临床样本分析
比较OSCC组织和正常组织中NCOA7的表达差异,并分析其与临床病理参数的相关性。
收集54例OSCC标本(其中27例有对应正常标本),进行H&E和NCOA7免疫组化染色,通过IHC评分分组并进行相关性分析。
NCOA7 promotes OSCC progression by inhibiting ROS-regulated ferroptosis.
包含临床组织样本分析、体外细胞功能实验、铁死亡及ROS机制验证,证据层级多样。
临床OSCC组织样本 HOK细胞 HSC4细胞系
NCOA7表达水平:OSCC组织中的表达 NCOA7敲低效率:siRNA转染后敲低效率超过70% ROS水平:DCFH-DA检测 铁死亡标志物:SLC7A11、GPX4、TFR1、PTGS2的表达 功能恢复实验:NAC或Fer-1对NCOA7敲低细胞增殖、迁移、侵袭的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较OSCC组织和正常组织中NCOA7的表达差异,并分析其与临床病理参数的相关性。
收集54例OSCC标本(其中27例有对应正常标本),进行H&E和NCOA7免疫组化染色,通过IHC评分分组并进行相关性分析。
验证OSCC细胞系中NCOA7的表达水平,并建立NCOA7敲低模型。
检测HOK、HSC3、HSC4细胞中NCOA7的表达,选择HSC4细胞进行siRNA转染敲低,并通过qRT-PCR和ICC验证敲低效率。
检测NCOA7敲低对OSCC细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。
使用CCK-8检测细胞增殖,transwell和3D球体实验检测迁移和侵袭能力。
检测NCOA7敲低对铁死亡标志物表达的影响。
通过qRT-PCR和western blot检测SLC7A11、GPX4、TFR1、PTGS2的mRNA和蛋白表达。
检测NCOA7敲低对细胞内ROS水平的影响。
使用DCFH-DA荧光探针通过ICC和流式细胞术检测ROS水平。
验证NCOA7通过调控ROS介导铁死亡影响OSCC进展。
使用NAC、DFO、Fer-1、erastin处理细胞,观察对ROS、铁死亡标志物以及细胞功能的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织染色 | BX-43正置光学显微镜 | Olympus Corporation | -- |
| 免疫组织化学 | NCOA7抗体 | Abmart | PA2863 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Procell | PM150210 |
| 胎牛血清 | Every Green | 11011-8611 | |
| 青霉素/链霉素 | Beyotime | C0222 | |
| 药物处理 | N-乙酰-L-半胱氨酸 | Beyotime | ST2524 |
| 甲磺酸去铁胺 | Selleck | S5742 | |
| Ferrostatin-1 | MedChemexpress | HY-100579 | |
| Erastin | Macklin | E872563 | |
| qRT-PCR | RNA提取试剂盒 | Accurate Biology | AG21023 |
| 逆转录试剂盒 | Accurate Biology | AG11707 | |
| SYBR Green qPCR试剂盒 | Accurate Biology | AG11701 | |
| 实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫细胞化学 | Triton X-100 | Solarbio | T8200 |
| Ki67抗体 | Bioss | bs-23103R | |
| GPX4抗体 | Abmart | T56959 | |
| 山羊抗兔IgG (H+L) Alexa Fluor 594 | Oriscience | PD306 | |
| 山羊抗兔IgG (H+L) Alexa Fluor 488 | Oriscience | PD304 | |
| DAPI溶液 | Solarbio | C0056 | |
| 荧光显微镜 | Olympus | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000015 |
| CCK-8实验 | CCK-8试剂 | Oriscience | CB101 |
| Tecan Spark酶标仪 | Biotek | -- | |
| Transwell实验 | Matrigel基质胶 | Yeasen | 40182ES08 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 | |
| PVDF膜 | Solarbio | YA1701 | |
| QuickBlock封闭液 | Beyotime | P0252 | |
| β-actin抗体 | Bioss | bs-0061R | |
| SLC7A11抗体 | HUABIO | HA600098 | |
| TFR1抗体 | HUABIO | HA723545 | |
| PTGS2抗体 | HUABIO | ET1610-23 | |
| 山羊抗兔IgG H&L,HRP标记 | Bioss | bs-0295G-HRP | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG多克隆 | HUABIO | HA1006 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Solarbio | PE0010 | |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪(Melody) | Becton & Dickinson | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 样本数量:54例OSCC,27例配对正常组织;IHC评分中位数分组;相关性分析方法 阅读提示:Materials and methods: Human clinical tissue specimens, Immunohistochemistry, Results: Expression level and clinical significance of NCOA7 in OSCC |
| 细胞培养与处理 | 细胞系:HOK, HSC3, HSC4;培养条件:DMEM+10%FBS+1%P/S;处理药物浓度:NAC 3mM, DFO 1µM, Fer-1 10µM, erastin 10µM 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and reagents |
| NCOA7敲低 | siRNA序列、转染试剂Lipofectamine 3000、敲低效率验证 阅读提示:Materials and methods: Small interfering RNA (siRNA) transfection |
| 功能实验 | CCK-8:细胞数、培养时间;transwell:细胞数、迁移/侵袭时间、Matrigel包被;3D球体:细胞数、培养时间 阅读提示:Materials and methods: Cell counting Kit-8 (CCK-8) assay, Transwell migration and invasion assays, 3D spheroid migration and invasion assays |
| 铁死亡标志物检测 | 标志物:SLC7A11, GPX4, TFR1, PTGS2;检测方法:qRT-PCR、western blot、ICC;抗体稀释度 阅读提示:Materials and methods: qRT-PCR, Western blot, Immunocytochemistry |
| ROS检测 | 探针DCFH-DA浓度、孵育时间;检测方法:荧光显微镜、流式细胞术 阅读提示:Materials and methods: Intracellular ROS evaluation |
| 统计设计 | 数据表示:mean±SD;统计检验:t检验、ANOVA;显著性水平p<0.05 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |