GIO小鼠模型验证
验证DEX诱导的GIO小鼠模型是否成功建立。
对DEX处理组和对照组小鼠进行Micro-CT扫描,分析骨参数并显示骨丢失。
Up-regulation of Ifi27l2a expression in bone marrow monocytes contributes to glucocorticoid-induced bone loss.
该研究包含单细胞转录组分析、体外细胞实验(RAW264.7及原代细胞)及体内动物模型(GIO小鼠及AAV介导的敲低),并进行了机制验证(Wnt-β-catenin通路)。
GIO小鼠模型(DEX诱导) RAW264.7细胞系 小鼠原代骨髓来源单核细胞 AAV-Ifi27l2a处理的小鼠模型
DEX给药剂量:25 mg/kg/d,皮下注射,持续4周 AAV注射剂量:5×10^13 vg/kg,尾静脉注射,每周一次,共4周 体外DEX浓度:1 μM用于后续实验 RANKL浓度:50 ng/mL用于诱导破骨细胞分化 M-CSF浓度:30 ng/mL用于原代细胞培养
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DEX诱导的GIO小鼠模型是否成功建立。
对DEX处理组和对照组小鼠进行Micro-CT扫描,分析骨参数并显示骨丢失。
揭示GIO小鼠骨髓细胞的异质性和转录组改变。
对DEX组和对照组小鼠的骨髓细胞进行scRNA-seq,鉴定细胞类型,分析比例变化及差异表达基因。
评估GIO小鼠骨髓造血干细胞分化方向的变化。
使用Monocle 2进行拟时间分析,比较两组造血干细胞的分化轨迹。
分析单核细胞亚群组成及Ifi27l2a的表达特征。
对单核细胞进行亚聚类,鉴定13个亚群,比较GIO组与对照组中经典单核细胞比例和Ifi27l2a表达,并分析与破骨前体标志物(Csf1r, Cx3cr1, Tnfrs11a)的关系。
在组织水平验证Ifi27l2a在GIO小鼠骨髓中的表达。
通过免疫组化和免疫荧光染色检测GIO和对照组小鼠股骨骨髓中Ifi27l2a的表达和定位。
确定DEX对RAW264.7细胞破骨分化及Ifi27l2a表达的影响。
用不同浓度DEX处理RAW264.7细胞,检测TRAP活性、破骨标志物表达及Ifi27l2a蛋白水平。
验证敲低或过表达Ifi27l2a对破骨细胞分化的影响。
使用siRNA敲低或质粒过表达Ifi27l2a,检测破骨分化指标及Wnt通路蛋白变化。
阐明Ifi27l2a促进破骨细胞分化的机制。
使用Wnt通路激动剂BML284和抑制剂XAV939,检测Ifi27l2a对Wnt通路及破骨分化的影响。
评估敲低Ifi27l2a是否缓解GIO小鼠的骨丢失。
通过尾静脉注射AAV-Ifi27l2a敲低Ifi27l2a,检测骨微结构参数、破骨细胞数量及细胞因子水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Procell | -- |
| αMEM培养基 | Procell | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | Procell | -- | |
| 胎牛血清 | Procell | -- | |
| 药物处理 | 地塞米松磷酸钠注射液 | Zhuofeng Pharmaceutical | -- |
| 细胞培养 | RANKL | Novoprotein | -- |
| 动物实验 | 地塞米松 | -- | -- |
| Micro-CT | 布鲁克Skyscan 1276 | Bruker | -- |
| 活体CT扫描 | Super Nova PET/CT | -- | -- |
| 单细胞RNA测序 | Chromium单细胞3' GEM、文库与凝胶珠试剂盒v3.1 | 10x Genomics | 1000121 |
| Chromium Next GEM芯片G单细胞试剂盒 | 10x Genomics | 1000120 | |
| Chromium单细胞控制器 | 10x Genomics | -- | |
| S1000TM触控热循环仪 | Bio-Rad | -- | |
| 安捷伦4200 | Agilent | -- | |
| Illumina Novaseq 6000 | Illumina | -- | |
| 细胞处理 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| 细胞活性检测 | CCK-8试剂盒 | GLPBIO | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Epizyme Biotech | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Epizyme | -- | |
| 5×蛋白上样缓冲液 | Epizyme | -- | |
| PVDF膜 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 脱脂奶粉 | -- | -- | |
| 抗Ifi27l2a抗体 | Abcepta | AP22279b | |
| 抗AXIN2抗体 | Proteintech | 20540-1-AP | |
| 抗GSK3β抗体 | Proteintech | 22104-1-AP | |
| 抗磷酸化GSK3β抗体 | Immunoway | YP0124 | |
| 抗β-catenin抗体 | Proteintech | 51067-2-ap | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 20536-1-AP | |
| 抗Lamin B1抗体 | Proteintech | 12987-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 增强化学发光试剂 | Tanon | -- | |
| 尼康DS-U3成像系统 | Nikon | -- | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Thermo Fisher | -- |
| PrimeScriptTM RT Master Mix | Takara | -- | |
| 实时PCR扩增系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 破骨细胞分化 | TRAP试剂盒(Amizona) | Amizona | -- |
| TRAP活性检测 | TRAP染色试剂盒(Solarbio) | Solarbio | -- |
| 细胞因子检测 | ELISA试剂盒 | BOSTER | -- |
| 单细胞分离 | 红细胞裂解液 | Solarbio | -- |
| 细胞培养 | 巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| GIO小鼠模型 | 小鼠品系、周龄、性别;DEX剂量和给药方式;对照组处理 阅读提示:Methods - Animal experiment design |
| 单细胞RNA测序 | 样本量、细胞捕获数、数据过滤标准、聚类参数 阅读提示:Methods - Single-cell RNA sequencing |
| 体外破骨细胞分化 | 细胞系、DEX浓度、RANKL浓度、处理时间、细胞接种密度 阅读提示:Methods - Osteoclast differentiation, TRAP staining, and TRAP activity assay; Results - 5 |
| 基因敲低/过表达 | siRNA序列、转染条件、质粒转染方法 阅读提示:Methods - Cell transfection |
| Wnt通路干预 | BML284和XAV939的浓度、处理时间 阅读提示:结果-6和7及补充材料 |
| 体内敲低实验 | AAV类型、注射途径、剂量、时间;分组 阅读提示:Methods - Animal experiment design; Results - 8 |
| 组织学检测 | 固定、脱钙、切片、染色步骤;抗体浓度 阅读提示:Methods - Histology |
| ELISA检测 | 检测的细胞因子、试剂盒品牌 阅读提示:Methods - Cytokine measurement |