检测UNC13B表达
评估UNC13B在MM细胞系中的表达水平。
通过qPCR检测U266、ARD和RPMI 8226细胞中UNC13B mRNA表达。
Inhibiting UNC13B Suppresses Cell Proliferation by Upregulating the Apoptotic Pathway in Multiple Myeloma.
包含qPCR表达检测、shRNA敲低、CCK-8增殖、软琼脂克隆、流式凋亡和周期、Western blot蛋白验证,但未涉及动物或患者样本。
ARD细胞系 U266细胞系 RPMI 8226细胞系
UNC13B shRNA靶序列:GACCTACAAATGGGAGCAAAT(shUNC13B-1)和CGAGTCCTATGAGTTGCAGAT(shUNC13B-2) 细胞培养条件:RPMI-1640培养基,10% FBS,1%青霉素-链霉素,37°C,5% CO2 嘌呤霉素筛选浓度:2 μg/mL,处理72小时 CCK-8增殖检测:2000细胞/孔,连续5天 Western blot检测蛋白:UNC13B、cleaved-PARP、Bax、p21、PINK1、CDK2、AKR7A3、Bim
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估UNC13B在MM细胞系中的表达水平。
通过qPCR检测U266、ARD和RPMI 8226细胞中UNC13B mRNA表达。
抑制UNC13B表达以研究其功能。
使用慢病毒载体转导shRNA敲低ARD细胞中UNC13B表达,并通过嘌呤霉素筛选稳定转导细胞。
评估UNC13B敲低对细胞增殖的影响。
通过CCK-8实验检测细胞增殖能力,连续5天测定OD450。
评估UNC13B敲低对锚定非依赖性生长的影响。
通过软琼脂克隆形成实验检测细胞克隆形成能力。
评估UNC13B敲低对细胞周期分布的影响。
通过PI染色和流式细胞术分析细胞周期变化。
评估UNC13B敲低对细胞凋亡的影响。
通过Annexin V-APC染色和流式细胞术检测凋亡细胞比例。
探究UNC13B敲低对凋亡和细胞周期相关蛋白表达的影响。
通过Western blot检测UNC13B、cleaved-PARP、Bax、p21、PINK1、CDK2、AKR7A3、Bim等蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | 11875-093 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099-141 | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Gibco | 15140-122 | |
| 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | P8833 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher | 15596026CN |
| cDNA合成 | EasyScript第一链cDNA合成超混合试剂盒 | TransGen Biotech | AE301 |
| qPCR | SYBR Green预混液 | Takara | RR820A |
| 增殖检测 | CCK-8试剂 | Solarbio | CA1210 |
| 克隆形成 | 琼脂糖 | Sigma | A5431 |
| 琼脂糖 | Invitrogen | 16500-500 | |
| 细胞周期分析 | 核糖核酸酶A | Solarbio | 9001-99-4 |
| 碘化丙啶 | Sigma | P4170 | |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC | Procell | P-CA-207 |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Abcam | ab102536 |
| 牛血清白蛋白 | Vetec | V900933 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 3683 | |
| UNC13B抗体 | Santa Cruz | sc-136182 | |
| Cleaved-PARP抗体 | CST | 9541 | |
| Bax抗体 | CST | 2772 | |
| p21抗体 | CST | 2947 | |
| PKC-PAN抗体 | CST | 9371 | |
| PINK1抗体 | CST | 6946 | |
| CDK2抗体 | CST | 2546 | |
| AKR7A3抗体 | Abcam | ab227231 | |
| Bim抗体 | CST | 2933 | |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基成分、血清浓度、培养温度和CO2浓度 阅读提示:Methods 2.1 Cell Culture |
| 基因敲低 | shRNA靶序列、载体、筛选药物浓度和时间 阅读提示:Methods 2.2 Cell Transfection and Selection |
| 增殖检测 | 细胞接种密度、检测天数和CCK-8试剂用量 阅读提示:Methods 2.4 Cell Proliferation Assay (CCK-8) |
| 克隆形成 | 软琼脂上下层浓度、细胞接种密度、培养天数 阅读提示:Methods 2.5 Soft Agar Colony Formation Assay 及 Figure 3 legend |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC用量、孵育时间和细胞悬液体积 阅读提示:Methods 2.7 Apoptosis Assay |
| 蛋白检测 | 抗体及其稀释比、内参蛋白、蛋白上样量 阅读提示:Methods 2.8 Western Blotting |