检测USP7表达
验证USP7是否在内皮细胞激活和ALI中表达上调
使用TNF-α或LPS处理内皮细胞,检测USP7蛋白和mRNA水平;在LPS诱导的ALI小鼠肺组织中检测USP7表达。
USP7 promotes endothelial activation to aggravate sepsis-induced acute lung injury through PDK1/AKT/NF-κB signaling pathway.
包含细胞模型(HUVECs、HLMECs)、动物模型(LPS诱导的ALI小鼠)、功能验证(敲低/过表达、抑制剂)和机制验证(酵母双杂交、Co-IP、泛素化分析)。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 人肺微血管内皮细胞(HLMECs) LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 HEK293T细胞(用于机制研究)
TNF-α浓度:10 ng/mL LPS浓度:100 ng/mL(体外)和5 mg/kg(体内) USP7抑制剂P22077和GNE-6776的浓度:10 μM和15 μM 动物分组:每组6只,生存曲线每组8只
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证USP7是否在内皮细胞激活和ALI中表达上调
使用TNF-α或LPS处理内皮细胞,检测USP7蛋白和mRNA水平;在LPS诱导的ALI小鼠肺组织中检测USP7表达。
确定USP7对TNF-α诱导的内皮细胞激活的影响
通过慢病毒感染构建USP7过表达或敲低的稳定细胞系,处理TNF-α后检测粘附分子和细胞因子的表达及单核细胞粘附能力。
验证USP7抑制剂能否抑制内皮细胞激活
用USP7抑制剂P22077和GNE-6776预处理内皮细胞,然后TNF-α刺激,检测粘附分子、细胞因子和单核细胞粘附。
评估USP7抑制剂对LPS诱导的ALI的保护作用
小鼠腹腔注射P22077预处理一周,然后LPS诱导ALI,评估生存率、肺水肿、组织学损伤和炎症指标。
阐明USP7与PDK1的相互作用及其对PDK1稳定性的影响
通过酵母双杂交筛选USP7相互作用蛋白,用Co-IP验证与PDK1的相互作用;通过泛素化实验检测USP7对PDK1泛素化水平的影响,并检测下游AKT/NF-κB信号通路。
验证USP7通过PDK1调控内皮细胞激活
在USP7敲低的HUVECs中过表达PDK1,检测粘附分子、细胞因子和单核细胞粘附能力是否恢复。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮细胞培养基 | Sciencell | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | -- | |
| 青霉素/链霉素 | ExCell Bio | -- | |
| 聚乙烯亚胺 | YEASEN | -- | |
| 细胞刺激 | 肿瘤坏死因子-α | PeproTech | -- |
| 脂多糖 | Sigma | -- | |
| 抑制剂处理 | MG132 | Sigma-Aldrich | -- |
| 3-甲基腺嘌呤 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 氯喹 | Sigma-Aldrich | -- | |
| P22077 | MCE | -- | |
| GNE-6776 | MCE | -- | |
| Western blot | USP7抗体 | Proteintech | 66514-1-Ig |
| PDK1抗体 | Proteintech | 18262-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 60009-1-Ig | |
| GFP抗体 | Proteintech | 66002-1-Ig | |
| HA抗体 | Proteintech | 66006-2-Ig | |
| Flag抗体 | Proteintech | 66008-4-Ig | |
| ICAM-1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-1511 | |
| VCAM-1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-13160 | |
| E-选择素抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-14011 | |
| 磷酸化p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4058 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 单核细胞粘附实验 | PKH26荧光染色试剂盒 | MKBio | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | Servicebio | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Life Technologies | -- |
| 逆转录试剂盒 | TakaRa | -- | |
| SYBR Green PCR预混液试剂盒 | Yeasen Scientific | -- | |
| ABI 7500实时荧光定量PCR系统 | ABI | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Neobioscience Technology | -- |
| iMark酶标仪 | Bio-rad | -- | |
| MPO检测 | MPO活性检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| 显微镜观察 | Cytation 3细胞成像多功能微孔板检测仪 | Biotek Instruments | -- |
| 免疫荧光 | Zeiss LSM800共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 内皮细胞类型、培养基、TNF-α浓度10 ng/mL、LPS浓度100 ng/mL、处理时间 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, transfection and lentivirus infection |
| 基因操作 | 慢病毒MOI、shRNA序列、转染试剂PEI 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, transfection and lentivirus infection |
| 抑制剂处理 | P22077浓度10 μM、GNE-6776浓度15 μM、预处理时间24小时 阅读提示:Figure 3 legend |
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、体重、分组(每组6只)、LPS剂量(5 mg/kg和15 mg/kg)、P22077剂量(5 mg/kg和10 mg/kg)、给药途径(i.p.)、预处理时间(一周)、检测时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: Animals, ALI mouse models |
| 分子机制验证 | 酵母双杂交系统、Co-IP条件(抗体量、孵育时间)、泛素化实验(HA-Ub突变体)、抑制剂MG132、CQ、3-MA浓度 阅读提示:Materials and methods: Yeast-two-hybrid, Co-immunoprecipitation; Figure 5 and 6 legends |