验证8-Nitrotryp对CRC细胞增殖和集落形成的影响
评估8-Nitrotryp对CRC细胞生长抑制的效力及其浓度和时间依赖性。
使用CCK-8法检测不同浓度Tryp和8-Nitrotryp处理24、48、72小时后的细胞活力,计算IC50;使用集落形成实验检测8-Nitrotryp对细胞集落形成能力的影响。
8-Nitrotryptanthrin inhibits colorectal cancer progression via TGF-β/SMAD and PI3K/AKT/mTOR pathways.
包含细胞增殖、集落形成、迁移、MMP、凋亡、蛋白质组学及Western blot验证,但缺乏动物模型和患者样本验证。
HCT116细胞 SW480细胞
细胞系:HCT116(MSI-H)和SW480(MSS) 药物浓度:8-Nitrotryp处理浓度0.5-3 μM 处理时间:细胞活力检测24/48/72小时,迁移及EMT相关蛋白检测48小时 TGF-β1刺激浓度:10 ng/mL 蛋白质组学:HCT116细胞,1 μM 8-Nitrotryp处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估8-Nitrotryp对CRC细胞生长抑制的效力及其浓度和时间依赖性。
使用CCK-8法检测不同浓度Tryp和8-Nitrotryp处理24、48、72小时后的细胞活力,计算IC50;使用集落形成实验检测8-Nitrotryp对细胞集落形成能力的影响。
评估8-Nitrotryp对CRC细胞迁移能力的抑制作用。
使用Transwell迁移实验,细胞处理不同浓度8-Nitrotryp 48小时后,计数迁移到下室的细胞。
评估8-Nitrotryp对线粒体功能和细胞凋亡的影响。
使用JC-1染色检测MMP,并通过流式细胞术分析早期凋亡。
全局分析8-Nitrotryp处理后HCT116细胞蛋白质表达变化,富集相关信号通路。
对对照组和8-Nitrotryp(1 μM)处理的HCT116细胞进行Astral-DIA蛋白质组学测序,分析差异表达蛋白并进行GO和KEGG富集分析。
验证8-Nitrotryp是否通过抑制TGF-β/SMAD通路抑制EMT。
用TGF-β1刺激建立EMT模型,Western blot检测E-cadherin、Slug、SMAD2和磷酸化SMAD2的表达。
验证8-Nitrotryp是否抑制PI3K/AKT/mTOR通路蛋白表达。
Western blot检测PI3K、AKT、mTOR及其磷酸化形式的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Pricella | -- |
| 胎牛血清 | Pricella | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Biosharp | -- | |
| 药物处理 | 转化生长因子-β1 | PeproTech | 100-21 |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 8-硝基色胺酮 | MedChemExpress | -- | |
| 色胺酮 | MedChemExpress | -- | |
| 二甲基亚砜 | Solarbio | -- | |
| Western blot | E-钙黏蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3195 |
| Slug抗体 | Cell Signaling Technology | 9585 | |
| 磷酸化SMAD2抗体 | Cell Signaling Technology | 3108 | |
| SMAD2抗体 | Cell Signaling Technology | 5339 | |
| PI3K抗体 | HUABIO | HA722522 | |
| 磷酸化AKT抗体 | HUABIO | ET1607-73 | |
| AKT抗体 | HUABIO | WL0003b | |
| 磷酸化mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 5536 | |
| mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2972 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Sanying Biotechnology | 66009-1-Ig | |
| 山羊抗兔IgG-HRP | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 山羊抗小鼠IgG-HRP | Sanying | SA00001-1 | |
| Western及IP裂解液 | Beyotime | P0013 | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Solarbio | A8260 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | KeyGEN BioTECH | KGP602 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | KeyGEN BioTECH | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 脱脂奶粉 | Solarbio | D8340 | |
| ECL化学发光试剂盒 | NCM Biotech | P10300 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Biosharp | -- |
| 酶标仪 | BioTek | -- | |
| 细胞迁移检测 | Transwell小室 | Corning | -- |
| MMP检测 | JC-1检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 蛋白质组学 | Astral-DIA蛋白质组学 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:HCT116来自Pricella,SW480来自中国医学科学院基础医学研究所细胞资源中心;培养基为DMEM+10%FBS+1%青链霉素 阅读提示:见 Methods 2.1 |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度5×10^3 cells/well;Tryp浓度25-100 μM,8-Nitrotryp浓度0.5-3 μM;处理时间24,48,72小时 阅读提示:见 Methods 2.3 和 Figure 1 legends |
| 集落形成实验 | 细胞密度500 cells/well;8-Nitrotryp浓度0.5,1,2 μM;处理14天 阅读提示:见 Methods 2.4 和 Figure 1 legends |
| 迁移实验 | 细胞密度2×10^4 cells/well;8-Nitrotryp浓度0.5-2 μM;处理48小时;下室含20% FBS 阅读提示:见 Methods 2.5 和 Figure 2 legends |
| MMP与凋亡检测 | 8-Nitrotryp浓度0.5-2 μM;处理24小时;JC-1染色 阅读提示:见 Methods 2.6 和 Figure 2 legends |
| 蛋白质组学 | HCT116细胞,8-Nitrotryp浓度1 μM,每组3个样本 阅读提示:见 Methods 2.7 和 Figure 3 legends |
| Western blot分析TGF-β/SMAD及EMT | TGF-β1浓度10 ng/mL;8-Nitrotryp浓度1,2 μM;处理48小时 阅读提示:见 Methods 2.8 和 Figure 3 legends |
| Western blot分析PI3K/AKT/mTOR | 8-Nitrotryp浓度0.5,1,2 μM;处理24小时 阅读提示:见 Methods 2.8 和 Figure 3 legends |