高氧暴露BPD动物模型建立与表型分析
建立新生大鼠高氧诱导的BPD模型,并评估肺发育和组织学变化。
将新生SD大鼠分为高氧组(FiO2=0.85)和对照组(FiO2=0.21),在出生后3、7、10、14天收集肺组织,进行HE染色,评估肺泡壁厚度和辐射状肺泡计数。
Glucagon-like peptide-1 receptor signaling activation in alveolar type II cells enhances lung development in neonatal rats exposed to hyperoxia.
包含体内动物模型(高氧暴露、基因敲低/过表达)、体外细胞模型(原代ATII细胞、RLE-6TN细胞)、单细胞测序、功能验证(代谢、线粒体)及机制验证(m6A甲基化、报告基因)。
新生Sprague-Dawley大鼠高氧暴露BPD模型 原代肺泡II型(ATII)细胞 RLE-6TN大鼠II型肺上皮细胞 HEK-293T细胞
高氧暴露浓度(FiO2=0.85)及暴露时间 GLP-1R基因敲低或过表达所用腺病毒滴度(2.5×10^8 PFU/g)及给药方式 原代ATII细胞分离培养条件 RLE-6TN细胞高氧暴露时间(24, 48, 72h) m6A修饰位点及METTL14在RLE-6TN细胞中的敲低效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立新生大鼠高氧诱导的BPD模型,并评估肺发育和组织学变化。
将新生SD大鼠分为高氧组(FiO2=0.85)和对照组(FiO2=0.21),在出生后3、7、10、14天收集肺组织,进行HE染色,评估肺泡壁厚度和辐射状肺泡计数。
检测GLP-1R在出生后不同时间点及胎肺中的表达变化,以及敲低GLP-1R对肺发育的影响。
通过Western blot和RT-qPCR检测肺组织中GLP-1R表达;使用腺病毒敲低GLP-1R,观察肺组织学变化;ELISA检测TGF-β1、VEGF-A、BMP4水平。
确定GLP-1R在肺组织中表达的主要细胞类型,并分析敲低后细胞比例的变化。
对对照组和GLP-1R敲低组的肺组织进行单细胞RNA测序,鉴定细胞类型并分析GLP-1R表达变化。
在细胞水平验证高氧对GLP-1R表达的影响,并探究GLP-1R对细胞凋亡和增殖的作用。
分离原代ATII细胞,培养RLE-6TN细胞,进行高氧暴露,检测GLP-1R表达、细胞活力(CCK-8)和凋亡(流式)。
探究GLP-1R是否通过调节线粒体分裂和糖代谢影响ATII细胞功能。
使用Seahorse分析ECAR和OCR,检测ATP水平,MitoTracker染色观察线粒体形态,Western blot检测DRP1和糖酵解酶表达。
探讨高氧如何通过m6A甲基化修饰调控GLP-1R表达。
在RLE-6TN细胞中,使用MeRIP-qPCR检测GLP-1R mRNA的m6A水平,敲低METTL3、METTL14、WTAP、VIRMA后检测GLP-1R表达,并通过双荧光素酶报告基因验证METTL14对GLP-1R 3'UTR的调控。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 实验动物饲养 | Sprague-Dawley大鼠 | BEIJING HFK BIOSCIENCE CO., Ltd. | -- |
| 细胞培养 | RLE-6TN细胞 | BeNa Culture Collection | BNCC337708 |
| RPMI 1640培养基 | KeyGEN BioTECH | KGM31800-500 | |
| 胎牛血清 | Procell | 164210-50 | |
| DMEM/F12培养基 | KeyGEN BioTECH | KGM12500-500 | |
| 胎牛血清 | Excell | FSP500 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Gibco | 25200056 | |
| I型胶原酶 | Solarbio | C8140 | |
| 细胞活力分析 | 细胞计数试剂盒-8 | MCE | HY-K0301 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC细胞凋亡检测试剂 | Beyotime | C1062 M |
| 流式分析 | CytoFLEX流式细胞仪 | BECKMAN COULTER | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Apebio | K1007 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Apebio | K1015 | |
| 抗GLP-1R小鼠抗体(D-6) | Santa Cruz | sc-390774 | |
| 抗DRP1(D6C7)兔单克隆抗体 | Cell Signalling Technology | 8570 | |
| 抗PFKM多克隆抗体 | Proteintech | 55028-1-AP | |
| 抗己糖激酶2多克隆抗体 | Proteintech | 22029-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白单克隆抗体 | Proteintech | 66009-1-lg | |
| 抗LDHA特异性多克隆抗体 | Proteintech | 19987-1-AP | |
| 二抗 | Proteintech | SA00001-1 | |
| 二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| 增强化学发光试剂 | Tanon | 180-501 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | T9108 |
| RT-qPCR | 逆转录试剂盒 | Accurate Biology | AG11702 |
| qPCR试剂盒 | Accurate Biology | AG11728 | |
