖酵解抑制剂2-DG和oxamate的浓度及处理时间;乳酸处理浓度(20 mM)和时间(24小时) 阅读提示:Methods 中 'Cell culture' 和 'Lactate level measurement' 部分,以及 Figure 2 legend |
| 基因敲除/过表达 | siRNA和过表达质粒的转染试剂(Lipofectamine 2000)和效率验证时间(48小时);LDHA/B双敲细胞系构建用的shRNA和筛选标记(puromycin);KIF20A敲除用sgRNA序列 阅读提示:Methods 中 'Transfection and lentiviral infection' 部分 |
| 体外共培养 | CD8+ T细胞来源(PBMC)、分离试剂盒(CD8a+ T Cell Isolation Kit);激活条件(CD3/CD28抗体浓度5 μg/ml,3天;IL-2浓度20 ng/ml,4天);共培养比例(1:3)和CD3/CD28抗体维持浓度(1 μg/ml) 阅读提示:Methods 中 'In vitro T cell co-culture assay' 部分 |
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6J)、周龄(6-8周)、皮下接种细胞数(2×10^5)、原位注射细胞数(2×10^5);组合治疗分组:oxamate剂量(250 mg/kg/day,腹腔注射)、抗PD-1剂量(250 μg/只,每3天一次) 阅读提示:Methods 中 'Animal models'、'Subcutaneous tumor model' 和 'Orthotopic xenograft HCC model' 部分 |
| 分子检测 | ChIP实验所用抗体(H3K18la、EP300、c-Myc)和IgG对照;甲醛固定浓度(1%)和时间(10分钟);染色质片段化大小(200-500 bp);荧光素酶报告基因载体(pGL3-basic和pRL-TK)和检测系统(DLR) 阅读提示:Methods 中 'Chromatin immunoprecipitation (ChIP)-PCR' 和 'Luciferase reporter assay' 部分 |