| 代谢分析 | Seahorse XF96分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| XF糖酵解压力测试试剂盒 | -- | -- | |
| XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | -- | -- | |
| 线粒体测量 | MitoTracker Red CMXRos | Solarbio | M9940 |
| 成像 | HiS-SIM超分辨显微镜 | Zeiss AG | LSM880 |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | Beyotime | ST025-20g |
| Cy3山羊抗兔IgG (H+L)抗体 | ApeBio | K1209 | |
| Alexa 488山羊抗小鼠IgG (H+L)抗体 | ApeBio | K1204 | |
| DAPI | Boster | AR1176 | |
| 曲拉通 | Solarbio | 9002-93-1 | |
| 抗SFTPC多克隆抗体 | Proteintech | 10774-1-AP | |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0027 |
| 多功能酶标仪 | Biotek | Cytation 5 | |
| ELISA | TGF-β1 ELISA试剂盒 | RUIXIN BIOTECH | -- |
| VEGF-A ELISA试剂盒 | RUIXIN BIOTECH | -- | |
| BMP4 ELISA试剂盒 | RUIXIN BIOTECH | -- | |
| 单细胞RNA测序 | 多组织解离试剂盒2 | Miltenyi Biotec | -- |
| 红细胞去除试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-094-183 | |
| 死细胞去除试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-109-398 | |
| 细胞分析仪 | Countstar | Rigel S2 | |
| SeekOne数字液滴单细胞3文库制备试剂盒 | SeekGene | -- | |
| 测序平台 | Illumina | NovaSeq 6000 | |
| 测序平台 | MGI Tech Co., Ltd. | DNBSEQ-T7 | |
| MeRIP-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Fisher Scientific Inc. | OneC | |
| Qubit RNA宽范围检测试剂盒 | Life Technologies | Q10210 | |
| VAHTS mRNA捕获磁珠 | VAHTS | N401-01/02 | |
| 抗m6A抗体 | Synaptic Systems | 202203 | |
| KC-Digital链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Wuhan Seqhealth Co., Ltd. | DR08502 | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | psiCHECK2载体 | -- | -- |
| LipoFiter 3.0转染试剂 | HANBIO | -- | |
| pCDNA3.1-METTL14质粒 | -- | -- | |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Yeasen Biotechnology | -- | |
| 细胞培养 | HEK-293T细胞 | BOSTER | CX0001 |
| 基因敲低/过表达 | 腺病毒 | HANBIO | AD24050812 |
| 腺病毒 | HANBIO | AD23032206 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 高氧动物模型 | 高氧暴露浓度(85% O2),暴露起始时间(出生后12小时内),暴露持续时间(3、7、10、14天),对照组(21% O2),母鼠交换频率(每24小时),CO2控制方法(钠石灰),湿度控制(硅胶),光周期(12小时昼夜循环)。 阅读提示:Materials and methods, section 2.2 |
| ATII细胞分离与培养 | 大鼠年龄(出生后3-14天),消化液(0.25%胰蛋白酶-EDTA),消化时间(25分钟),胶原酶I浓度(0.1%),纯化方法(IgG包被板差速贴壁),培养条件(DMEM/F12,10% FBS,37°C,5% CO2)。 阅读提示:Materials and methods, section 2.4 |
| 细胞高氧模型 | 细胞密度(70-80%融合),高氧浓度(85% O2),暴露时间(24、48、72小时),培养条件(RPMI 1640,10% FBS,5% CO2)。 阅读提示:Materials and methods, section 2.5 |
| 动物基因敲低/过表达 | 腺病毒滴度(2.5×10^8 PFU/g),给药方式(滴鼻),给药时间(出生后第4天),病毒吸入确认方法。 阅读提示:Results sections 3.2, 3.4 |
| 代谢通量分析 | 细胞接种密度(ATII细胞10000细胞/孔,RLE-6TN细胞5000细胞/孔),检测液成分(Seahorse XF DEME培养基、谷氨酰胺等),药物浓度(葡萄糖10 mM,寡霉素1 μM,2-DG 50 mM;寡霉素1.5 μM,FCCP 0.5 μM,Rot/AA 0.5 μM)。 阅读提示:Materials and methods, section 2.10 |
| m6A修饰检测 | RLE-6TN细胞高氧暴露时间(48小时),MeRIP-qPCR方法,siRNA敲低METTL3、METTL14、WTAP、VIRMA的转染条件,荧光素酶报告基因实验的转染和检测细节。 阅读提示:Methods sections 2.15, 2.16 |